Biokompleksitet

  1. 2009
  2. Udgivet

    Variety in intracellular diffusion during the cell cycle

    Selhuber-Unkel, C., Yde, P., Berg-Sørensen, K. & Oddershede, L. B., 2009, I: Physical Biology. 6, 2, s. 025015

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Tracking cell-nanoparticle interactions

    Selhuber-Unkel, C. J. M., 1 dec. 2009, I: Journal of Biomedical Nanotechnology. 5, 6, Sp.Iss. Sl., s. 634-640 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Dominant negative autoregulation limits steady-state repression levels in gene networks

    Semsey, S., Krishna, S., Erdossy, J., Horvath, P., Orosz, L., Sneppen, Kim & Adhya, S., 2009, I: Journal of Bacteriology. 191, 14, s. 4487-4491 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Dynamics of the recovery from sRNA-mediated gene silencing

    Semsey, S., Bemjamin, J., Mitarai, Namiko, Krishna, S., Csiszovszki, Z., Sneppen, Kim & Masse, E., 2009, I: Cell Cycle. 8, 18, s. 2863-2864 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Nonideal behavior of intramolecular structure factor of dilute polymers in a theta solvent

    Shimomura, K., Nakanishi, H. & Mitarai, Namiko, 2009, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 80, 5, Part 1, s. 051804

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Modeling proteasome dynamics in Parkinson's disease

    Sneppen, Kim, Lizana, G. L., Jensen, Mogens Høgh, Pigolotti, S. & Otzen, D., 2009, I: Physical Biology. 6, 3, s. 036005

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Texture of the upper 1000 m in the GRIP and NorthGRIP ice cores

    Svensson, Anders, Durand, G., Mathiesen, Joachim, Persson, A. & Dahl-Jensen, Dorthe, 2009, Low Temperature Science Supplement Issue: Physics of Ice Core Records II. Hondoh, T. (red.). Institute of Low Temperature Science, Hokkaido University, Sapporo Japan, Bind 68. s. 107-113 7 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Measurement of the spin-forbidden decay rate (3s3d)1D2¿(3s3p)3 P2,1 in 24Mg

    Therkildsen, K. T., Jensen, B. B., Ryder, C. P., Malossi, N. & Thomsen, Jan Westenkær, 2009, I: Physical Review A (Atomic, Molecular and Optical Physics). 79, 3, s. 034501 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Dynamics of uptake and metabolism of small molecules in cellular response systems

    Werner, M., Semsey, S., Sneppen, Kim & Krishna, S., 2009, I: PLoS ONE. 4, 3, s. e4923

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    The thermodynamics of lipid ion channel formation in the absence and presence of anesthetics. BLM experiments and simulations

    Wodzinska, K., Blicher, A. & Heimburg, Thomas Rainer, 2009, I: Soft Matter. 5, 17, s. 3319-3330 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Phase-state dependent current fluctuation in pure lipid membranes

    Wunderlich, B., Leirer, C. & Heimburg, Thomas Rainer, 2009, I: Biophysical Journal. 96, 11, s. 4592-4597 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. 2008
  14. Udgivet

    Single-file dynamics with different diffusion constants

    Ambjornsson, T., Silbey, R. J., Lizana, G. L. & Lomholt, M. A., 2008, I: Journal of Chemical Physics. 129, 18, s. 185106

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    One hub-one process: a tool based view on regulatory network topology

    Axelsen, J. B., Bernhardsson, S. & Sneppen, Kim, 4 mar. 2008, I: BMC Systems Biology. 2, s. 25

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    The cost and capacity of signaling in the Escherichia coli proetin reaction network

    Axelsen, J. B., Krishna, S. & Sneppen, Kim, 24 jan. 2008, I: Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. s. P010018

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Development of radiotracers for Vps10p domain (neurotensin-3) receptors

    Bender, D., Horvath, G., Jansen, P., Olsen, A. K. & Gjedde, Albert, 2008, I: NeuroImage. 41, Suppl. 2, s. T89-T89

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    A quantitative analysis of contractility in active cytoskeletal protein networks

    Bendix, Poul Martin, Koenderink, G. K., Cuvelier, D., Dogic, Z., Koelemann, B. N., Brieher, W. M., Field, C. M., Mahadevan, L. & Weitz, D. A., 15 apr. 2008, I: Biophysical Journal. 94, 8, s. 3126-3136 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Quantitative force calibration in viscoelastic media and living cells: 32nd Congress of the Federation of European Biochemical Societies. July 07-12 Vienna, Austria

    Berg-Sørensen, K., Fischer, M., Richardson, A. C., Seyyed Reihani, S. N. & Oddershede, L. B., 2008, I: FEBS Journal. 274, Suppl. 1, s. 299-299

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    The temperature depencence  and quantized nature of lipid membrane permeability

    Blicher, A., Wodzinska, K., Fidorra, M., Winterhalter, M. & Heimburg, Thomas Rainer, 2008, I: Biophysical Journal. 96, 3, s. 160a-

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Efficient optical trapping and visualization of silver nano-particles

    Bosanac, L., Aabo, T., Bendix, Poul Martin & Oddershede, L. B., 2008, I: Nano Letters. 8, 5, s. 1486–1491 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Efficient optical trapping and visualization of silver nanoparticles

    Bosanac, L., Aabo, T., Bendix, Poul Martin & Oddershede, L. B., 2008, I: Nano Letters. 8, 5, s. 1486-1491 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Faf1 is expressed during neurodevelopment and is involved in Apaf1-dependent caspase-3 activation in proneural cells

    De Zio, D., Ferraro, E., D'Amelio, M., Simoni, V., Bordi, M., Soroldoni, D., Berghella, L., Meyer, B. I. & Cecconi, F., jun. 2008, I: Cellular and Molecular Life Sciences. 65, 11, s. 1780-1790 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Gene duplication models for directed networks with limits on growth

    Enemark, J. & Sneppen, Kim, 2008, I: Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. 2007, s. P11007

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Validation of calibration method in complex media

    Fischer, M., Richardson, A. C., Seyyed Reihani, S. N., Oddershede, L. B. & Berg-Sørensen, K., 2008, Proceedings, SPIE. SPIE - International Society for Optical Engineering, Bind 7038. s. 703822

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Stability of a sonoluminescing nitrogen bubble in chilled water

    Holzfuss, J. & Levinsen, Mogens, 2008, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 77, 4, s. 046304 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Anomalous fluctuations in sliding motion of cytoskeletal filaments driven by molecular motors: Model simulations

    Imafuku, Y., Mitarai, Namiko, Tawada, K. & Nakanishi, H., 7 feb. 2008, I: Journal of Physical Chemistry Part B: Condensed Matter, Materials, Surfaces, Interfaces & Biophysical. 112, 5, s. 1487-1493

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Thermodynamics of the nervous impulse

    Jackson, Andrew D. & Heimburg, Thomas Rainer, 2008, Structure and dynamics of membranous interfaces. Nag, K. (red.). New York: Wiley, s. 317-340 24 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  29. Udgivet

    Dynamical genetic regulation

    Jensen, Mogens Høgh, Krishna, S., Sneppen, Kim & Tiana, G., 2008, Springer. (Evolution from cellular to social scales, book series: Nato security through science series B: Physics and biophysics.Conference of the Nato-advanced study institute on evolution from cellular to social scales geilo, Norway april 10-20,2007, p.61-68.).

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportBogForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Komolgorov scaling from random force fields

    Jensen, Mogens Høgh, Sneppen, Kim & Angheluta, L., 2008, I: EPL. 84, 1, s. 10011 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Single-molecule observations of topotecan-mediated Top1B activity at a unique DNA sequence

    Koster, D. A., Czerwinski, F. & Halby, L., 2008, I: Nucleic Acids Research. 36, s. 2301-2310 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Signalling and Feedback in Biological Networks

    Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2008, Dynamics on and of Complex Networks: Applications to Biology, computer Sciences, and the Social Sciences ( Modeling and Simulation in Sciences, Engineering and Technolo). Ganguly, N., Deutsch, A. & Mukherjee, A. (red.). Birkhäuser Verlag, s. Part 1 ( Biological Sciences)

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  33. Udgivet

    A quantitative analysis of indicators of scientific performance

    Lehmann, S., Jackson, Andrew D. & Lautrup, B. E., 2008, I: Scientometrics. 76, 2, s. 369-390 22 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Dimensions, maximal growth sites, and optimization in the dielectric breakdown model

    Mathiesen, J., Jensen, Mogens Høgh & Bakke, J. O. H., 2008, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 77, 6, s. 066203

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Elasticity with arbitrarily shaped inhomogeneity

    Mathiesen, Joachim, Procaccia, I. & Regev, I., 26 feb. 2008, I: Physical Review E. 77, 2, 026606.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Real-time redox measurements during endoplasmic reticulum stress reveal interlinked protein folding functions

    Merksamer, P., Trusina, Ala & Papa, F., 20 nov. 2008, I: Cell. 135, 5, s. 933-947

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Ribosome collisions and Translation efficiency: Optimization by codon usage and mRNA destabilization

    Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Pedersen, Steen, 2008, I: Journal of Molecular Biology. 382, 1, s. 236-245 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    The generation of promoter-mediated transcriptional noise in bacteria

    Mitarai, Namiko, Dodd, I. B., Crooks, M. T. & Sneppen, Kim, 11 jul. 2008, I: PLoS Computational Biology. 4, 7, s. e 10000109

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Dynamical analysis on gene activity in the presence of repressors and an interfering promoter

    Nakanishi, H., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 1 nov. 2008, I: Biophysical Journal. 95, 9, s. 4228-4240

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Mode locking of a driven Bose-Einstein condensate

    Nicolin, A., Carretero-González, R. & Jensen, Mogens Høgh, 2008, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 75, 3, s. 036208

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Resonant energy transfer in Bose-Einstien condensates

    Nicolin, A., Jensen, Mogens Høgh, Thomsen, Jan Westenkær & Carretero-Gonxález, R., 2008, I: Physica D : Non-linear Phenomena. 237, 19, s. 2476-2481

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Brownian Warps for Non-Rigid Registration

    Nielsen, Mads, Johansen, P., Jackson, Andrew D., Lautrup, B. E. & Hauberg, S., 2008, I: Journal of Mathematical Imaging and Vision. 31, 2-3, s. 221-231 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Missing levels in acoustic resonators

    Noguetira, T. N., Sartorelli, J. C., Pato, M. P. & Ellegaard, Clive Sigurd, 1 nov. 2008, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 78, 5, part 2, 055201.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Optical tweezers techniques

    Oddershede, L. B., 2008, Handbook of Molecular Biophysics: Methods and Applications. Bohr, H. G. (red.). 1. ed. udg. Berlin: Wiley-VCH, Bind Chapter 6. s. Chapter 6

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  45. Udgivet

    Lipid membrane domain formation and alamethicin aggregation studied by calorimetry, sound velocity measurements, and atomic force microscopy

    Oliynyk, V., Jäger, M., Heimburg, Thomas Rainer, Buckin, V. & Kaatze, U., 2008, I: Biophysical Chemistry. 134, 3, s. 168-177 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Three-dimensional optical control of individual quantum dots

    Jauffred, Liselotte, Richardson, A. C. & Oddershede, L. B., 2008, I: Nano Letters. 8, 10, s. 3376-3380

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Identification of Quaternary Structure and functional domains of the CI repressor from Bacteriophage TP901-1

    Pedersen, M., Lo Leggio, Leila, Grossmann, J. G., Larsen, Sine & Hammer, K., 2008, I: Journal of Molecular Biology. 373, s. 983-996

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    The Role of MOR and the CI operator sites on the genetic switch temperate bacteriophage TP901-1

    Pedersen, M. & Hammer, K., 9 dec. 2008, I: Journal of Molecular Biology. 384, 3, s. 577-589

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Oscillation patterns in negative feedback loops

    Pigolotti, S., Krishna, S. & Jensen, Mogens Høgh, 2008, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 104, 16, s. 6533-6537

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Optical tweezers cause physiological damage to Escherichia coli and Listeria bacteria

    Rasmussen, M. B., Oddershede, L. B. & Siegumfeldt, H., 2008, I: Applied and Environmental Microbiology. 74, 8, s. 2441-2446

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  51. Udgivet

    Non-harmonic potential of a single beam optical trap

    Richardson, A. C., S. Reihani, S. N. & Oddershede, L. B., 2008, I: Optics Express. 16, 20, s. 15709-15717 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  52. Udgivet

    Amplitude equation and long-rang interactions in underwater sand ripples in one dimension

    Schnipper, T., Mertens, K., Ellegaard, Clive Sigurd & Bohr, T., 1 okt. 2008, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 78, 4, 047301.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt