Kim Sneppen

Kim Sneppen

Professor


  1. Udgivet

    Visualization of large-scale correlations in gene expressions

    Eriksen, K., Hörnquist, M. & Sneppen, Kim, 2004, I: Functional & Integrative Genomics. 4, 4, s. 241-245

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    Searchability of networks

    Rosvall, M., Grönlund, A., Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 2005, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 72, s. 046117

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

  3. Udgivet

    Time Delay as a Key to Apaptosis Induction in the p53 Network

    Tiana, G., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2002, I: European Phys. Journal. vol. B 29, s. 135

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Theoretical analysis of epigenetic cell memory by nucleosome modification

    Dodd, I. B., Micheelsen, M. A., Sneppen, Kim & Thon, Genevieve, 2007, I: Cell. 129, 4, s. 813-22 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    The cost and capacity of signaling in the Escherichia coli proetin reaction network

    Axelsen, J. B., Krishna, S. & Sneppen, Kim, 24 jan. 2008, I: Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. s. P010018

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Komolgorov scaling from random force fields

    Jensen, Mogens Høgh, Sneppen, Kim & Angheluta, L., 2008, I: EPL. 84, 1, s. 10011 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Oscillating gene expressions in regulatory network: Forces, Growth and Form in Soft Condensed Matter: At the Interface between Physics and Biology

    Jensen, Mogens Høgh, Sneppen, Kim & Tiana, G., 2005, I: NATO Science Series : Sub-Series II, Mathematics, Physics and Chemistry. 160, s. 195-202

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Dynamical genetic regulation

    Jensen, Mogens Høgh, Krishna, S., Sneppen, Kim & Tiana, G., 2008, Springer. (Evolution from cellular to social scales, book series: Nato security through science series B: Physics and biophysics.Conference of the Nato-advanced study institute on evolution from cellular to social scales geilo, Norway april 10-20,2007, p.61-68.).

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportBogForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    UV-induced mutagenesis in Escherichia coli SOS response: A quantitative model

    Krishna, S., Maslov, S. & Sneppen, Kim, 2007, I: PLoS Computational Biology. 3, 3, s. 451-462

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Toolbox model of evolution of prokaryotic metabolic networks and their regulation

    Maslov, S., Krishna, S., Pang, T. Y. & Sneppen, Kim, 2009, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 24, s. 9743-9748 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Targeted bacterial immunity buffres phage diversity

    Härter, Jan Olaf Mirko, Trusina, Ala & Sneppen, Kim, 21 aug. 2011, I: Journal of Virology. 85, 20, s. 10554-10560 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Locally self-organized quasicritical percolation in a multiple-disease model

    Juul, J. S. & Sneppen, Kim, 30 sep. 2011, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 84, 3, s. 0036119 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Dominant negative autoregulation limits steady-state repression levels in gene networks

    Semsey, S., Krishna, S., Erdossy, J., Horváth, P., Orosz, L., Sneppen, Kim & Adhya, S., jul. 2009, I: Journal of Bacteriology. 191, 14, s. 4487-91 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Genetic regulation of fluxes: iron homeostasis of Escherichia coli

    Semsey, S., Andersson, A. M. C., Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh, Massé, E. & Sneppen, Kim, 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, 17, s. 4960-7 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Physics in Molecular Biology

    Sneppen, Kim & Zocchi, G., 2005, UK: Cambridge University Press. 319 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportBogForskning

  16. Udgivet

    Three is much more than two in coarsening dynamics of cyclic competitions

    Mitarai, Namiko, Gunnarson, I., Pedersen, B. N., Rosiek, C. A. & Sneppen, Kim, apr. 2016, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 93, 042408.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Population Dynamics of Phage and Bacteria in Spatially Structured Habitats Using Phage lambda and Escherichia coli

    Mitarai, Namiko, Brown, Stanley & Sneppen, Kim, 11 apr. 2016, I: Journal of Bacteriology. 198, 12, s. 1783-1793

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Food Web Assembly Rules for Generalized Lotka-Volterra Equations

    Härter, Jan Olaf Mirko, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, feb. 2016, I: PLoS Computational Biology. 12, 2, e1004727.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Self-organization of structures and networks from merging and small-scale fluctuations

    Minnhagen, P., Rosvall, M., Sneppen, Kim & Trusina, Ala, 15 sep. 2004, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 340, 4, s. 725-732

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Kronik: Risikobaseret genåbning af Danmark kan give færre alvorligt syge og en hurtigere genåbning

    Kirkeby, Carsten, Græsbøll, K., Halasa, T., Sneppen, Kim & Christiansen, L. E., 2020, I: Ingenøren.dk.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelFormidling

  21. Udgivet

    Social contagion in a world with asymmetric influence

    Halvorsen, G. S., Pedersen, B. N. & Sneppen, Kim, 3 feb. 2021, I: Physical Review E. 103, 2, 5 s., 022303.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Establishment of heterochromatin in domain-size-dependent bursts

    Nickels, Jan Fabio, Edwards, A. K., Charlton, Sebastian Jespersen, Mortensen, A. M., Hougaard, S. C. L., Trusina, Ala, Sneppen, Kim & Thon, Genevieve, 13 apr. 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 15, 11 s., e2022887118.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    On Phage Adsorption to Bacterial Chains

    Eriksen, R. S., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 3 nov. 2020, I: Biophysical Journal. 119, 9, s. 1896-1904 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Severe population collapses and species extinctions in multihost epidemic dynamics

    Maslov, S. & Sneppen, Kim, 22 aug. 2017, I: Physical Review E. 96, 2, 022412.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Optimal Transport Flows for Distributed Production Networks

    Kirkegaard, Julius Bier & Sneppen, Kim, 22 maj 2020, I: Physical Review Letters. 124, 20, 5 s., 208101.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    COVID-19 superspreading suggests mitigation by social network modulation

    Nielsen, Bjarke Frost, Simonsen, L. & Sneppen, Kim, 15 mar. 2021, I: Physical Review Letters. 126, 6 s., 118301.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    From kill the winner to eliminate the winner in open phage-bacteria systems

    Marantos, Anastasios, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 8 aug. 2022, I: PLOS Computational Biology. 18, 8, 15 s., e1010400.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Host heterogeneity and epistasis explain punctuated evolution of SARS-CoV-2

    Nielsen, Bjarke Frost, Saad-roy, C. M., Li, Y., Sneppen, Kim, Simonsen, L., Viboud, C., Levin, S. A., Grenfell, B. T. & Morozov, A. V. (red.), 15 feb. 2023, I: PLOS Computational Biology. 19, 2, 24 s., e1010896.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Variability of Individual Infectiousness Derived from Aggregate Statistics of COVID-19

    Kirkegaard, Julius Bier & Sneppen, Kim, 15 jan. 2021, I: medRxiv : the preprint server for health sciences. 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Collaboration between CpG sites is needed for stable somatic inheritance of DNA methylation states

    Härter, Jan Olaf Mirko, Lövkvist, Cecilia, Dodd, I. B. & Sneppen, Kim, 1 feb. 2014, I: Nucleic Acids Research. 42, 4, s. 2235-2244

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Spiky oscillations in NF-KB signalling

    Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2005, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 103, s. 10840-10845

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Scaling in fracture and refreezing of sea ice

    Sneppen, Kim & Hansen, A. G., 2004, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 331, s. 291-296

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Robustness of the Right Operator in Bacteriophage µ

    Metzler, R., Bakk, A. & Sneppen, Kim, 2004, I: Biophysical Journal. 86, s. 58-66

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Specificity and Stability in Topology of Protein Networks

    Sneppen, Kim, 2002, I: Kexue (Shanghai). vol. 296, s. 910-256

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Oscillations and temporal signalling in cells

    Tiana, G., Krishna, S., Pigolotti, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2008, I: Physical Biology. 4, 2, s. R1-R17

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Efficient chromosomal-scale DNA looping in Escherichia coli using multiple DNA-looping elements

    Hao, N., Sneppen, Kim, Shearwin, K. E. & Dodd, I. B., 19 maj 2017, I: Nucleic Acids Research. 45, 9, s. 5074-5085

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Gene duplication models for directed networks with limits on growth

    Enemark, J. & Sneppen, Kim, 2008, I: Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. 2007, s. P11007

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Combinatorics of feedback in cellular uptake and metabolism of small molecules

    Krishna, S., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2007, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 52, s. 20815-20819

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Economy of operon formation: cotranscription minimizes shortfall in protein complexes

    Sneppen, Kim, Pedersen, Steen, Krishna, S., Dodd, I. B. & Semsey, S., 21 sep. 2010, I: Microbe. 1, 4, s. e00177-10

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Structural correlations in bacterial metabolic networks

    Gerlee, P. D. M., Bernhardsson, P. J. S., Lizana, G. L. & Sneppen, Kim, 1 jun. 2010, I: FEBS Journal. 277, Suppl. 1, s. 114-114 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

  41. Udgivet

    Theory for the stability and regulation of epigenetic landscapes

    Micheelsen, M. A., Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Dodd, I. B., 4 jun. 2010, I: Physical Biology. 7, 2, s. 026010 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Minimal Gene Regulatory Circuits that Can Count like Bacteriophage Lambda

    Avlund, M., Dodd, I. B., Sneppen, Kim & Krishna, S., 11 dec. 2009, I: Journal of Molecular Biology. 394, 4, s. 681-693

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Specific contacts of the -35 region of the galP1 promoter by RNA polymerase inhibit GalR-mediated DNA looping repression

    Csiszovszki, Z., Lewis, D. E. A., Le, P., Sneppen, Kim & Semsey, S., 1 nov. 2012, I: Nucleic Acids Research. 40, 20, s. 10064-10072 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Well-temperate phage: optimal bet-hedging against local environmental collapses

    Maslov, S. & Sneppen, Kim, 2 jun. 2015, I: Scientific Reports. 5, 10523.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    A cross-immunization model for the extinction of old influenza strains

    Uekermann, F. & Sneppen, Kim, 2016, I: Scientific Reports. 6, 8 s., 25907.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Diversity Waves in Collapse-Driven Population Dynamics

    Maslov, S. & Sneppen, Kim, 1 sep. 2015, I: P L o S One. 11, 9, e1004440.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Degree landscapes in scale-free networks

    Axelsen, J. B., Bernhardsson, S., Rosvall, M., Sneppen, Kim & Trusina, Ala, sep. 2006, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 74, 3

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Cost-benefit of limited isolation and testing in COVID-19 mitigation

    Eilersen, Andreas Thomas & Sneppen, Kim, 29 okt. 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, 7 s., 18543.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Four simple rules that are sufficient to generate the mammalian blastocyst

    Nissen, Silas Boye, Perera Pérez, Marta, Martin Gonzalez, Javier, Morgani, S. M. C., Jensen, Mogens Høgh, Sneppen, Kim, Brickman, Joshua Mark & Trusina, Ala, 12 jul. 2017, I: PLOS Biology. 15, 7, s. 1-30 e2000737.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Sustainability of spatially distributed bacteria-phage systems

    Eriksen, R. S., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, s. 1-12 3154.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 10093