Kim Sneppen

Kim Sneppen

Professor


  1. 2024
  2. Udgivet

    The dynamics of phage predation on a microcolony

    Eriksen, R. S., Larsen, Frej Andreas Nøhr, Svenningsen, Sine Lo, Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 2024, I: Biophysical Journal. 123, 2, s. 147-156 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  3. 2023
  4. Udgivet

    The counterintuitive implications of superspreading diseases

    Nielsen, B. F., Sneppen, Kim & Simonsen, L., 31 okt. 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 3 s., 6954.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Epigenetic switching with asymmetric bridging interactions

    Skjegstad, L. E. J., Nickels, Jan Fabio, Sneppen, Kim & Kirkegaard, Julius Bier, 20 jun. 2023, I: Biophysical Journal. 122, 12, s. 2421-2429 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Tradeoff between speed and reproductive number in pathogen evolution

    Eilersen, A. T., Nielsen, Bjarke Frost & Sneppen, Kim, 12 jun. 2023, I: Physical Review Research. 5, 2, 8 s., 023003.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Sustainable diversity of phage-bacteria systems

    Mitarai, Namiko, Marantos, Anastasios & Sneppen, Kim, 1 jun. 2023, I: Current Opinion in Systems Biology. 35, 6 s., 100468.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Host heterogeneity and epistasis explain punctuated evolution of SARS-CoV-2

    Nielsen, Bjarke Frost, Saad-roy, C. M., Li, Y., Sneppen, Kim, Simonsen, L., Viboud, C., Levin, S. A., Grenfell, B. T. & Morozov, A. V. (red.), 15 feb. 2023, I: PLOS Computational Biology. 19, 2, 24 s., e1010896.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Jag1-Notch cis-interaction determines cell fate segregation in pancreatic development

    sgk681, sgk681, Seymour, Philip Allan, Sneppen, Kim, Trusina, Ala, Egeskov-Madsen, A. L. R., Jørgensen, Mette Christine, Jensen, Mogens Høgh & Serup, Palle, 2023, I: Nature Communications. 14, 17 s., 348.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  10. 2022
  11. Udgivet

    Emerging diversity in a population of evolving intransitive dice

    Kirkegaard, Julius Bier & Sneppen, Kim, 17 nov. 2022, I: Physical Review E. 106, 5, 6 s., 054409.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Lockdowns exert selection pressure on overdispersion of SARS-CoV-2 variants

    Nielsen, Bjarke Frost, Eilersen, A., Simonsen, L. & Sneppen, Kim, 2 sep. 2022, I: Epidemics. 40, 7 s., 100613.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  13. Udgivet

    From kill the winner to eliminate the winner in open phage-bacteria systems

    Marantos, Anastasios, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 8 aug. 2022, I: PLOS Computational Biology. 18, 8, 15 s., e1010400.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Pancreatic alpha and beta cells are globally phase-locked

    Ren, H., Li, Y., Han, C., Yu, Y., Shi, B., Peng, X., Wu, S., Yang, X., Sneppen, Kim, Chen, L., Tang, C. & Zhang, T., 28 jun. 2022, I: Nature Communications. 13, 1, 16 s., 3721.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Protection of bacteriophage-sensitive Escherichia coli by lysogens

    Brown, Stanley, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 2 apr. 2022, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 119, 4, e2106005119.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Spatial model of Ebola outbreaks contained by behavior change

    Halvorsen, G. S., Simonsen, L. & Sneppen, Kim, 14 mar. 2022, I: Plos One. 17, 3, 11 s., e0264425.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Emergence of networks of shared restriction-modification systems in phage-bacteria ecosystems

    Eriksen, R. S., Malhotra, N., Seshasayee, A. S. N., Sneppen, Kim & Krishna, S., 2022, I: Journal of Biosciences. 47, 3, 19 s., 38.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  18. Udgivet

    The transcription factor Atf1 lowers the transition barrier for nucleosome-mediated establishment of heterochromatin

    Nickels, Jan Fabio, Della-Rosa, M. E., Miguelez Goyeneche, I., Charlton, Sebastian Jespersen, Sneppen, Kim & Thon, Genevieve, 2022, I: Cell Reports. 39, 7, 17 s., 110828.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  19. 2021
  20. Udgivet

    Superspreading quantified from bursty epidemic trajectories

    Kirkegaard, Julius Bier & Sneppen, Kim, 16 dec. 2021, I: Scientific Reports. 11, 1, 7 s., 24124.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Differences in social activity increase efficiency of contact tracing

    Nielsen, Bjarke Frost, Sneppen, Kim, Simonsen, L. & Mathiesen, Joachim, 2 okt. 2021, I: European Physical Journal B. 94, 10, 11 s., 209.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  22. Udgivet

    The COVID-19 pandemic: key considerations for the epidemic and its control

    Ørskov, S., Nielsen, Bjarke Frost, Føns, S., Sneppen, Kim & Simonsen, L., jul. 2021, I: APMIS. 129, 7, s. 408-420 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Superspreading of airborne pathogens in a heterogeneous world

    Kirkegaard, Julius Bier, Mathiesen, Joachim & Sneppen, Kim, 27 maj 2021, I: Scientific Reports. 11, 1, 9 s., 11191.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Establishment of heterochromatin in domain-size-dependent bursts

    Nickels, Jan Fabio, Edwards, A. K., Charlton, Sebastian Jespersen, Mortensen, A. M., Hougaard, S. C. L., Trusina, Ala, Sneppen, Kim & Thon, Genevieve, 13 apr. 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 15, 11 s., e2022887118.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Overdispersion in COVID-19 increases the effectiveness of limiting nonrepetitive contacts for transmission control

    Sneppen, Kim, Nielsen, Bjarke Frost, Taylor, R. J. & Simonsen, L., 6 apr. 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 14, 6 s., 2016623118.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  26. Udgivet

    COVID-19 superspreading suggests mitigation by social network modulation

    Nielsen, Bjarke Frost, Simonsen, L. & Sneppen, Kim, 15 mar. 2021, I: Physical Review Letters. 126, 6 s., 118301.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterfagfællebedømt

  27. Udgivet

    SARS-CoV-2 superspreading in cities vs the countryside

    Eilersen, A. T. & Sneppen, Kim, 23 feb. 2021, I: A P M I S. Acta Pathologica, Microbiologica et Immunologica Scandinavica. 129, 7, s. 401-407 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Social contagion in a world with asymmetric influence

    Halvorsen, G. S., Pedersen, B. N. & Sneppen, Kim, 3 feb. 2021, I: Physical Review E. 103, 2, 5 s., 022303.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Variability of Individual Infectiousness Derived from Aggregate Statistics of COVID-19

    Kirkegaard, Julius Bier & Sneppen, Kim, 15 jan. 2021, I: medRxiv : the preprint server for health sciences. 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  30. 2020
  31. Udgivet

    On Phage Adsorption to Bacterial Chains

    Eriksen, R. S., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 3 nov. 2020, I: Biophysical Journal. 119, 9, s. 1896-1904 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Cost-benefit of limited isolation and testing in COVID-19 mitigation

    Eilersen, A. & Sneppen, Kim, 29 okt. 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, 7 s., 18543.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Airborne Pathogens in a Heterogeneous World: Superspreading & Mitigation

    Kirkegaard, Julius Bier, Mathiesen, Joachim & Sneppen, Kim, 27 okt. 2020, I: medRxiv : the preprint server for health sciences. 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikel

  34. Udgivet

    Hitchhiking, collapse, and contingency in phage infections of migrating bacterial populations

    Ping, D., Wang, T., Fraebel, D. T., Maslov, S., Sneppen, Kim & Kuehn, S., 1 aug. 2020, I: ISME Journal. 14, 8, s. 2007-2018 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  35. Udgivet

    The uneasy coexistence of predators and pathogens

    Eilersen, A. T. & Sneppen, Kim, 2 jul. 2020, I: The European Physical Journal E: Soft Matter and Biological Physics. 43, 7, 7 s., 42.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Repression of the lysogenic PR promoter in bacteriophage TP901-1 through binding of a CI-MOR complex to a composite OM-OR operator

    Pedersen, M., Neergaard, J. T., Cassias, J., Rasmussen, K. K., Lo Leggio, Leila, Sneppen, Kim, Hammer, K. & Kilstrup, M., 26 maj 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, 13 s., 8659.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Optimal Transport Flows for Distributed Production Networks

    Kirkegaard, Julius Bier & Sneppen, Kim, 22 maj 2020, I: Physical Review Letters. 124, 20, 5 s., 208101.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Chaos in disease outbreaks among prey

    Eilersen, A. T., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 3 mar. 2020, I: Scientific Reports. 10, 7 s., 3907.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Modelling value bubbles in an attention based economy

    Toftdahl Olesen, C. & Sneppen, Kim, 2 mar. 2020, I: European Physical Journal B. 93, 3, 5 s., 36.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Model to Link Cell Shape and Polarity with Organogenesis

    Nielsen, Bjarke Frost, Nissen, Silas Boye, Sneppen, Kim, Mathiesen, Joachim & Trusina, Ala, 10 jan. 2020, I: iScience. 23, 2, s. 1-10 10 s., 100830.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Kronik: Risikobaseret genåbning af Danmark kan give færre alvorligt syge og en hurtigere genåbning

    Kirkeby, Carsten, Græsbøll, K., Halasa, T., Sneppen, Kim & Christiansen, L. E., 2020, I: Ingenøren.dk.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikel

  42. Udgivet

    Sustainability of spatially distributed bacteria-phage systems

    Eriksen, R. S., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, s. 1-12 3154.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  43. 2019
  44. Udgivet

    Regime Shifts in a Phage-Bacterium Ecosystem and Strategies for Its Control

    Maslov, S. & Sneppen, Kim, 1 nov. 2019, I: mSystems. 5, 4(6), e00470-19.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Self-assembly, buckling and density-invariant growth of three-dimensional vascular networks

    Kirkegaard, Julius Bier, Nielsen, Bjarke Frost, Trusina, Ala & Sneppen, Kim, 31 okt. 2019, I: Journal of the Royal Society. Interface. 16, 159, 8 s., 20190517.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Theoretical analysis of Polycomb-Trithorax systems predicts that poised chromatin is bistable and not bivalent

    Sneppen, Kim & Ringrose, L., 13 maj 2019, I: Nature Communications. 10, 18 s., 2133.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Applying allometric scaling to predator-prey systems

    Eilersen, A. & Sneppen, Kim, 8 feb. 2019, I: Physical Review E. 99, 2, 8 s., 022405.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Exploring the contribution of exposure heterogeneity to the cessation of the 2014 Ebola epidemic

    Uekermann, F., Simonsen, L. & Sneppen, Kim, 1 feb. 2019, I: PLoS ONE. 14, 2, 11 s., e0210638.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Multi stability and global bifurcations in epidemic model with distributed delay SIRnS-model

    Jensen, G. G., Uekermann, F. & Sneppen, Kim, 1 feb. 2019, I: European Physical Journal B. 92, 2, 28.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Fast Translation within the First 45 Codons Decreases mRNA Stability and Increases Premature Transcription Termination in E. coli

    Pedersen, Steen, Terkelsen, Thilde Bagger, Eriksen, M., Hauge, M. K., Lund, C. C., Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 2019, I: Journal of Molecular Biology. 431, 6, s. 1088-1097 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  51. 2018
  52. Udgivet

    Theoretical tool bridging cell polarities with development of robust morphologies

    Nissen, Silas Boye, Rønhild, S., Trusina, Ala & Sneppen, Kim, 27 nov. 2018, I: eLife. 7, 25 s., e38407.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  53. Udgivet

    Globalization in a nutshell

    Sneppen, Kim & Bornholdt, S., 29 okt. 2018, I: Physical Review E. 98, 4, 6 s., 022314.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  54. Udgivet

    Theory of invasion extinction dynamics in minimal food webs

    Härter, Jan Olaf Mirko, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 12 feb. 2018, I: Physical Review E. 97, 2, 10 s., 022404.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  55. Udgivet

    Exploring the Link between Nucleosome Occupancy and DNA Methylation

    Lövkvist, Cecilia, Sneppen, Kim & Härter, Jan Olaf Mirko, 12 jan. 2018, I: Frontiers in Genetics. 8, 7 s., 232.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  56. Udgivet

    A growing microcolony can survive and support persistent propagation of virulent phages

    Eriksen, R. S., Svenningsen, Sine Lo, Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 1 jan. 2018, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 115, 2, s. 337-342

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

  57. Udgivet

    Deconstructing the principles of ductal network formation in the pancreas

    Dahl-Jensen, Svend Bertel, Yennek, S., Flasse, L., Larsen, Hjalte List, Sever, D., Karremore, G., Novak, Ivana, Sneppen, Kim & Botton, A., 2018, I: PLOS Biology. 16, 7, 25 s., e2002842.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelfagfællebedømt

Forrige 1 2 3 4 5 Næste

ID: 10093