Biokompleksitet

  1. Udgivet

    Mutations in Transcriptional Regulators Allow Selective Engineering of Signal Integration Logic

    Semsey, S., 25 maj 2014, I: mBio (Print). 5, 3, e01171.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    The effect of LacI autoregulation on the performance of the lactose utilization system in Escherichia coli

    Semsey, S., Jauffred, Liselotte, Csiszovszki, Z., Erdossy, J., Steger, V., Hansen, S. & Krishna, S., 1 jul. 2013, I: Nucleic Acids Research. 41, 13, s. 6381-6390

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Signal integration in the galactose network of Escherichia coli

    Semsey, S., Krishna, S., Sneppen, Kim & Adhya, S., 2007, I: Molecular Microbiology. 65, 2, s. 465-476

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    A Mixed Incoherent Feed-Forward Loop Allows Conditional Regulation of Response Dynamics

    Semsey, S., 12 mar. 2014, I: P L o S One. 9, 3, e91243.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Significant improvement of optical traps by tuning standard water immersion objectives

    Seyyed Reihani, S. N., Richardson, A. C. & Oddershede, L. B., 1 okt. 2011, I: Journal of Optics. 13, 10, s. 105301

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    4D Neutron Imaging of Solute Transport and Fluid Flow in Sandstone Before and After Mineral Precipitation

    Shafabakhsh, P., Cordonnier, B., Pluymakers, A., Le Borgne, T., Mathiesen, Joachim, Linga, G., Hu, Y., Kaestner, A. & Renard, F., 13 mar. 2024, I: Water Resources Research. 60, 3, 19 s., e2023WR036293.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Effect of salts, solvents and buffer on miRNA detection using DNA silver nanocluster (DNA/AgNCs) probes

    Shah, P., Cho, S. K., Thulstrup, Peter Waaben, Bhang, Y., Ahn, J. C., Choi, S. W., Rørvig-Lund, A. & Yang, S. W., 2014, I: Nanotechnology. 25, 4, 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Nonideal behavior of intramolecular structure factor of dilute polymers in a theta solvent

    Shimomura, K., Nakanishi, H. & Mitarai, Namiko, 2009, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 80, 5, Part 1, s. 051804

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Fear and its implications for stock markets

    Simonsen, I., Ahlgren, P. H., Jensen, Mogens Høgh, Danangelo, R. & Sneppen, Kim, 2007, I: European Physical Journal B. Condensed Matter and Complex Systems. 57, 2, s. 153-158

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Fractionated photothermal therapy in a murine tumor model: comparison with single dose

    Simón, M., Nørregaard, K., Jørgensen, Jesper Tranekjær, Oddershede, L. B. & Kjær, Andreas, jul. 2019, I: International Journal of Nanomedicine. 14, s. 5369—5379

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    A universal power law and proportionate change process characterize the evolution of metabolic networks

    Singh, S., Samal, A., Giri, V. & Krishna, S., 2007, I: European Physical Journal B. Condensed Matter and Complex Systems. 57, 1, s. 75-80

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Comparative network analysis of preterm vs. full-term infant-mother interactions

    Sipos, L., Mengel, A. B., Kalmar, M., Toth, I., Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh & Semsey, S., 2013, I: P L o S One. 8, 6, 10 s., e67183.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Epigenetic switching with asymmetric bridging interactions

    Skjegstad, L. E. J., Nickels, Jan Fabio, Sneppen, Kim & Kirkegaard, Julius Bier, 20 jun. 2023, I: Biophysical Journal. 122, 12, s. 2421-2429 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Hide-and-seek on complex networks

    Sneppen, Kim, Trusina, Ala & Rosvall, M., mar. 2005, I: EPL. 69, 5, s. 853-859

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Measuring information networks

    Sneppen, Kim, Trusina, Ala & Rosvall, M., jun. 2005, I: Pramana – Journal of Physics. 64, 6, s. 1121-1125

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Structure and communication in complex networks

    Sneppen, Kim, 2006, I: NATO Science Series : Sub Series III, Computer and sytems sciences. s. 1-28

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    A minimal model for multiple epidemics and immunity spreading

    Sneppen, Kim, Trusina, Ala, Jensen, Mogens Høgh & Bornholdt, S., 18 okt. 2010, I: PLoS ONE. 5, 10, s. e13326

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Economy of operon formation: cotranscription minimizes shortfall in protein complexes

    Sneppen, Kim, Pedersen, Steen, Krishna, S., Dodd, I. B. & Semsey, S., 21 sep. 2010, I: Microbe. 1, 4, s. e00177-10

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Simplified models of biological networks

    Sneppen, Kim, Krishna, S. & Semsey, S., 4 jan. 2010, I: Annual Review of Biophysics and Biomolecular Structure. 9, 39, s. 43-59 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    A communication perspective on network topologies

    Sneppen, Kim & Rosvall, M., 2006, I: Progress of Theoretical Physics. Supplement. s. 103-118

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Models of life: Dynamics and regulation in biological systems

    Sneppen, Kim, 5 okt. 2014, Cambridge University Press udg. Cambridge. 342 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportBogForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Theoretical analysis of Polycomb-Trithorax systems predicts that poised chromatin is bistable and not bivalent

    Sneppen, Kim & Ringrose, L., 13 maj 2019, I: Nature Communications. 10, 18 s., 2133.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Globalization in a nutshell

    Sneppen, Kim & Bornholdt, S., 29 okt. 2018, I: Physical Review E. 98, 4, 6 s., 022314.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Overdispersion in COVID-19 increases the effectiveness of limiting nonrepetitive contacts for transmission control

    Sneppen, Kim, Nielsen, Bjarke Frost, Taylor, R. J. & Simonsen, L., 6 apr. 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 14, 6 s., 2016623118.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Nucleosome dynamics and maintenance of epigenetic states of CpG islands

    Sneppen, Kim & Dodd, I. B., 28 jun. 2016, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 93, 6, 062417.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Cooperative stabilization of the SIR complex provides robust epigenetic memory in a model of SIR silencing in Saccharomyces cerevisiae

    Sneppen, Kim & Dodd, I. B., 1 apr. 2015, I: Epigenetics. 10, 4, s. 293-302

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Models of life: epigenetics, diversity and cycles

    Sneppen, Kim, 1 apr. 2017, I: Reports on Progress in Physics. 80, 4, 042601.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Ultrasensitive gene regulation by positive feedback loops in nucleosome modification

    Sneppen, Kim, Micheelsen, M. A. & Dodd, I. B., 15 apr. 2008, I: Molecular Systems Biology. 4, s. 182

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Mismatch repair at stop codons is directed independent of GATC methylation on the Escherichia coli chromosome

    Sneppen, Kim & Semsey, S., 5 dec. 2014, I: Scientific Reports. 4, 7436.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Restriction modification systems as engines of diversity

    Sneppen, Kim, Semsey, S., Seshasayee, A. S. N. & Krishna, S., 2 jun. 2015, I: Frontiers in Microbiology. 6, 528.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    A simple histone code opens many paths to epigenetics

    Sneppen, Kim & Dodd, I. B., 2012, I: P L o S Computational Biology. 8, 8, 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Multistability with a Metastable Mixed State

    Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 5 sep. 2012, I: Physical Review Letters. 109, 10, s. 100602 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Modeling proteasome dynamics in Parkinson's disease

    Sneppen, Kim, Lizana, G. L., Jensen, Mogens Høgh, Pigolotti, S. & Otzen, D., 2009, I: Physical Biology. 6, 3, s. 036005

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Quantitative determination of optical trapping strength and viscoelastic moduli inside living cells

    Soler, J. M., Richardson, A. C., Seyyed Reihani, S. N., Oddershede, L. B. & Berg-Sørensen, K., 1 aug. 2013, I: Physical Biology. 10, 4, 046006.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Spatiotemporal NF-kappa B dynamics encodes the position, amplitude, and duration of local immune inputs

    Son, M., Frank, T., Holst-Hansen, T., Wang, A. G., Junkin, M., Kashaf, S. S., Trusina, Ala & Tay, S., 2 sep. 2022, I: Science Advances. 8, 35, 14 s., 6240.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Counting function for a sphere of anisotropic quartz

    Sondergaard, N., Guhr, T., Oxborrow, M., Schaadt, K. & Ellegaard, Clive Sigurd, 1 sep. 2004, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 70, 3, 036206.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Stabilization of epigenetic states of CpG islands by local cooperation

    Sormani, G., Härter, Jan Olaf Mirko, Lövkvist, Cecilia & Sneppen, Kim, 2016, I: Molecular BioSystems. 12, 7, s. 2142-2146

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Genome-Wide Screening of Genes Regulated by DNA Methylation in Colon Cancer Development

    Spisak, S., Kalmar, A., Galamb, O., Wichmann, B., Sipos, F., Péterfia, B., Csabai, I., Kovalszky, I., Semsey, S., Tulssay, Z. & Molnár, B., 1 okt. 2012, I: P L o S One. 7, 10, s. e46215

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Membrane Curvature Regulates the Localization of G Protein Coupled Receptors and Ras Isoforms

    Stamou, Dimitrios, Rosholm, K. R., Damalas, A., Hatzakis, Nikos, Wirth, V. F., Martinez, Karen Laurence, Leijnse, Natascha, Oddershede, L. B., Bendix, Poul Martin & Pedersen, S. L., 27 jan. 2015, I: Biophysical Journal. 108, 2, s. 95a-96a

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Static and Dynamic Disorder Observed in the Phase Transition Behavior of Individual Small Unilamellar Vesicles

    Stamou, Dimitrios, Bendix, Poul Martin, Wibroe, P. P. & Hatzakis, Nikos, 2011, I: Biophysical Journal. 100, 3 suppl 1, s. 35a 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Cooke–Triplet tweezers: more compact, robust, and efficient optical tweezers

    Stangner, T., Dahlberg, T., Svenmarker, P., Zakrisson, J., Wiklund, K., Oddershede, L. B. & Andersson, M., 26 mar. 2018, I: Optics Letters. 43, 9, s. 1990-1993

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    L'enseignement de la physique au Danemark

    Steenstrup, S., 1995, L'enseignement de la physique pour l'Europe de demain. Commission des Communantes Europeennes, s. DK1-DK7

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  43. Udgivet

    Reconstructing SPECT images using the Maximum Entropy Principle and including the Effect of Collimation

    Steenstrup, S., 1991, I: Physica Medica. 3-4/VI, s. 273-277

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    The Maximum-Entropy Method without the Positivity Constraint - Applications to the Determination of the Distance-Distribution Function in Small-Angle Scattering

    Steenstrup, S. & Hansen, S., 1994, I: Journal of Applied Crystallography. 27, s. 574-580

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Physics Studies in Denmark

    Steenstrup, S., 1995, Physics Studies for Tomorrow's Europe. Commission of the European Communities, s. DK1-DK7

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  46. Udgivet

    Short-range growth inhibitory signals from the epithelium can drive non-stereotypic branching in the pancreas

    Dahl-Jensen, Svend Bertel, Figueiredo-Larsen, E. M., Botton, A. & Sneppen, Kim, 23 feb. 2016, I: Physical Biology. 13, 1, 016007.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Modeling the two-hybrid detector: Experimental bias on protien interaction networks

    Stibius, K. & Sneppen, Kim, 2007, I: Biophysical Journal. 93, 7, s. 2562-2566

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    How Physical Proximity Shapes Complex Social Networks

    Stopczynski, A., Pentland, A. '. & Lehmann, S., 7 dec. 2018, I: Scientific Reports. 8, 17722.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Temporal fidelity in dynamic social networks

    Stopczynski, A., Sapiezynski, P., Pentland, A. '. & Jørgensen, Sune Lehmann, 7 okt. 2015, I: European Physical Journal B. Condensed Matter and Complex Systems. 88, 10

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    A kinetic mechanism for cell sorting based on local variations in cell motility

    Strandkvist, C., Juul, J., Baum, B., Kabla, A. J. & Duke, T., 6 dec. 2014, I: Interface Focus. 4, 6, 20140013.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt