Kim Sneppen
Professor
Biokompleksitet
Blegdamsvej 17
2100 København Ø
- 1991
- Udgivet
Flow effects in intermediate-energy nuclear collisions
Barz, H. W., Bondorf, J. P., Donangelo, R., Elmér, R., Hansen, F. S., Jakobsson, B., Karlsson, L., Nifenecker, H., Schulz, H., Schussler, F., Sneppen, Kim & Söderström, K., 2 sep. 1991, I: Nuclear Physics, Section A. 531, 2, s. 453-460 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 1992
- Udgivet
STUDY OF DECAY AND ABSORPTION OF THE DELTA-RESONANCE IN NUCLEI WITH A 4-PI DETECTOR
HENNINO, T., RAMSTEIN, B., BACHELIER, D., BOHLEN, HG., BOYARD, JL., ELLEGAARD, C., GAARDE, C., GOSSET, J., JOURDAIN, JC., LARSEN, JS., LEMAIRE, MC., LHOTE, D., MORSCH, HP., OSTERLUND, M., POITOU, J., RADVANYI, P., ROYSTEPHAN, M., SAMS, T., SNEPPEN, K., VALETTE, O. & 1 flere, , 4 jun. 1992, I: Physics Letters B: Particle Physics, Nuclear Physics and Cosmology. 283, 1-2, s. 42-46Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 1994
- Udgivet
Statistical multifragmentation: Comparison of two quite successful models
Gross, D. H. E. & Sneppen, Kim, 17 jan. 1994, I: Nuclear Physics A. 567, 2, s. 317Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
- 1995
- Udgivet
Distributions of Self Interactions and Voids in 1+1d Directed Percolation
Huber, G., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 1 sep. 1995, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 52, 3, s. 2133-2136Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
- 1997
- Udgivet
Morphological Instabilities in a growing Yeast Colony: Experiment and Theory
Sams, T., Jensen, Mogens Høgh, Sneppen, Kim, Christensen, B., Ellegaard, Clive Sigurd & Thrane, U., 14 jul. 1997, I: Physical Review Letters. 79, 2, s. 313-316Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
- 2002
- Udgivet
Cooperativity in a trading model with memory and production
Donangelo, R. & Sneppen, Kim, 2002, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 316, 1-4, s. 581-591Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Epigenetics as a first exit problem
Sneppen, Kim & Aurell, E., 2002, I: Physical Review Letters. 88, 4, s. 048101 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Profit Profiles in Correlated Markets
Sneppen, Kim, 2002, I: Physica B: Condensed Matter. vol. A 316, s. 561-567Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Protein Interaction Networks Beyond Artifacts
Sneppen, Kim, 2002, I: FEBS. vol. 530, s. 255-256Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Specificity and Stability in Topology of Protein Networks
Sneppen, Kim, 2002, I: Kexue (Shanghai). vol. 296, s. 910-256Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Stability Puzzles in λ Phage
Sneppen, Kim, 2002, I: Physical Review D (Particles, Fields, Gravitation and Cosmology). vol. E 65, s. 051914Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Thermodynanics of Proteins: Fast Folders and Sharp Transitions
Bak, P., Sneppen, Kim & Jensen, Mogens Høgh, 2002, I: Computer Physics Communications. vol. 147, s. 307-312Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Time Delay as a Key to Apaptosis Induction in the p53 Network
Tiana, G., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2002, I: European Phys. Journal. vol. B 29, s. 135Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Thermodynamics of proteins: Fast folders and sharp transitions
Bakk, A., Dommersnes, P. G., Hansen, A., Høye, J. S., Sneppen, Kim & Jensen, Mogens Høgh, 1 jan. 2002, I: Computer Physics Communications. 147, 1-2, s. 307-312 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2003
- Udgivet
Competition between diffusion and fragmentation: an important evolutionary process of nature
Borg, J., Jensen, Mogens Høgh, Mathiesen, J. K., Olesen, Poul & Sneppen, Kim, 2003, I: Physical Review Letters. 91, s. 266103Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Single-cell Analysis of Lambda Immunity Regulation
Bæk, K. T., Svenningsen, Sine Lo, Eisen, H., Sneppen, Kim & Brown, Stanley, 2003, I: Journal of Molecular Biology. 334, 3, s. 363-372 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sustained oscillations and time delay in gene expression of protein hesl
Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2003, I: FEBS Letters. 541, s. 176-177Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2004
- Udgivet
A simple model for self organization of bipartite networks
Sneppen, Kim, Rosvall, M., Trusina, A. & Minnhagen, P., 2004, I: EPL. 67, 3, s. 349-354Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Detection in complex networks: correlation profile of the internet
Sneppen, Kim, Maslov, S. & Zalizynak, A., 2004, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 333, s. 529-540Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Diffusion on complex networks: a way to probe their large-scale topological structures
Sneppen, Kim, Simonsen, I. & Eriksen, K., 2004, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 336, s. 163-173Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hierarchy and anti-hierarchy in real and scale free networks
Sneppen, Kim & Minnhagen, P., 2004, I: Physical Review Letters. 92, s. 178702Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Robustness of the Right Operator in Bacteriophage µ
Metzler, R., Bakk, A. & Sneppen, Kim, 2004, I: Biophysical Journal. 86, s. 58-66Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Scaling in fracture and refreezing of sea ice
Sneppen, Kim & Hansen, A. G., 2004, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 331, s. 291-296Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sensitivity of phage µ upon variations of the gibbs free energy
Bakk, A., Sneppen, Kim & Metzler, R., 2004, I: Israel Journal of Chemistry. 44, s. 309-315Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Upstream plasticity and downstream robustness in evolution of molecular networks
Maslov, S., Sneppen, Kim, Astrup Eriksen, K. & Yan, K., 2004, I: BMC Evolutionary Biology. 4, s. 9-Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Variability alignment identifies functional regions in tubulin paralogs
Sneppen, Kim, 2004, I: Protein Science. 13, s. 25-31Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Visualization of large-scale correlations in gene expressions
Eriksen, K., Hörnquist, M. & Sneppen, Kim, 2004, I: Functional & Integrative Genomics. 4, 4, s. 241-245Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hierarchy measures in complex networks
Trusina, Ala, Maslov, S., Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 30 apr. 2004, I: Physical Review Letters. 92, 17, 178702.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Self-organization of structures and networks from merging and small-scale fluctuations
Minnhagen, P., Rosvall, M., Sneppen, Kim & Trusina, Ala, 15 sep. 2004, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 340, 4, s. 725-732Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Quantifying the benefits of translation regulation in the unfolded protein response
Axelsen, J. B. & Sneppen, Kim, 1 okt. 2004, I: Physical Biology. 1, 3, s. 159-165 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2005
- Udgivet
A Mathematical Model for Transcriptional Interfernce by RNA Polymerase Traffic in Escherichia coli
Sneppen, Kim, Dodd, J., Shearwin, K., Palmer, A., Schubert, R., Callen, B. & Egan, B., 2005, I: Journal of Molecular Biology. 346, 2, s. 399-409Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Communication boundaries in networks
Sneppen, Kim, Rosvall, M. & Trussina, A., 2005, I: Physical Review Letters. 94, 23, s. 238701Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Computational architecture of the yeast regulatory network: Workshop on Flexibility in Biomolecules, MAY 15-18, 2005 Tempe, AZ
Maslov, S. & Sneppen, Kim, 2005, I: Physical Biology. 2, 4, Sp. iss. Sl, s. S94-S100Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Navigating netwoks with limited information
Rosvall, M., Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 2005, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 71, 6, s. 066111Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Need, greed and noise: competing strategies and in a trading model
Donangelo, R., Hansen, A., Sneppen, Kim & Souza, S. R., 2005, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 348, s. 496-504Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Networks and Cities: An Information Perspective
Rosvall, M., Trusina, Ala, Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 2005, I: Physical Review Letters. 94, 2, 028701.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Oscillating gene expressions in regulatory network: Forces, Growth and Form in Soft Condensed Matter: At the Interface between Physics and Biology
Jensen, Mogens Høgh, Sneppen, Kim & Tiana, G., 2005, I: NATO Science Series : Sub-Series II, Mathematics, Physics and Chemistry. 160, s. 195-202Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Physics in Molecular Biology
Sneppen, Kim & Zocchi, G., 2005, UK: Cambridge University Press. 319 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning
- Udgivet
Searchability of networks
Rosvall, M., Grönlund, A., Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 2005, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 72, s. 046117Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
- Udgivet
Self organized scale-free networks from merging and regeneration
Kim, B. J., Trusina, A., Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 2005, I: The European Physical Journal E: Soft Matter and Biological Physics. 43, 3, s. 369-372Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Spiky oscillations in NF-KB signalling
Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2005, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 103, s. 10840-10845Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hide-and-seek on complex networks
Sneppen, Kim, Trusina, Ala & Rosvall, M., mar. 2005, I: EPL. 69, 5, s. 853-859Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Measuring information networks
Sneppen, Kim, Trusina, Ala & Rosvall, M., jun. 2005, I: Pramana – Journal of Physics. 64, 6, s. 1121-1125Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2006
- Udgivet
A communication perspective on network topologies
Sneppen, Kim & Rosvall, M., 2006, I: Progress of Theoretical Physics. Supplement. s. 103-118Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Functional alignment of regulatory networks: a study of temperate phages
Trusina, Ala, Sneppen, Kim, Dodd, I. B., Shearwin, K. E. & Egan, J. B., 2006, I: PLoS Computational Biology. 1, 7, s. 599-603Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genetic regulation of fluxes: iron homeostasis escherichia coli
Semsey, S., Andersson, A. M. C., Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh, Massé, E. & Sneppen, Kim, 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, 17, s. 4960-4967Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Genetic regulation of fluxes: iron homeostasis of Escherichia coli
Semsey, S., Andersson, A. M. C., Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh, Massé, E. & Sneppen, Kim, 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, 17, s. 4960-7 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Longevity of orders in related to the longevity of their constituent genera rather then genus richness
Bornholdt, S., Sneppen, Kim & Westphal, H., 2006, I: Theory in Biosciences. 128, 2, s. 75-83 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Minimal model of spiky oscillations in NF-kB signaling
Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2006, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 103, 4, s. 10840-10845Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modeling self-organization of communication and topology in social networks
Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 2006, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 74, 1, s. 016108Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Network models of phage-bacteria coevolution
Rosvall, M., Dodd, I. B., Krishna, S. & Sneppen, Kim, 2006, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 74, 6, s. 066105Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Self-assembly of information in networks
Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 2006, I: EPL. 74, 6, s. 1109-1115Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structure and communication in complex networks
Sneppen, Kim, 2006, I: NATO Science Series : Sub Series III, Computer and sytems sciences. s. 1-28Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt
Structure and function of negative feedback loops at the interface of genetic and metabolic networks
Krishna, S., Andersson, A. M. C., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, 8, s. 2455-62 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structure and function of negative feedback loops at the interface of genetic and metabolic networks
Krishna, S., Andersson, A. M. C., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, 8, s. 2455-2462Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Synchronization model for stock market asymmetry
Donangelo, R., Jensen, Mogens Høgh, Simonsen, I. & Sneppen, Kim, 2006, I: Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. L11001, s. 1-8Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Degree landscapes in scale-free networks
Axelsen, J. B., Bernhardsson, S., Rosvall, M., Sneppen, Kim & Trusina, Ala, sep. 2006, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 74, 3Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2007
- Udgivet
Combinatorics of feedback in cellular uptake and metabolism of small molecules
Krishna, S., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2007, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 52, s. 20815-20819Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Efficient degradation and expression prioritization with small RANs
Mitarai, Namiko, Andersson, A. M. C., Krishna, S., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2007, I: Physical Biology. 4, 3, s. 164-171Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fear and its implications for stock markets
Simonsen, I., Ahlgren, P. H., Jensen, Mogens Høgh, Danangelo, R. & Sneppen, Kim, 2007, I: European Physical Journal B. Condensed Matter and Complex Systems. 57, 2, s. 153-158Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Frustration driven stock market dynamics: Leverage effect and asymmetry
Heden Ahlgren, P. T., Jensen, Mogens Høgh, Simonsen, I., Donangelo, R. & Sneppen, Kim, 2007, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 383, 1, s. 1-4 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modeling the two-hybrid detector: Experimental bias on protien interaction networks
Stibius, K. & Sneppen, Kim, 2007, I: Biophysical Journal. 93, 7, s. 2562-2566Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modelling transcriptional interference and DNA looping in gene regulation
Dodd, I. B., Shearwin, K. & Sneppen, Kim, 2007, I: Journal of Molecular Biology. 369, 5, s. 1200-1213Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Networks and our limited information horizon
Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 2007, I: International Journal of Bifurcation and Chaos in Applied Sciences and Engineering. 17, 7, s. 2509-2515Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Signal integration in the galactose network of Escherichia coli
Semsey, S., Krishna, S., Sneppen, Kim & Adhya, S., 2007, I: Molecular Microbiology. 65, 2, s. 465-476Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Spreading out of perturbations in reversible reaction networks
Maslov, S., Sneppen, Kim & Ispolatov, I., 2007, I: New Journal of Physics. 9, 273Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Theoretical analysis of epigenetic cell memory by nucleosome modification
Dodd, I. B., Micheelsen, M. A., Sneppen, Kim & Thon, Genevieve, 2007, I: Cell. 129, 4, s. 813-22 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
UV-induced mutagenesis in Escherichia coli SOS response: A quantitative model
Krishna, S., Maslov, S. & Sneppen, Kim, 2007, I: PLoS Computational Biology. 3, 3, s. 451-462Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Combinatorics of feedback in cellular uptake and metabolism of small molecules
Krishna, S., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 26 dec. 2007, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 104, 52, s. 20815-9 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2008
- Udgivet
Dynamical genetic regulation
Jensen, Mogens Høgh, Krishna, S., Sneppen, Kim & Tiana, G., 2008, Springer. (Evolution from cellular to social scales, book series: Nato security through science series B: Physics and biophysics.Conference of the Nato-advanced study institute on evolution from cellular to social scales geilo, Norway april 10-20,2007, p.61-68.).Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Gene duplication models for directed networks with limits on growth
Enemark, J. & Sneppen, Kim, 2008, I: Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. 2007, s. P11007Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Komolgorov scaling from random force fields
Jensen, Mogens Høgh, Sneppen, Kim & Angheluta, L., 2008, I: EPL. 84, 1, s. 10011 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Oscillations and temporal signalling in cells
Tiana, G., Krishna, S., Pigolotti, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2008, I: Physical Biology. 4, 2, s. R1-R17Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ribosome collisions and Translation efficiency: Optimization by codon usage and mRNA destabilization
Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Pedersen, Steen, 2008, I: Journal of Molecular Biology. 382, 1, s. 236-245 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Signalling and Feedback in Biological Networks
Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2008, Dynamics on and of Complex Networks: Applications to Biology, computer Sciences, and the Social Sciences ( Modeling and Simulation in Sciences, Engineering and Technolo). Ganguly, N., Deutsch, A. & Mukherjee, A. (red.). Birkhäuser Verlag, s. Part 1 ( Biological Sciences)Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning
- Udgivet
The cost and capacity of signaling in the Escherichia coli proetin reaction network
Axelsen, J. B., Krishna, S. & Sneppen, Kim, 24 jan. 2008, I: Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. s. P010018Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
One hub-one process: a tool based view on regulatory network topology
Axelsen, J. B., Bernhardsson, S. & Sneppen, Kim, 4 mar. 2008, I: BMC Systems Biology. 2, s. 25Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ultrasensitive gene regulation by positive feedback loops in nucleosome modification
Sneppen, Kim, Micheelsen, M. A. & Dodd, I. B., 15 apr. 2008, I: Molecular Systems Biology. 4, s. 182Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The generation of promoter-mediated transcriptional noise in bacteria
Mitarai, Namiko, Dodd, I. B., Crooks, M. T. & Sneppen, Kim, 11 jul. 2008, I: PLoS Computational Biology. 4, 7, s. e 10000109Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamical analysis on gene activity in the presence of repressors and an interfering promoter
Nakanishi, H., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 1 nov. 2008, I: Biophysical Journal. 95, 9, s. 4228-4240Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2009
- Udgivet
Dominant negative autoregulation limits steady-state repression levels in gene networks
Semsey, S., Krishna, S., Erdossy, J., Horvath, P., Orosz, L., Sneppen, Kim & Adhya, S., 2009, I: Journal of Bacteriology. 191, 14, s. 4487-4491 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamic features of gene expression control by small regulatory RNAs
Mitarai, Namiko, Bemjamin, J., Krishna, S., Semsey, S., Csiszovszki, Z., Masse, E. & Sneppen, Kim, 2009, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 106, 26, s. 10655-10659 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamics of the recovery from sRNA-mediated gene silencing
Semsey, S., Bemjamin, J., Mitarai, Namiko, Krishna, S., Csiszovszki, Z., Sneppen, Kim & Masse, E., 2009, I: Cell Cycle. 8, 18, s. 2863-2864 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Dynamics of uptake and metabolism of small molecules in cellular response systems
Werner, M., Semsey, S., Sneppen, Kim & Krishna, S., 2009, I: P L o S One. 4, 3, s. e4923Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamics of uptake and metabolism of small molecules in cellular response systems
Werner, M., Semsey, S., Sneppen, Kim & Krishna, S., 2009, I: PLoS ONE. 4, 3, s. e4923Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modeling of the genetic switch of bacteriophage TP901-1: a heteromer of CI and MOR ensures robust bistability
Hiizu, N., Pedersen, M., Alsing, A. & Sneppen, Kim, 2009, I: Journal of Molecular Biology. 394, s. 15-28 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modeling proteasome dynamics in Parkinson's disease
Sneppen, Kim, Lizana, G. L., Jensen, Mogens Høgh, Pigolotti, S. & Otzen, D., 2009, I: Physical Biology. 6, 3, s. 036005Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Pathway identification by network pruning in the metabolic network of Escherichia coli
Gerlee, P. D. M., Lizana, G. L. & Sneppen, Kim, 2009, I: Bioinformatics. 25, 24, s. 3282-3288 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Reinforced communication and social navigation generate groups in model networks
Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 2009, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 79, 2, Part 2, s. 026111Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Relation of intracellular signal levels and promoter activities in the gal regulon of escherichia coli
Krishna, S., Orosz, L., Sneppen, Kim, Adhya, S. & Semsey, S., 2009, I: Journal of Molecular Biology. 391, 4, s. 671-678Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Toolbox model of evolution of prokaryotic metabolic networks and their regulation
Maslov, S., Krishna, S., Pang, T. Y. & Sneppen, Kim, 2009, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 24, s. 9743-9748 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Why do phage play dice?
Avlund, M., Dodd, I. B., Semsey, S., Sneppen, Kim & Krishna, S., 2009, I: Journal of Virology. 83, 22, s. 11416-11420 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Dynamic features of gene expression control by small regulatory RNAs
Mitarai, Namiko, Benjamin, J. M., Krishna, S., Semsey, S., Csiszovszki, Z., Massé, E. & Sneppen, Kim, 30 jun. 2009, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106, 26, s. 10655-9 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Dominant negative autoregulation limits steady-state repression levels in gene networks
Semsey, S., Krishna, S., Erdossy, J., Horváth, P., Orosz, L., Sneppen, Kim & Adhya, S., jul. 2009, I: Journal of Bacteriology. 191, 14, s. 4487-91 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Why do phage play dice?
Avlund, M., Dodd, I. B., Semsey, S., Sneppen, Kim & Krishna, S., nov. 2009, I: Journal of Virology. 83, 22, s. 11416-20 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Minimal Gene Regulatory Circuits that Can Count like Bacteriophage Lambda
Avlund, M., Dodd, I. B., Sneppen, Kim & Krishna, S., 11 dec. 2009, I: Journal of Molecular Biology. 394, 4, s. 681-693Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2010
- Udgivet
Simplified models of biological networks
Sneppen, Kim, Krishna, S. & Semsey, S., 4 jan. 2010, I: Annual Review of Biophysics and Biomolecular Structure. 9, 39, s. 43-59 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Time walkers and spatial dynamics of ageing information
Lizana, G. L., Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 29 jan. 2010, I: Physical Review Letters. 104, 4, s. 040603 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sustainability of Virulence in a Phage-Bacterial Ecosystem
Heilmann, Silja, Sneppen, Kim & Krishna, S., 1 mar. 2010, I: Journal of Virology. 84, 6, s. 3016-3022 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structural correlations in bacterial metabolic networks
Gerlee, P. D. M., Bernhardsson, P. J. S., Lizana, G. L. & Sneppen, Kim, 1 jun. 2010, I: FEBS Journal. 277, Suppl. 1, s. 114-114 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
ID: 10093
Flest downloads
-
2296
downloads
Direct and indirect effects in the regulation of overlapping promoters
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
2142
downloads
Single-cell Analysis of Lambda Immunity Regulation
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1916
downloads
The functional half-life of an mRNA depends on the ribosome spacing in an early coding region
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet