Biokompleksitet

  1. Udgivet

    Evaluation of the Unstructured Lattice Boltzmann Method in Porous Flow Simulations

    Misztal, M. K., Matin, R., Hernandez Garcia, A. & Mathiesen, Joachim, nov. 2015.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  2. Udgivet

    Velocity correlations in dense granular shear flows: Effects on energy dissipation and normal stress

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 2007, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 75, 3, s. 031305

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Hard-sphere limit of soft-sphere model for granular materials: Stiffness dependence of steady granular flow

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 19 feb. 2003, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 67, 2, 021301.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Linear stability analysis of rapid granular flow down a slope and density wave formation

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 25 maj 2004, I: Journal of Fluid Mechanics. 507, s. 309-334

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Collisional granular flow as a micropolar fluid

    Mitarai, Namiko, Hayakawa, H. & Nakanishi, H., 29 apr. 2002, I: Physical Review Letters. 88, 17, 174301.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Entrainment of noise-induced and limit cycle oscillators under weak noise

    Mitarai, Namiko, Alon, U. & Jensen, Mogens Høgh, 1 jun. 2013, I: Chaos. 23, 2, 023125.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Wet granular materials

    Mitarai, Namiko & Nori, F., 30 jun. 2006, I: Advances in Physics. 55, 1-2, s. 1-45 45 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Instability of dilute granular flows on rough slope

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 1 okt. 2001, I: Journal of the Physical Society of Japan. 70, 10, s. 2809-2812

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    How pirate phage interferes with helper phage: Comparison of the two distinct strategies

    Mitarai, Namiko, 7 feb. 2020, I: Journal of Theoretical Biology. 486, 9 s., 110096.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Control of ribosome traffic by position-dependent choice of synonymous codons

    Mitarai, Namiko & Pedersen, Steen, 8 okt. 2013, I: Physical Biology. 10, 5, 056011.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Three is much more than two in coarsening dynamics of cyclic competitions

    Mitarai, Namiko, Gunnarson, I., Pedersen, B. N., Rosiek, C. A. & Sneppen, Kim, apr. 2016, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 93, 042408.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Emergence of diversity in a model ecosystem

    Mitarai, Namiko, Mathiesen, Joachim & Sneppen, Kim, 30 jul. 2012, I: Physical Review E. Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics. 86, 1, s. 011929 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Dynamic features of gene expression control by small regulatory RNAs

    Mitarai, Namiko, Bemjamin, J., Krishna, S., Semsey, S., Csiszovszki, Z., Masse, E. & Sneppen, Kim, 2009, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 106, 26, s. 10655-10659 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Spatiotemporal structure of traffic flow in a system with an open boundary

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 21 aug. 2000, I: Physical Review Letters. 85, 8, s. 1766-1769

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Sustainable diversity of phage-bacteria systems

    Mitarai, Namiko, Marantos, Anastasios & Sneppen, Kim, 1 jun. 2023, I: Current Opinion in Systems Biology. 35, 6 s., 100468.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Population Dynamics of Phage and Bacteria in Spatially Structured Habitats Using Phage lambda and Escherichia coli

    Mitarai, Namiko, Brown, Stanley & Sneppen, Kim, 11 apr. 2016, I: Journal of Bacteriology. 198, 12, s. 1783-1793

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Efficient degradation and expression prioritization with small RANs

    Mitarai, Namiko, Andersson, A. M. C., Krishna, S., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2007, I: Physical Biology. 4, 3, s. 164-171

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Convective instability and structure formation in traffic flow

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 2 nov. 2000, I: Journal of the Physical Society of Japan. 69, 11, s. 3752-3761

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Speciation, diversification, and coexistence of sessile species that compete for space

    Mitarai, Namiko, Heinsalu, E. & Sneppen, Kim, 12 maj 2014, I: PloS One. 9, 5, s. e96665

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Stability analysis of collisional granular flow on a slope

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 30 sep. 2003, I: International Journal of Modern Physics B. 17, 22-24 II, s. 4290-4294 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Ribosome collisions and Translation efficiency: Optimization by codon usage and mRNA destabilization

    Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Pedersen, Steen, 2008, I: Journal of Molecular Biology. 382, 1, s. 236-245 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Dynamic competition between transcription initiation and repression: Role of nonequilibrium steps in cell-to-cell heterogeneity

    Mitarai, Namiko, Semsey, S. & Sneppen, Kim, 13 aug. 2015, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 92, 2, 022710.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Bagnold scaling, density plateau, and kinetic theory analysis of dense granular flow

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 1 apr. 2005, I: Physical Review Letters. 94, 12, s. 128001 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    The generation of promoter-mediated transcriptional noise in bacteria

    Mitarai, Namiko, Dodd, I. B., Crooks, M. T. & Sneppen, Kim, 11 jul. 2008, I: PLoS Computational Biology. 4, 7, s. e 10000109

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Coupled positive and negative feedbacks produce diverse gene expression patterns in colonies

    Mitarai, Namiko, Jensen, Mogens Høgh & Semsey, S., 7 apr. 2015, I: mBio (Print). 6, 2, e00059-15 .

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Stability analysis of optimal velocity model for traffic and granular flow under open boundary condition

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 1 aug. 1999, I: Journal of the Physical Society of Japan. 68, 8, s. 2475-2478

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Granular flow: dry and wet

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 2012, I: European Physical Journal. Special Topics. 204, 1, s. 5-17 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Simple Interaction Model for Particlly Wet Granular Materials

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 1 feb. 2010, I: A I P Conference Proceedings Series. 1227, s. 214-220

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Simple model for wet granular materials with liquid cluster

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 1 dec. 2009, I: EPL. 88, 6, s. 64001

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Full simulation of chiral random matrix theory at nonzero chemical potential by complex Langevin

    Mollgaard, A. & Splittorff, Kim, 26 feb. 2015, I: Physical Review D (Particles, Fields, Gravitation and Cosmology). 91, 3, 036007.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Correlations between human mobility and social interaction reveal general activity patterns

    Mollgaard, A., Lehmann, S. & Mathiesen, Joachim, 13 dec. 2017, I: PLOS ONE. 12, 12, e018973.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    The Dynamics of Initiative in Communication Networks

    Mollgaard, A. & Mathiesen, Joachim, 28 apr. 2016, I: PLOS ONE. 11, 4, e0154442.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Contact activity and dynamics of the social core

    Mones, E., Stopczynski, A. & Lehmann, S., 31 maj 2017, I: EPJ Data Science. 6

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Optimizing targeted vaccination across cyber-physical networks: an empirically based mathematical simulation study

    Mones, E., Stopczynski, A., Pentland, A. '., Hupert, N. & Lehmann, S., 1 jan. 2018, I: Journal of the Royal Society. Interface. 15, 138, 9 s., 20170783.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Mechanics of Live Cell Elimination

    Monfared, S., Ravichandran, G., Andrade, J. E. & Doostmohammadi, Amin, 18 aug. 2021, I: bioRxiv. s. 1-7 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Mechanical basis and topological routes to cell elimination

    Monfared, S., Ravichandran, G., Andrade, J. & Doostmohammadi, Amin, 18 apr. 2023, I: eLife. 12, 20 s., 82435.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Short-range correlation of stress chains near solid-to-liquid transition in active monolayers

    Khosh Sokhan Monfared, Siavash, Ravichandran, G., Andrade, J. E. & Doostmohammadi, Amin, 8 maj 2024, I: Journal of the Royal Society Interface. 21, 214, 8 s., 20240022.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Disparate metabolic response to fructose feeding between different mouse strains

    Montgomery, M. K., Fiveash, C. E., Braude, J. P., Osborne, Brenna, Brown, Stanley, Mitchell, T. W. & Turner, N., 22 dec. 2015, I: Scientific Reports. 5, 18474.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Investigating Plasma-Membrane Repair Employing Thermoplasmonics

    Moreno Pescador, Guillermo Sergio, Aswad, D. S., Arastoo, Mohammadreza, Danielsen, Helena Maria Dávidsdóttir, Florentsen, C. D., Bahadori, Azra, Nylandsted, J., Oddershede, L. B. & Bendix, Poul Martin, 2021, I: Biophysical Journal. 120, 3, Supp. 1, s. 45a-45a 1 s., 221-Pos.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Membrane protein dynamics studied with optical and thermoplasmonic methods in complex and simple membranes

    Moreno Pescador, Guillermo Sergio, 2019, Niels Bohr Institute, Faculty of Science, University of Copenhagen. 163 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandling

  41. Udgivet

    Lateral Distribution and Mobility of Transmembrane Proteins in Plasma Membrane Vesicles

    Moreno Pescador, Guillermo Sergio, Otsbye, H., Semsey, S., Veje, E. L., Daniels, R. & Bendix, Poul Martin, 18 feb. 2018, I: Biophysical Journal. 114, 3, Supp. 2976-pos, s. 600A-600A 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Thermoplasmonic Vesicle Fusion Reveals Membrane Phase Segregation of Influenza Spike Proteins

    Moreno Pescador, Guillermo Sergio, Arastoo, Mohammadreza, Thusgaard Ruhoff, Victoria, Chiantia, S., Daniels, R. & Bendix, Poul Martin, 11 apr. 2023, I: Nano Letters. 23, 8, s. 3377-3384 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Quantification of protein dynamics in nanotubes pulled from transfected cell-derived vesicles

    Moreno Pescador, Guillermo Sergio, Florentsen, C., Østbye, H., Sønder, S. L., Boye, T. L., Veje, E. L., Semsey, S., Nylandsted, J., Daniels, R. & Bendix, Poul Martin, 20 jul. 2019, I: European Biophysics Journal. 48, Suppl. 1, s. S159-S159

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Curvature- and Phase-Induced Protein Sorting Quantified in Transfected Cell-Derived Giant Vesicles

    Moreno Pescador, Guillermo Sergio, Florentsen, C. D., Østbye, H., Sønder, S. L., Boye, T. L., Veje, E. L., Sonne, A. K., Semsey, S., Nylandsted, J., Daniels, R. & Bendix, Poul Martin, jun. 2019, I: ACS Nano. 13, 6, s. 6689-6701

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Effect of local thermoplasmonic heating on biological membranes

    Moreno Pescador, Guillermo Sergio, Qoqaj, I., Thusgaard Ruhoff, Victoria, Iversen, J., Nylandsted, J. & Bendix, Poul Martin, 9 sep. 2019, I: Proceedings of S P I E - International Society for Optical Engineering. 11083, 19 s., 110830M.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Thermoplasmonic nano-rupture of cells reveals Annexin V function in plasma membrane repair

    Moreno Pescador, Guillermo Sergio, Aswad, D. S., Florentsen, C. D., Bahadori, Azra, Arastoo, M. R., Danielsen, Helena Maria Dávidsdóttir, Heitmann, A. S. B., Boye, T. L., Nylandsted, J., Oddershede, L. B. & Bendix, Poul Martin, 2022, I: Nanoscale. 14, s. 7778–7787

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

  47. Udgivet

    Probing the precipitation life cycle by iterative rain cell tracking

    Moseley, C., Berg, P. & Härter, Jan Olaf Mirko, 27 dec. 2013, I: Journal of Geophysical Research: Atmospheres. 118, 24, s. 13361-13370

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Intensification of convective extremes driven by cloud–cloud interaction

    Moseley, C., Hohenegger, C., Berg, P. & Härter, Jan Olaf Mirko, 29 aug. 2016, I: Nature Geoscience. 9, 10, s. 748-752

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    A Statistical Model for Isolated Convective Precipitation Events

    Moseley, C., Henneberg, O. & Härter, Jan Olaf Mirko, 29 jan. 2019, I: Journal of Advances in Modeling Earth Systems. 11, 1, s. 360-375

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Single-Molecule Study of Thermomyces lanuginosus Lipase in a Detergency Application System Reveals Diffusion Pattern Remodeling by Surfactants and Calcium

    Moses, M. E., Lund, P. M., Bohr, S. S., Iversen, J. F., Kæstel-Hansen, J., Kallenbach, A. S., Iversen, L., Christensen, S. M. & Hatzakis, Nikos, 2021, I: A C S Applied Materials and Interfaces. 13, 28, 9 s., 33704.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt