Kim Sneppen
Professor
Biokompleksitet
Blegdamsvej 17
2100 København Ø
- Udgivet
Time walkers and spatial dynamics of ageing information
Lizana, G. L., Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 29 jan. 2010, I: Physical Review Letters. 104, 4, s. 040603 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Exploring the Link between Nucleosome Occupancy and DNA Methylation
Lövkvist, Cecilia, Sneppen, Kim & Härter, Jan Olaf Mirko, 12 jan. 2018, I: Frontiers in Genetics. 8, 7 s., 232.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
DNA methylation in human epigenomes depends on local topology of CpG sites
Lövkvist, Cecilia, Dodd, I. B., Sneppen, Kim & Härter, Jan Olaf Mirko, 20 jun. 2016, I: Nucleic Acids Research. 44, 11, s. 5123-5132Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
From kill the winner to eliminate the winner in open phage-bacteria systems
Marantos, Anastasios, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 8 aug. 2022, I: PLOS Computational Biology. 18, 8, 15 s., e1010400.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Spreading out of perturbations in reversible reaction networks
Maslov, S., Sneppen, Kim & Ispolatov, I., 2007, I: New Journal of Physics. 9, 273Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Regime Shifts in a Phage-Bacterium Ecosystem and Strategies for Its Control
Maslov, S. & Sneppen, Kim, 1 nov. 2019, I: mSystems. 5, 4(6), e00470-19.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Computational architecture of the yeast regulatory network: Workshop on Flexibility in Biomolecules, MAY 15-18, 2005 Tempe, AZ
Maslov, S. & Sneppen, Kim, 2005, I: Physical Biology. 2, 4, Sp. iss. Sl, s. S94-S100Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Diversity Waves in Collapse-Driven Population Dynamics
Maslov, S. & Sneppen, Kim, 1 sep. 2015, I: P L o S One. 11, 9, e1004440.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Well-temperate phage: optimal bet-hedging against local environmental collapses
Maslov, S. & Sneppen, Kim, 2 jun. 2015, I: Scientific Reports. 5, 10523.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Toolbox model of evolution of prokaryotic metabolic networks and their regulation
Maslov, S., Krishna, S., Pang, T. Y. & Sneppen, Kim, 2009, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 24, s. 9743-9748 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Population cycles and species diversity in dynamic Kill-the-Winner model of microbial ecosystems
Maslov, S. & Sneppen, Kim, 4 jan. 2017, I: Scientific Reports. 7, 39642.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Severe population collapses and species extinctions in multihost epidemic dynamics
Maslov, S. & Sneppen, Kim, 22 aug. 2017, I: Physical Review E. 96, 2, 022412.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Upstream plasticity and downstream robustness in evolution of molecular networks
Maslov, S., Sneppen, Kim, Astrup Eriksen, K. & Yan, K., 2004, I: BMC Evolutionary Biology. 4, s. 9-Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Organizational structure and communication networks in a university environment
Mathiesen, Joachim, Jamtveit, B. & Sneppen, Kim, 2 jul. 2010, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 82, 1, s. 016104 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ecosystems with Mutually Exclusive Interactions Self-Organize to a State of High Diversity
Mathiesen, Joachim, Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Trusina, Ala, 25 okt. 2011, I: Physical Review Letters. 107, 18, s. 188101Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Robustness of the Right Operator in Bacteriophage µ
Metzler, R., Bakk, A. & Sneppen, Kim, 2004, I: Biophysical Journal. 86, s. 58-66Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Theory for the stability and regulation of epigenetic landscapes
Micheelsen, M. A., Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Dodd, I. B., 4 jun. 2010, I: Physical Biology. 7, 2, s. 026010 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Self-organization of structures and networks from merging and small-scale fluctuations
Minnhagen, P., Rosvall, M., Sneppen, Kim & Trusina, Ala, 15 sep. 2004, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 340, 4, s. 725-732Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The generation of promoter-mediated transcriptional noise in bacteria
Mitarai, Namiko, Dodd, I. B., Crooks, M. T. & Sneppen, Kim, 11 jul. 2008, I: PLoS Computational Biology. 4, 7, s. e 10000109Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Emergence of diversity in a model ecosystem
Mitarai, Namiko, Mathiesen, Joachim & Sneppen, Kim, 30 jul. 2012, I: Physical Review E. Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics. 86, 1, s. 011929 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Dynamic features of gene expression control by small regulatory RNAs
Mitarai, Namiko, Benjamin, J. M., Krishna, S., Semsey, S., Csiszovszki, Z., Massé, E. & Sneppen, Kim, 30 jun. 2009, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106, 26, s. 10655-9 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Three is much more than two in coarsening dynamics of cyclic competitions
Mitarai, Namiko, Gunnarson, I., Pedersen, B. N., Rosiek, C. A. & Sneppen, Kim, apr. 2016, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 93, 042408.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamic features of gene expression control by small regulatory RNAs
Mitarai, Namiko, Bemjamin, J., Krishna, S., Semsey, S., Csiszovszki, Z., Masse, E. & Sneppen, Kim, 2009, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 106, 26, s. 10655-10659 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sustainable diversity of phage-bacteria systems
Mitarai, Namiko, Marantos, Anastasios & Sneppen, Kim, 1 jun. 2023, I: Current Opinion in Systems Biology. 35, 6 s., 100468.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Population Dynamics of Phage and Bacteria in Spatially Structured Habitats Using Phage lambda and Escherichia coli
Mitarai, Namiko, Brown, Stanley & Sneppen, Kim, 11 apr. 2016, I: Journal of Bacteriology. 198, 12, s. 1783-1793Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Efficient degradation and expression prioritization with small RANs
Mitarai, Namiko, Andersson, A. M. C., Krishna, S., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2007, I: Physical Biology. 4, 3, s. 164-171Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Speciation, diversification, and coexistence of sessile species that compete for space
Mitarai, Namiko, Heinsalu, E. & Sneppen, Kim, 12 maj 2014, I: PloS One. 9, 5, s. e96665Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ribosome collisions and Translation efficiency: Optimization by codon usage and mRNA destabilization
Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Pedersen, Steen, 2008, I: Journal of Molecular Biology. 382, 1, s. 236-245 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamic competition between transcription initiation and repression: Role of nonequilibrium steps in cell-to-cell heterogeneity
Mitarai, Namiko, Semsey, S. & Sneppen, Kim, 13 aug. 2015, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 92, 2, 022710.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamical analysis on gene activity in the presence of repressors and an interfering promoter
Nakanishi, H., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 1 nov. 2008, I: Biophysical Journal. 95, 9, s. 4228-4240Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Establishment of heterochromatin in domain-size-dependent bursts
Nickels, Jan Fabio, Edwards, A. K., Charlton, Sebastian Jespersen, Mortensen, A. M., Hougaard, S. C. L., Trusina, Ala, Sneppen, Kim & Thon, Genevieve, 13 apr. 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 15, 11 s., e2022887118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The transcription factor Atf1 lowers the transition barrier for nucleosome-mediated establishment of heterochromatin
Nickels, Jan Fabio, Della-Rosa, M. E., Miguelez Goyeneche, I., Charlton, Sebastian Jespersen, Sneppen, Kim & Thon, Genevieve, 2022, I: Cell Reports. 39, 7, 17 s., 110828.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Host heterogeneity and epistasis explain punctuated evolution of SARS-CoV-2
Nielsen, Bjarke Frost, Saad-roy, C. M., Li, Y., Sneppen, Kim, Simonsen, L., Viboud, C., Levin, S. A., Grenfell, B. T. & Morozov, A. V. (red.), 15 feb. 2023, I: PLOS Computational Biology. 19, 2, 24 s., e1010896.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Differences in social activity increase efficiency of contact tracing
Nielsen, Bjarke Frost, Sneppen, Kim, Simonsen, L. & Mathiesen, Joachim, 2 okt. 2021, I: European Physical Journal B. 94, 10, 11 s., 209.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Model to Link Cell Shape and Polarity with Organogenesis
Nielsen, Bjarke Frost, Nissen, Silas Boye, Sneppen, Kim, Mathiesen, Joachim & Trusina, Ala, 10 jan. 2020, I: iScience. 23, 2, s. 1-10 10 s., 100830.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Lockdowns exert selection pressure on overdispersion of SARS-CoV-2 variants
Nielsen, Bjarke Frost, Eilersen, Andreas Thomas, Simonsen, L. & Sneppen, Kim, 2 sep. 2022, I: Epidemics. 40, 7 s., 100613.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
COVID-19 superspreading suggests mitigation by social network modulation
Nielsen, Bjarke Frost, Simonsen, L. & Sneppen, Kim, 15 mar. 2021, I: Physical Review Letters. 126, 6 s., 118301.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The counterintuitive implications of superspreading diseases
Nielsen, B. F., Sneppen, Kim & Simonsen, L., 31 okt. 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 3 s., 6954.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Four simple rules that are sufficient to generate the mammalian blastocyst
Nissen, Silas Boye, Perera Pérez, Marta, Martin Gonzalez, Javier, Morgani, S. M. C., Jensen, Mogens Høgh, Sneppen, Kim, Brickman, Joshua Mark & Trusina, Ala, 12 jul. 2017, I: PLOS Biology. 15, 7, s. 1-30 e2000737.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Theoretical tool bridging cell polarities with development of robust morphologies
Nissen, Silas Boye, Rønhild, S., Trusina, Ala & Sneppen, Kim, 27 nov. 2018, I: eLife. 7, 25 s., e38407.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Effect of supercoiling on the λ switch
Norregaard, K., Andersson, M., Sneppen, Kim, Nielsen, Peter E., Brown, Stanley & Oddershede, L. B., 1 jan. 2014, I: Bacteriophage. 4, 2, s. 1-5 5 s., e27517.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
DNA supercoiling enhances cooperativity and efficiency of an epigenetic switch
Norregaard, K., Andersson, M., Sneppen, Kim, Nielsen, Peter E., Brown, Stanley & Oddershede, L. B., 22 okt. 2013, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 110, 43, s. 17386-91 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Nucleation and spreading of a heterochromatic domain in fission yeast
Obersriebnig, M. J., Pallesen, E. M. H., Sneppen, Kim, Trusina, Ala & Thon, Genevieve, 2016, I: Nature Communications. 7, 11 s., 11518.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Nanog, Oct4 and Tet1 interplay in establishing pluripotency
Olariu, V., Lövkvist, Cecilia & Sneppen, Kim, 5 maj 2016, I: Scientific Reports. 6, 25438.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Repression of the lysogenic PR promoter in bacteriophage TP901-1 through binding of a CI-MOR complex to a composite OM-OR operator
Pedersen, M., Neergaard, J. T., Cassias, J., Rasmussen, K. K., Lo Leggio, Leila, Sneppen, Kim, Hammer, K. & Kilstrup, M., 26 maj 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, 13 s., 8659.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The functional half-life of an mRNA depends on the ribosome spacing in an early coding region
Pedersen, M., Nissen, S., Mitarai, Namiko, Svenningsen, Sine Lo, Sneppen, Kim & Pedersen, Steen, 2011, I: Journal of Molecular Biology. 407, 1, s. 35-44 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fast Translation within the First 45 Codons Decreases mRNA Stability and Increases Premature Transcription Termination in E. coli
Pedersen, Steen, Terkelsen, Thilde Bagger, Eriksen, M., Hauge, M. K., Lund, C. C., Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 2019, I: Journal of Molecular Biology. 431, 6, s. 1088-1097 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Quality control system response to stochastic growth of amyloid fibrils
Pigolotti, S., Lizana, L., Sneppen, Kim & Otzen, D., 2 maj 2013, I: F E B S Letters. 587, 9, s. 1405-1410 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hitchhiking, collapse, and contingency in phage infections of migrating bacterial populations
Ping, D., Wang, T., Fraebel, D. T., Maslov, S., Sneppen, Kim & Kuehn, S., 1 aug. 2020, I: ISME Journal. 14, 8, s. 2007-2018 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Pancreatic alpha and beta cells are globally phase-locked
Ren, H., Li, Y., Han, C., Yu, Y., Shi, B., Peng, X., Wu, S., Yang, X., Sneppen, Kim, Chen, L., Tang, C. & Zhang, T., 28 jun. 2022, I: Nature Communications. 13, 1, 16 s., 3721.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 10093
Flest downloads
-
2297
downloads
Direct and indirect effects in the regulation of overlapping promoters
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
2142
downloads
Single-cell Analysis of Lambda Immunity Regulation
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1916
downloads
The functional half-life of an mRNA depends on the ribosome spacing in an early coding region
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet