Ala Trusina

Ala Trusina

Lektor


  1. Udgivet

    Degree landscapes in scale-free networks

    Axelsen, J. B., Bernhardsson, S., Rosvall, M., Sneppen, Kim & Trusina, Ala, sep. 2006, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 74, 3

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    Dynamics of the DNA repair proteins WRN and BLM in the nucleoplasm and nucleoli

    Bendtsen, K. M., Jensen, M. B., May, A., Rasmussen, Lene Juel, Trusina, Ala, Bohr, Vilhelm & Jensen, Mogens Høgh, 14 nov. 2014, I: European Biophysics Journal. 43, 10-11, s. 509-516

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Fragile DNA Repair Mechanism Reduces Ageing in Multicellular Model

    Bendtsen, K. M., Juul, J. S. & Trusina, Ala, 2 maj 2012, I: P L o S One. 7, 5, s. e36018

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Conditional Cooperativity in Toxin-Antitoxin Regulation Prevents Random Toxin Activation and Promotes Fast Translational Recovery

    Cataudella, I., Trusina, Ala, Sneppen, Kim, Gerdes, K. & Mitarai, Namiko, 11 apr. 2012, I: Nucleic Acids Research. 40, 14, s. 6424-6434

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Evolution of a G protein-coupled receptor response by mutations in regulatory network interactions

    Di Roberto, R. B., Chang, B., Trusina, Ala & Peisajovich, S. G., 4 aug. 2016, I: Nature Communications. 7, 12344.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Noisy transcription factor NF-¿B oscillations stabilize and sensitize cytokine signaling in space

    Gangstad, S. W., Feldager, C. W., Juul, J. S. & Trusina, Ala, 5 feb. 2013, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 87, 2, s. 022702

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Prisoners' dilemma in real-world acquaintance networks: Spikes and quasiequilibria induced by the interplay between structure and dynamics

    Holme, P., Trusina, Ala, Kim, B. & Minnhagen, P., sep. 2003, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 68, 3

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Impact of Zygosity on Bimodal Phenotype Distributions

    Holst-Hansen, T., Abad, E., Muntasell, A., López-Botet, M., Jensen, Mogens Høgh, Trusina, Ala & Garcia-Ojalvo, J., 11 jul. 2017, I: Biophysical Journal. 113, 1, s. 148-156 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Targeted bacterial immunity buffres phage diversity

    Härter, Jan Olaf Mirko, Trusina, Ala & Sneppen, Kim, 21 aug. 2011, I: Journal of Virology. 85, 20, s. 10554-10560 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Chaperone-mediated reflux of secretory proteins to the cytosol during endoplasmic reticulum stress

    Igbaria, A., Merksamer, P. I., Trusina, Ala, Tilahun, F., Johnson, J. R., Brandman, O., Krogan, N. J., Weissman, J. S. & Papa, F. R., 1 jan. 2019, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 166, 23, s. 11291-11298 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Two portable recombination enhancers direct donor choice in fission yeast heterochromatin

    Jakociunas, T., Holm, L. R., Hansen, J. V., Trusina, Ala & Thon, Genevieve, 2013, I: P L o S Genetics. 9, 10, 14 s., e1003762.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Dynamic instabilities induced by asymmetric influence: Prisoners' dilemma game in small-world networks

    Kim, B., Trusina, Ala, Holme, P., Minnhagen, P., Chung, J. & Choi, M., aug. 2002, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 66, 2, 021907.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Self-assembly, buckling and density-invariant growth of three-dimensional vascular networks

    Kirkegaard, Julius Bier, Nielsen, Bjarke Frost, Trusina, Ala & Sneppen, Kim, 31 okt. 2019, I: Journal of the Royal Society. Interface. 16, 159, 8 s., 20190517.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Stochastic priming and spatial cues orchestrate heterogeneous clonal contribution to mouse pancreas organogenesis

    Larsen, Hjalte List, Martin-Coll, L., Nielsen, Alexander Valentin, Wright, C. V. E., Trusina, Ala, Kim, Y. H. & Grapin-Botton, A., 19 sep. 2017, I: Nature Communications. 8, 605.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    IRE1 alpha Induces Thioredoxin-Interacting Protein to Activate the NLRP3 Inflammasome and Promote Programmed Cell Death under Irremediable ER Stress

    Lerner, A. G., Upton, J., Praveen, P. V. K., Ghosh, R., Nakagawa, Y., Igbaria, A., Shen, S., Nguyen, V., Bradley, B. J., Heiman, M. & Trusina, Ala, 8 aug. 2012, I: Cell Metabolism. 16, 2, s. 250-264 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Defining Network Topologies that Can Achieve Biochemical Adaptation

    Ma, W., Trusina, Ala, El-Samad, H., Lim, W. A. & Tang, C., 21 aug. 2009, I: Cell. 138, 4, s. 760-773

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Circuit architecture explains functional similarity of bacterial heat shock responses

    Masayo, I., Mitarai, Namiko & Trusina, Ala, 1 dec. 2012, I: Physical Biology. 9, 6, s. 066003

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Ecosystems with Mutually Exclusive Interactions Self-Organize to a State of High Diversity

    Mathiesen, Joachim, Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Trusina, Ala, 25 okt. 2011, I: Physical Review Letters. 107, 18, s. 188101

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Nested feedback loops in gene regulation

    Mengel, A. B., Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh & Trusina, Ala, 1 jan. 2012, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 391, 1-2, s. 100-106

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Modeling oscillatory control in NF-¿B, p53 and Wnt signaling

    Mengel, B., Hunziker, A., Pedersen, L., Trusina, Ala, Jensen, Mogens Høgh & Krishna, S., 1 dec. 2010, I: Current Opinion in Genetics & Development. 20, 6, s. 656-64 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Real-time redox measurements during endoplasmic reticulum stress reveal interlinked protein folding functions

    Merksamer, P., Trusina, Ala & Papa, F., 20 nov. 2008, I: Cell. 135, 5, s. 933-947

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Self-organization of structures and networks from merging and small-scale fluctuations

    Minnhagen, P., Rosvall, M., Sneppen, Kim & Trusina, Ala, 15 sep. 2004, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 340, 4, s. 725-732

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Establishment of heterochromatin in domain-size-dependent bursts

    Nickels, Jan Fabio, Edwards, A. K., Charlton, Sebastian Jespersen, Mortensen, A. M., Hougaard, S. C. L., Trusina, Ala, Sneppen, Kim & Thon, Genevieve, 13 apr. 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 15, 11 s., e2022887118.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Model to Link Cell Shape and Polarity with Organogenesis

    Nielsen, Bjarke Frost, Nissen, Silas Boye, Sneppen, Kim, Mathiesen, Joachim & Trusina, Ala, 10 jan. 2020, I: iScience. 23, 2, s. 1-10 10 s., 100830.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Four simple rules that are sufficient to generate the mammalian blastocyst

    Nissen, Silas Boye, Perera Pérez, Marta, Martin Gonzalez, Javier, Morgani, S. M. C., Jensen, Mogens Høgh, Sneppen, Kim, Brickman, Joshua Mark & Trusina, Ala, 12 jul. 2017, I: PLOS Biology. 15, 7, s. 1-30 e2000737.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Theoretical tool bridging cell polarities with development of robust morphologies

    Nissen, Silas Boye, Rønhild, S., Trusina, Ala & Sneppen, Kim, 27 nov. 2018, I: eLife. 7, 25 s., e38407.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Nucleation and spreading of a heterochromatic domain in fission yeast

    Obersriebnig, M. J., Pallesen, Emil Marek Heymans, Sneppen, Kim, Trusina, Ala & Thon, Genevieve, 2016, I: Nature Communications. 7, 11 s., 11518.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Networks and Cities: An Information Perspective

    Rosvall, M., Trusina, Ala, Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 2005, I: Physical Review Letters. 94, 2, 028701.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Identification of the central intermediate in the extra-embryonic to embryonic endoderm transition through single-cell transcriptomics

    Rothová, M. M., Nielsen, Alexander Valentin, Proks, Martin, Wong, Yan Fung, Riveiro, A. R., Linneberg-Agerholm, Madeleine, David, E., Amit, I., Trusina, Ala & Brickman, Joshua Mark, 2022, I: Nature Cell Biology. 24, 6, s. 833-844 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    The fitness cost and benefit of phase-separated protein deposits

    Sanchez de Groot, N., Torrent Burgas, M., Ravarani, C. N. J., Trusina, Ala, Ventura, S. & Babu, M. M., apr. 2019, I: Molecular Systems Biology. 15, 4, e8075.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Hide-and-seek on complex networks

    Sneppen, Kim, Trusina, Ala & Rosvall, M., mar. 2005, I: EPL. 69, 5, s. 853-859

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Measuring information networks

    Sneppen, Kim, Trusina, Ala & Rosvall, M., jun. 2005, I: Pramana – Journal of Physics. 64, 6, s. 1121-1125

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    A minimal model for multiple epidemics and immunity spreading

    Sneppen, Kim, Trusina, Ala, Jensen, Mogens Høgh & Bornholdt, S., 18 okt. 2010, I: PLoS ONE. 5, 10, s. e13326

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Hierarchy measures in complex networks

    Trusina, Ala, Maslov, S., Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 30 apr. 2004, I: Physical Review Letters. 92, 17, 178702.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    The unfolded protein response and translation attenuation: a modelling approach.

    Trusina, Ala & Tang, C., okt. 2010, I: Diabetes, Obesity and Metabolism Online. 12, s. 27-31

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Functional alignment of regulatory networks: a study of temperate phages

    Trusina, Ala, Sneppen, Kim, Dodd, I. B., Shearwin, K. E. & Egan, J. B., 2006, I: PLoS Computational Biology. 1, 7, s. 599-603

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Translation attenuation mechanism in unfolded protein response

    Trusina, Ala, Papa, F. & Tang, C., 1 dec. 2008, Evolution from Cellular to Social Scales. Skjeltorp, A., Skjeltorp, A. & Belushkin, A. (red.). s. 83-90 8 s. (NATO Science for Peace and Security Series B: Physics and Biophysics).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Stress induced telomere shortening: longer life with less mutations?

    Trusina, Ala, 1 mar. 2014, I: B M C Systems Biology. 8, 27.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Rationalizing translation attenuation in the network architecture of the unfolded protein response

    Trusina, Ala, Papa, F. R. & Tang, C., 23 dec. 2008, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 105, 51, s. 20280-20285

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Asymmetric Damage Segregation Constitutes an Emergent Population-Level Stress Response

    Vedel, S., Nunns, H., Košmrlj, A., Semsey, S. & Trusina, Ala, 13 jul. 2016, I: Cell Systems. 3, 2, s. 187-198

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Analyzing inflammatory response as excitable media

    Yde, Pernille, Jensen, Mogens Høgh & Trusina, Ala, 18 nov. 2011, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 84, 5, Part 1, s. 051913

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Modeling the NF-kappa B mediated inflammatory response predicts cytokine waves in tissue

    Yde, Pernille, Mengel, A. B., Jensen, Mogens Høgh, Krishna, S. & Trusina, Ala, 19 jul. 2011, I: BMC Systems Biology. 5, s. 115

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 13307823