Biokompleksitet

  1. Udgivet

    SuperSegger: Robust image segmentation, analysis and lineage tracking of bacterial cells

    Stylianidou, S., Brennan, C., Nissen, Silas Boye, Kuwada, N. J. & Wiggins, P. A., 11 nov. 2016, I: Molecular Microbiology. 102, 4, s. 690-700 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    Chemophoresis engine: A general mechanism of ATPase-driven cargo transport

    Sugawara, T., Morozov, A. V. (red.) & Kaneko, Kunihiko, 25 jul. 2022, I: PLOS Computational Biology. 18 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Quadrupolar active stress induces exotic patterns of defect motion in compressible active nematics

    Sultan, S. A., Nejad, M. R. & Doostmohammadi, Amin, 7 maj 2022, I: Soft Matter. 18, s. 4118-4126 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Existence of log-phase Escherichia coli persisters and lasting memory of a starvation pulse

    Svenningsen, Mikkel Skjoldan, Svenningsen, Sine Lo, Sørensen, Michael Askvad & Mitarai, Namiko, 2022, I: Life Science Alliance. 5, 2, 9 s., e202101076.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Stochastic Bacterial Growth and Survival

    Svenningsen, Mikkel Skjoldan, 2020, Niels Bohr Institute, Faculty of Science, University of Copenhagen. 139 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  6. Udgivet

    Birth and Resuscitation of (p)ppGpp Induced Antibiotic Tolerant Persister Cells

    Svenningsen, Mikkel Skjoldan, Veress, A., Harms, A., Mitarai, Namiko & Semsey, S., 15 apr. 2019, I: Scientific Reports. 9, 13 s., 6056.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Gene Expression Changes with Minor Effects on the Population Average Have Major Effects on the Occurrence of Cells with Extreme Protein Concentrations

    Svenningsen, Mikkel Skjoldan, Semsey, S. & Mitarai, Namiko, 2019, I: mSphere. 4, 1, s. 1-6 e00575-18.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Commitment to lysogeny is preceded by a prolonged period of sensitivity to the late lytic regulator Q in bacteriophage Λ

    Svenningsen, Sine Lo & Semsey, S., 2014, I: Journal of Bacteriology. 196, 20, s. 3582-3588 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Texture of the upper 1000 m in the GRIP and NorthGRIP ice cores

    Svensson, Anders, Durand, G., Mathiesen, Joachim, Persson, A. & Dahl-Jensen, Dorthe, 2009, Low Temperature Science Supplement Issue: Physics of Ice Core Records II. Hondoh, T. (red.). Institute of Low Temperature Science, Hokkaido University, Sapporo Japan, Bind 68. s. 107-113 7 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Dynamics and stability in prebiotic information integration: an RNA World model from first principles

    Szilagyi, A., Konnyu, B. & Czaran, T., 9 jan. 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, 11 s., 51.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Ecology and evolution in the RNA world dynamics and stability of prebiotic replicator systems

    Szilágyi, A., Zachar, I., Scheuring, I., Könnyű, B. & Czárán, T., 2017, I: Life. 7, 4, 48.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    A scaling law of multilevel evolution: how the balance between within- and among-collective evolution is determined

    Takeuchi, N., Mitarai, Namiko & Kaneko, Kunihiko, 4 feb. 2022, I: Genetics. 220, 2, 9 s., 182.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    The Statistical Trends of Protein Evolution: A Lesson from AlphaFold Database

    Tang, Q., Ren, W., Wang, J. & Kaneko, Kunihiko, 7 okt. 2022, I: Molecular Biology and Evolution. 39, 10, 13 s., msac197.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Fast intra-fractional image-guidance with 6D positioning correction reduces delivery uncertainty for stereotactic radiosurgery and radiotherapy

    Tarnavski, N., Engelholm, S. A. & Munck af Rosenschöld, P. M., 2 aug. 2016, I: Journal of Radiosurgery and SBRT. 4, 1, s. 15-20

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Intermittent dislocation density fluctuations in crystal plasticity from a phase-field crystal model

    Tarp, J. M., Angheluta, L., Mathiesen, Joachim & Goldenfeld, N., 31 dec. 2014, I: Physical Review Letters. 113, 26, 265503.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Rotation-limited growth of three-dimensional body-centered-cubic crystals

    Tarp, J. M. & Mathiesen, Joachim, 2015, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 92, 1, 012409.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Enforced Scale Selection in Field Theories of Mechanical and Biological Systems

    Tarp, J. M., 2015, The Niels Bohr Institute, Faculty of Science, University of Copenhagen. 50 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  18. Udgivet

    Quantitative analysis of single particle trajectories: mean maximal excursion method

    Tejedor...[et al.], V., Benichou, O., Voituriez, R. & Oddershede, L. B., 7 apr. 2010, I: Biophysical Journal. 98, 7, s. 1364-1372 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Measurement of the spin-forbidden decay rate (3s3d)1D2¿(3s3p)3 P2,1 in 24Mg

    Therkildsen, K. T., Jensen, B. B., Ryder, C. P., Malossi, N. & Thomsen, Jan Westenkær, 2009, I: Physical Review A (Atomic, Molecular and Optical Physics). 79, 3, s. 034501 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Activity-induced instabilities of brain organoids

    Thijssen, K., Kusters, G. L. A. & Doostmohammadi, Amin, 7 dec. 2021, I: The European Physical Journal E: Soft Matter and Biological Physics. 44, 12, 8 s., 147.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Necking and failure of a particulate gel strand: signatures of yielding on different length scales

    Thijssen, Kristian, Liverpool, T. B., Royall, P. C. & Jack, R. L., 2023, I: Soft Matter. 19, 38, s. 7412-7428 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Active nematics with anisotropic friction: the decisive role of the flow aligning parameter

    Thijssen, K., Metselaar, L., Yeomans, J. M. & Doostmohammadi, Amin, 28 feb. 2020, I: Soft Matter. 16, 8, s. 2065-2074 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Binding self-propelled topological defects in active turbulence

    Thijssen, K. & Doostmohammadi, Amin, 13 okt. 2020, I: Physical Review Research. 2, 4, 6 s., 042008.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Is a constant low-entropy process at the root of glycolytic oscillations?

    Thoke, H. S., Olsen, L. F., Duelund, L., Stock, R. P., Heimburg, Thomas Rainer & Bagatolli, L. A., sep. 2018, I: Journal of Biological Physics. 44, 3, s. 419-431

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Model Study of the Pressure Build-Up during Subcutaneous Injection

    Thomsen, M., Hernandez Garcia, A., Mathiesen, Joachim, Poulsen, Mette Homann, Sørensen, D., Tarnow, L. & Feidenhans'l, Robert Krarup, 14 aug. 2014, I: PLoS ONE. 9, 8, e104054.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Decision Making in Biological Systems

    Tian, C., 2017, The Niels Bohr Institute, Faculty of Science, University of Copenhagen. 188 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  27. Udgivet

    Rapid Curtailing of the Stringent Response by Toxin-Antitoxin Encoded mRNases

    Tian, C., Roghanian, Mohammad, Jørgensen, M. G., Sneppen, Kim, Sørensen, Michael Askvad, Gerdes, K. & Mitarai, Namiko, jul. 2016, I: Journal of Bacteriology. 198, 14, s. 1918-1926

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Synchronized switching of multiple toxin-antitoxin modules by (p)ppGpp fluctuation

    Tian, C., Semsey, S. & Mitarai, Namiko, 21 aug. 2017, I: Nucleic Acids Research. 45, 14, s. 8180-8189 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Bifurcation of transition paths induced by coupled bistable systems

    Tian, C. & Mitarai, Namiko, 7 jun. 2016, I: The Journal of Chemical Physics. 144, 21, 215102.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Monte Carlo Methods Development and Applications in Conformational Sampling of Proteins

    Tian, P., 2014, The Niels Bohr Institute, Faculty of Science, University of Copenhagen.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  31. Udgivet

    Structure of a functional amyloid protein subunit computed using sequence variation

    Tian, P., Boomsma, Wouter, Wang, Y., Otzen, D., Jensen, Mogens Høgh & Lindorff-Larsen, Kresten, 2015, I: Journal of the American Chemical Society. 137, 1, s. 22–25 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    A Monte Carlo study of the early steps of functional amyloid formation

    Tian, P., Lindorff-Larsen, Kresten, Boomsma, Wouter, Jensen, Mogens Høgh & Otzen, D. E., 2016, I: P L o S One. 11, 1, 18 s., e0146096.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Robust estimation of diffusion-optimized ensembles for enhanced sampling

    Tian, P., Jónsson, S. Æ., Ferkinghoff-Borg, J., Krivov, S. V. .., Lindorff-Larsen, Kresten, Irbäck, A. & Boomsma, Wouter, 2014, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 10, 2, s. 543–553 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    What does evolution tell us about the structure of a functional amyloid protein?

    Tian, P., Boomsma, Wouter, Wang, Y., Otzen, D. E., Jensen, Mogens Høgh & Lindorff-Larsen, Kresten, 2015, I: Biophysical Journal. 108, 2, Supplement 1, s. 227a 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Oscillations and temporal signalling in cells

    Tiana, G., Krishna, S., Pigolotti, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2008, I: Physical Biology. 4, 2, s. R1-R17

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    The dynamics of genetic control in the cell: the good and bad of being late

    Tiana, G. & Jensen, Mogens Høgh, 28 sep. 2013, I: Philosophical Transactions. Series A : Mathematical, physical, and engineering science. 371, 1999; SI, 20120469.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Forging the flow of the quantum mechanical current in quantum dots

    Tighineanu, P., Stobbe, S. & Lodahl, Peter, 2014, Proceedings of the Nonlinear optics and excitation kinetics in semiconductors, Bremen, Germany. Bremen, Germany

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    probing electric and magnetic vacuum fluctuations with quantum dots

    Tighineanu, P., Sørensen, Anders Søndberg, Stobbe, S. & Lodahl, Peter, 2014, Nonlinear quantum optics : Workshop, Leiden, the Netherlands, 2014. Leiden, Netherlands

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Unraveling the Mesoscopic Character of Quantum Dots in Nanophotonics

    Tighineanu, P., Sørensen, Anders Søndberg, Stobbe, S. & Lodahl, Peter, 19 jun. 2015, I: Physical Review Letters. 114, 24, 247401.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Modelling value bubbles in an attention based economy

    Toftdahl Olesen, C. & Sneppen, Kim, 2 mar. 2020, I: European Physical Journal B. 93, 3, 5 s., 36.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Copulas for hydroclimatic analysis: A practice-oriented overview

    Tootoonchi, F., Sadegh, M., Härter, Jan Olaf Mirko, Raty, O., Grabs, T. & Teutschbein, C., mar. 2022, I: Wiley Interdisciplinary Reviews: Water. 9, 2, 28 s., 1579.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Uni- and multivariate bias adjustment methods in Nordic catchments: Complexity and performance in a changing climate br

    Tootoonchi, F., Härter, Jan Olaf Mirko, Todorovic, A., Raty, O., Grabs, T. & Teutschbein, C., 20 dec. 2022, I: Science of the Total Environment. 853, 18 s., 158615.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Hierarchy measures in complex networks

    Trusina, Ala, Maslov, S., Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 30 apr. 2004, I: Physical Review Letters. 92, 17, 178702.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    The unfolded protein response and translation attenuation: a modelling approach.

    Trusina, Ala & Tang, C., okt. 2010, I: Diabetes, Obesity and Metabolism Online. 12, s. 27-31

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Functional alignment of regulatory networks: a study of temperate phages

    Trusina, Ala, Sneppen, Kim, Dodd, I. B., Shearwin, K. E. & Egan, J. B., 2006, I: PLoS Computational Biology. 1, 7, s. 599-603

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Stress induced telomere shortening: longer life with less mutations?

    Trusina, Ala, 1 mar. 2014, I: B M C Systems Biology. 8, 27.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Translation attenuation mechanism in unfolded protein response

    Trusina, Ala, Papa, F. & Tang, C., 1 dec. 2008, Evolution from Cellular to Social Scales. Skjeltorp, A., Skjeltorp, A. & Belushkin, A. (red.). s. 83-90 8 s. (NATO Science for Peace and Security Series B: Physics and Biophysics).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Rationalizing translation attenuation in the network architecture of the unfolded protein response

    Trusina, Ala, Papa, F. R. & Tang, C., 23 dec. 2008, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 105, 51, s. 20280-20285

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Polar jets of swimming bacteria condensed by a patterned liquid crystal

    Turiv, T., Koizumi, R., Thijssen, K., Genkin, M. M., Yu, H., Peng, C., Wei, Q., Yeomans, J. M., Aranson, I. S., Doostmohammadi, Amin & Lavrentovich, O. D., 2 mar. 2020, I: Nature Physics. 16, 4, s. 481-487 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Human T cell responses to Japanese encephalitis virus in health and disease

    Turtle, L., Bali, T., Buxton, G., Chib, S., Chan, S., Soni, M., Hussain, M., Isenman, H., Fadnis, P., Venkataswamy, M. M., Satishkumar, V., Lewthwaite, P., Kurioka, A., Krishna, S., Shankar, M. V., Ahmed, R., Begum, A., Ravi, V., Desai, A., Yoksan, S. & 7 flere, Fernandez, S., Willberg, C. B., Kløverpris, Henrik Nyhus, Conlon, C., Klenerman, P., Satchidanandam, V. & Solomon, T., 2016, I: Journal of Experimental Medicine.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt