Biokompleksitet

  1. 2009
  2. Udgivet

    Simple model for wet granular materials with liquid cluster

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 1 dec. 2009, I: EPL. 88, 6, s. 64001

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Quantification of droplet deformation by electromagnetic trapping

    Møller, P. C. F. & Oddershede, L. B., 2009, I: EPL. 88, s. 48005 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Optical tweezers techniques, chapter in Hanndbook of Molecular Biophysics: Methods and Applications

    Oddershede, L. B., 2009, Handbook of Molecular Biophysics. G. Bohr, H. (red.). Wiley-VCH, s. 195-214 19 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  5. Udgivet

    Speciation-rate dependence in species-area relationships

    Pigolotti, S. & Cencini, M., 7 sep. 2009, I: Journal of Theoretical Biology. 260, 1, s. 83-89 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Symbolic dynamics of biological feedback networks

    Pigolotti, S., Krishna, S. & Jensen, Mogens Høgh, 2009, I: Physical Review Letters. 102, 8, s. 088701

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Confocal microscopy of thick specimens

    Reihani, S. N. S. & Oddershede, L. B., 2009, I: Journal of Biomedical Optics. 14, 3, s. 030513-030513-3 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Reinforced communication and social navigation generate groups in model networks

    Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 2009, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 79, 2, Part 2, s. 026111

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Ising model for neural data: Model quality and approximate methods for extracting functional connectivity

    Roudi, Y., Tyrcha, J. & Hertz, John, 2009, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 79, 5, s. 051915 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Statistical physics of pairwise probability models

    Roudi, Y., Aurell, E. & Hertz, John, 2009, I: Frontiers in Computational Neuroscience. 3, 22, s. (art 22) 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Effect of antibiotics and antimicrobial peptides on single protein motility

    Ryder, T. W. & Oddershede, L. B., 2009, I: Current Pharmaceutical Biotechnology. 10, 5, s. 486-493 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Effect of energy metabolism and membrane structure on single ¿-receptor motility

    Ryder, T. W., 2009, København: Museum Tusculanum. 101 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  13. Udgivet

    Effect of energy metabolism on protein motility in the bacterial outer membrane

    Ryder, T. W., Xu, L., Berg-Sørensen, K., Brown, Stanley & Oddershede, L. B., 2009, I: Biophysical Journal. 97, 5, s. 1305-1312 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Variety in intracellular diffusion during the cell cycle

    Selhuber-Unkel, C., Yde, Pernille, Berg-Sorensen, K. & Oddershede, L. B., jun. 2009, I: Physical Biology. 6, 2, 9 s., 025015.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Variety in intracellular diffusion during the cell cycle

    Selhuber-Unkel, C., Yde, P., Berg-Sørensen, K. & Oddershede, L. B., 2009, I: Physical Biology. 6, 2, s. 025015

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Tracking cell-nanoparticle interactions

    Selhuber-Unkel, C. J. M., 1 dec. 2009, I: Journal of Biomedical Nanotechnology. 5, 6, Sp.Iss. Sl., s. 634-640 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Dominant negative autoregulation limits steady-state repression levels in gene networks

    Semsey, S., Krishna, S., Erdossy, J., Horvath, P., Orosz, L., Sneppen, Kim & Adhya, S., 2009, I: Journal of Bacteriology. 191, 14, s. 4487-4491 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Dynamics of the recovery from sRNA-mediated gene silencing

    Semsey, S., Bemjamin, J., Mitarai, Namiko, Krishna, S., Csiszovszki, Z., Sneppen, Kim & Masse, E., 2009, I: Cell Cycle. 8, 18, s. 2863-2864 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Nonideal behavior of intramolecular structure factor of dilute polymers in a theta solvent

    Shimomura, K., Nakanishi, H. & Mitarai, Namiko, 2009, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 80, 5, Part 1, s. 051804

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Modeling proteasome dynamics in Parkinson's disease

    Sneppen, Kim, Lizana, G. L., Jensen, Mogens Høgh, Pigolotti, S. & Otzen, D., 2009, I: Physical Biology. 6, 3, s. 036005

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Texture of the upper 1000 m in the GRIP and NorthGRIP ice cores

    Svensson, Anders, Durand, G., Mathiesen, Joachim, Persson, A. & Dahl-Jensen, Dorthe, 2009, Low Temperature Science Supplement Issue: Physics of Ice Core Records II. Hondoh, T. (red.). Institute of Low Temperature Science, Hokkaido University, Sapporo Japan, Bind 68. s. 107-113 7 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Measurement of the spin-forbidden decay rate (3s3d)1D2¿(3s3p)3 P2,1 in 24Mg

    Therkildsen, K. T., Jensen, B. B., Ryder, C. P., Malossi, N. & Thomsen, Jan Westenkær, 2009, I: Physical Review A (Atomic, Molecular and Optical Physics). 79, 3, s. 034501 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Dynamics of uptake and metabolism of small molecules in cellular response systems

    Werner, M., Semsey, S., Sneppen, Kim & Krishna, S., 2009, I: PLoS ONE. 4, 3, s. e4923

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    The thermodynamics of lipid ion channel formation in the absence and presence of anesthetics. BLM experiments and simulations

    Wodzinska, K., Blicher, A. & Heimburg, Thomas Rainer, 2009, I: Soft Matter. 5, 17, s. 3319-3330 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Phase-state dependent current fluctuation in pure lipid membranes

    Wunderlich, B., Leirer, C. & Heimburg, Thomas Rainer, 2009, I: Biophysical Journal. 96, 11, s. 4592-4597 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. 2010
  27. Udgivet

    Functionality and noise in gene regulation qualitative answers from quantitative models & stochastic aspects of gene regulation

    Andersson, A. M. C., 1 apr. 2010, Niels Bohr Institute udg. University of Copenhagen: Museum Tusculanum. 144 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  28. Udgivet

    Thermodynamics of stressed solids: Slow deformation and roughening of material interfaces

    Angheluta, L. & Mathiesen, Joachim, 1 jan. 2010, I: European Physical Journal. Special Topics. 178, 1, s. 123-132 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Morphological instabilities of stressed and reactive geological interfaces

    Angheluta, L., Mathiesen, Joachim, Misbah, C. & Renard, F., 24 jun. 2010, I: Journal of Geophysical Research: Biogeosciences. 115, s. B06406 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Minimal gene regulatory circuits for a lysis-lysogeny choice in the presence of noise

    Avlund, M., Krishna, S., Semsey, S., Dodd, I. B. & Sneppen, Kim, 20 dec. 2010, I: PLoS ONE. 5, 12, s. 0015037 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Observation of periodic orbits on curved two-dimensional geometries

    Avlund, M., Ellegaard, Clive Sigurd, Oxborrow, M. & Søndergaard, N., 23 apr. 2010, I: Physical Review Letters. 104, 16, s. 164101 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    An investigation on methods for free-field comparison calibration of measurement microphones

    Barrera Figueroa, S., Moreno Pescador, Guillermo Sergio, Jacobsen, F., Rasmussen, K., Cutanda Henriquez, V. & Juhl, P. M., 2010, Proceedings of Internoise 2010: 39th International Congress and Exposition on Noise Control Engineering - Lisbon, Portugal Duration:,15 Jun 2010 → 16 Jun 2010. Portugal, Lisbon, Bind 39. s. 1-10 10 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Direct measurements of heating by electromagnetically trapped gold nanoparticles on supported lipid bilayers

    Bendix, Poul Martin, Seyyed Reihani, S. N. & Oddershede, L. B., 6 apr. 2010, I: ACS Nano. 4, 4, s. 2256-2262 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    On two-dimensionalization of three-dimensional turbulence in shell models

    Chakraborty, S., Jensen, Mogens Høgh & Sarkar, A., 15 jan. 2010, I: European Physical Journal B. Condensed Matter and Complex Systems. 73, 3, s. 447-453 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Three-dimensional turbulent relative dispersion by the Gledzer-Ohkitani-Yamada shell model

    Chakraborty, S., Jensen, Mogens Høgh & Madsen, B. S., 13 jan. 2010, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 81, 1, s. 017301 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Stop-and-go kinetics in amyloid fibrillation

    Ferkinghoff-Borg, J., Fonslet, J., Andersen, C. B., Krishna, S., Pigolotti, S., Hisashi, Y., Yuji, G., Otzen, D. & Jensen, Mogens Høgh, 1 jul. 2010, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 82, 1, s. 010901(R) 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Active-passive calibration of optical tweezers in viscoelastic media.

    Fischer, M., Richardson, A. C., Seyyed Reihani, S. N., Oddershede, L. B. & Berg-Sørensen, K., 14 jan. 2010, I: Review of Scientific Instruments. 81, 1, s. 015103 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Ion-channel-like behavior in lipid bilayer membranes at the melting transition

    Gallaher, J., Wodzinska, K., Heimburg, Thomas Rainer & Bier, M., 30 jun. 2010, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 81, 6, Part 1, s. 061925 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Diffusion-limited tumour growth: simulations and analysis

    Gerlee, P. D. M. & Anderson, A. R. A., 1 apr. 2010, I: Mathematical Biosciences and Engineering. 7, 2, s. 385-400 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    PRODUCTIVITY AND DIVERSITY IN A CROSS-FEEDING POPULATION OF ARTIFICIAL ORGANISMS

    Gerlee, P. D. M. & Lundh, T., 20 apr. 2010, I: Evolution. 64, 9, s. 2716-2730 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Structural correlations in bacterial metabolic networks

    Gerlee, P. D. M., Bernhardsson, P. J. S., Lizana, G. L. & Sneppen, Kim, 1 jun. 2010, I: FEBS Journal. 277, Suppl. 1, s. 114-114 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

  42. Udgivet

    Influence of Lipid Heterogeneity and Phase Behavior on Phospholipase A(2) Action at the Single Molecule Level

    Gudmand, M. J., Rocha, S., Hatzakis, Nikos, Peneva, K., Müllen , K., Stamou, Dimitrios, Uji-I, H., Hofkens , J., Bjørnholm, T. & Heimburg, Thomas Rainer, 5 maj 2010, I: Biophysical Journal. 98, 9, s. 1873-82 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Finding diabetic nephropathy biomarkers in the plasma peptidome by high-throughput magnetic bead processing and MALDI-TOF-MS analysis

    Hansen, H. G., Overgaard, J., Lajer, M., Hubalek, F., Højrup, P., Pedersen, L., Tarnow, L., Rossing, Peter, Pociot, Flemming & McGuire, J. N., 1 sep. 2010, I: Proteomics - Clinical Applications. 4, 8-9, s. 697-705 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Sustainability of Virulence in a Phage-Bacterial Ecosystem

    Heilmann, Silja, Sneppen, Kim & Krishna, S., 1 mar. 2010, I: Journal of Virology. 84, 6, s. 3016-3022 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Contribution about sound pulses in nerves and anesthesia

    Heimburg, Thomas Rainer, 1 maj 2010, København

    Publikation: AndetAndet bidragForskning

  46. Udgivet

    Electromechanical theory of nerve pulses and channel formation

    Heimburg, Thomas Rainer, 5 feb. 2010, Dept. of Chemical Engineering, Spain

    Publikation: AndetAndet bidragForskning

  47. Udgivet

    Lipid ion channels

    Heimburg, Thomas Rainer, 1 aug. 2010, I: Biophysical Chemistry. 150, 1-3, s. 2-22 20 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Physics of nerves: the action potential as a propagating density pulse

    Heimburg, Thomas Rainer, 2010, Lyngby, Danmark

    Publikation: AndetAndet bidragForskning

  49. Udgivet

    The physics of nerves and lipid ion channels

    Heimburg, Thomas Rainer, 2010, Cavendish Laboratory, UK

    Publikation: AndetAndet bidragForskning

  50. Udgivet

    Cross-correlations in high-conductance states of a model cortical network

    Hertz, John, 1 feb. 2010, I: Neural Computation. 22, 2, s. 427-447 21 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  51. Udgivet

    Timing of gene transcription in the galactose utilization system of Escherichia coli

    Horvath, P., Hunziker, A., Erdossy, J., Krishna, S. & Semsey, S., 3 dec. 2010, I: Journal of Biological Chemistry. 285, 49, s. 38062-38068 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  52. Udgivet

    Genetic flexibility of regulatory networks

    Hunziker, A., Tuboly, C., Horváth, P., Krishna, S. & Semsey, S., 20 jul. 2010, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 107, 29, s. 12998-13003 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt