Weria Pezeshkian
Adjunkt
Biokompleksitet
Blegdamsvej 17
2100 København Ø
- 2024
- Udgivet
Mesoscale simulation of biomembranes with FreeDTS
Pezeshkian, Weria & Ipsen, J. H., 16 jan. 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 10 s., 548.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bending of a lipid membrane edge by annexin A5 trimers
Pandey, M. P., Telles de Souza, P. C., Pezeshkian, Weria & Khandelia, H., 2024, I: Biophysical Journal. 123, 8, s. 1006-1014 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2023
- Udgivet
Inferring mechanical properties of the SARS-CoV-2 virus particle with nano-indentation tests and numerical simulations
Nonn, A., Kiss, B., Pezeshkian, Weria, Tancogne-Dejean, T., Cerrone, A., Kellermayer, M., Bai, Y., Li, W. & Wierzbicki, T., 8 okt. 2023, I: Journal of the Mechanical Behavior of Biomedical Materials. 148, 15 s., 106153.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Molecular architecture and dynamics of SARS-CoV-2 envelope by integrative modeling
Pezeshkian, Weria, Grunewald, F., Narykov, O., Lu, S., Arkhipova, V., Solodovnikov, A., Wassenaar, T. A., Marrink, S. J. & Korkin, D., 6 apr. 2023, I: Structure. 31, 4, s. 492-50 20 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Mesoscale simulations: an indispensable approach to understand biomembranes
Duncan, A. & Pezeshkian, Weria, 21 feb. 2023, I: Biophysical Journal. 122, 11, s. 1883-1889 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Close, but not too close: a mesoscopic description of (a)symmetry and membrane shaping mechanisms
Thusgaard Ruhoff, Victoria, Bendix, Poul Martin & Pezeshkian, Weria, 16 jan. 2023, I: Emerging topics in life sciences. 7, 1, s. 81-93 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Annexin proteins involved in plasma membrane repair reshape a membrane edge: Direct evidence from molecular simulations
Pandey, M. P., Pezeshkian, Weria & Khandelia, H., 2023, I: Biophysical Journal. 122, 3S1, s. 323a 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt
- 2022
- Udgivet
Synthetic Membrane Shaper for Controlled Liposome Deformation
De Franceschi, N., Pezeshkian, Weria, Fragasso, A., Bruininks, B. M. H., Tsai, S., Marrink, S. J. & Dekker, C., 28 nov. 2022, I: ACS Nano. 17, s. 966-978 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Martini 3 Coarse-Grained Force Field for Carbohydrates
Grünewald, F., Punt, M. H., Jefferys, E. E., Vainikka, P., König, M., Virtanen, V., Meyer, T. A., Pezeshkian, Weria, Gormley, A., Karonen, M., Sansom, M. S. P., Souza, P. C. T. & Marrink, S., 7 nov. 2022, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 18, 12, s. 7555-7569 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Strength in numbers: effect of protein crowding on the shape of cell membranes
Thusgaard Ruhoff, Victoria, Moreno Pescador, Guillermo Sergio, Pezeshkian, Weria & Bendix, Poul Martin, 31 okt. 2022, I: Biochemical Society Transactions. 50, 5, s. 1257-1267 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Coarse-grained simulations of curvature induced lipid sorting in complex membranes
Konig, M., Pezeshkian, Weria & Marrink, S. J., 2022, I: Biophysical Journal. 121, 3, s. 309A-309A 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2021
- Udgivet
A synthetic membrane shaper for controlled liposome deformation
Pezeshkian, Weria, 23 dec. 2021, I: bioRxiv.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
- Udgivet
Molecular architecture of SARS-CoV-2 envelope by integrative modeling
Pezeshkian, Weria, 15 sep. 2021, I: bioRxiv.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
Capturing Membrane Phase Separation by Dual Resolution Molecular Dynamics Simulations
Liu, Y., de Vries, A. H., Pezeshkian, Weria & Marrink, S. J., 14 sep. 2021, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 17, 9, s. 5876-5884 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Simulating realistic membrane shapes
Pezeshkian, Weria & Marrink, S. J., 1 aug. 2021, I: Current Opinion in Cell Biology. 71, s. 103-111 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
Computational Approaches to Explore Bacterial Toxin Entry into the Host Cell
Pezeshkian, Weria, Shillcock, J. C. & Ipsen, J. H., 28 jul. 2021, I: Toxins. 13, 7, 9 s., 449.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
Long chain sphingomyelin depletes cholesterol from the cytoplasmic leaflet in asymmetric lipid membranes
Karlsen, M. L., Bruhn, D. S., Pezeshkian, Weria & Khandelia, H., 8 jul. 2021, I: RSC Advances. 11, 37, s. 22677-22682 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Ceramide structure dictates glycosphingolipid nanodomain assembly and function
Arumugam, S., Schmieder, S., Pezeshkian, Weria, Becken, U., Wunder, C., Chinnapen, D., Ipsen, J. H., Kenworthy, A. K., Lencer, W., Mayor, S. & Johannes, L., 16 jun. 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 12 s., 3675.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Creasing of flexible membranes at vanishing tension
Pezeshkian, Weria & Ipsen, J. H., 16 apr. 2021, I: Physical Review E. 103, 4, 5 s., 041001.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Annexin A4 trimers are recruited by high membrane curvatures in giant plasma membrane vesicles
Florentsen, C. D., Kamp-Sonne, A., Moreno Pescador, Guillermo Sergio, Pezeshkian, Weria, Hakami Zanjani, A. A., Khandelia, H., Nylandsted, J. & Bendix, Poul Martin, 2021, I: Soft Matter. 17, 2, s. 308-318 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2020
Coupling Coarse-Grained to Fine-Grained Models via Hamiltonian Replica Exchange
Liu, Y., Pezeshkian, Weria, Barnoud, J., de Vries, A. H. & Marrink, S. J., 11 aug. 2020, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 16, 8, s. 5313-5322 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Dual Resolution Membrane Simulations Using Virtual Sites
Liu, Y., De Vries, A. H., Barnoud, J., Pezeshkian, Weria, Melcr, J. & Marrink, S. J., 14 maj 2020, I: Journal of Physical Chemistry B. 124, 19, s. 3944-3953 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Backmapping triangulated surfaces to coarse-grained membrane models
Pezeshkian, Weria, Konig, M., Wassenaar, T. A. & Marrink, S. J., 8 maj 2020, I: Nature Communications. 11, 1, 9 s., 2296.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2019
Fluctuations and conformational stability of a membrane patch with curvature inducing inclusions
Pezeshkian, Weria & Ipsen, J. H., 28 dec. 2019, I: Soft Matter. 15, 48, s. 9974-9981 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
A Multi-Scale Approach to Membrane Remodeling Processes
Pezeshkian, Weria, Konig, M., Marrink, S. J. & Ipsen, J. H., 23 jul. 2019, I: Frontiers in Molecular Biosciences. 6, 7 s., 59.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 290302154
Flest downloads
-
43
downloads
Strength in numbers: effect of protein crowding on the shape of cell membranes
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
21
downloads
Annexin A4 trimers are recruited by high membrane curvatures in giant plasma membrane vesicles
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
18
downloads
Close, but not too close: a mesoscopic description of (a)symmetry and membrane shaping mechanisms
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet