Biokompleksitet

  1. 2008
  2. Udgivet

    The Role of MOR and the CI operator sites on the genetic switch temperate bacteriophage TP901-1

    Pedersen, M. & Hammer, K., 9 dec. 2008, I: Journal of Molecular Biology. 384, 3, s. 577-589

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Oscillation patterns in negative feedback loops

    Pigolotti, S., Krishna, S. & Jensen, Mogens Høgh, 2008, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 104, 16, s. 6533-6537

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Optical tweezers cause physiological damage to Escherichia coli and Listeria bacteria

    Rasmussen, M. B., Oddershede, L. B. & Siegumfeldt, H., 2008, I: Applied and Environmental Microbiology. 74, 8, s. 2441-2446

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Non-harmonic potential of a single beam optical trap

    Richardson, A. C., S. Reihani, S. N. & Oddershede, L. B., 2008, I: Optics Express. 16, 20, s. 15709-15717 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Amplitude equation and long-rang interactions in underwater sand ripples in one dimension

    Schnipper, T., Mertens, K., Ellegaard, Clive Sigurd & Bohr, T., 1 okt. 2008, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 78, 4, 047301.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Quantitative optical trapping of single gold nanorods

    Selhuber-Unkel, C., Zins, I., Schubert, O., Soennichsen, C. & Oddershede, L. B., 2008, I: Nano Letters. 8, 9, s. 2998-3003

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Ultrasensitive gene regulation by positive feedback loops in nucleosome modification

    Sneppen, Kim, Micheelsen, M. A. & Dodd, I. B., 15 apr. 2008, I: Molecular Systems Biology. 4, s. 182

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Oscillations and temporal signalling in cells

    Tiana, G., Krishna, S., Pigolotti, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2008, I: Physical Biology. 4, 2, s. R1-R17

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Rationalizing translation attenuation in the network architecture of the unfolded protein response

    Trusina, Ala, Papa, F. R. & Tang, C., 23 dec. 2008, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 105, 51, s. 20280-20285

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Translation attenuation mechanism in unfolded protein response

    Trusina, Ala, Papa, F. & Tang, C., 1 dec. 2008, Evolution from Cellular to Social Scales. Skjeltorp, A., Skjeltorp, A. & Belushkin, A. (red.). s. 83-90 8 s. (NATO Science for Peace and Security Series B: Physics and Biophysics).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  12. 2007
  13. Udgivet

    Cellers nano-mekanik

    Berg-Sørensen, K., Fisher, M., Bendix, Poul Martin & Oddershede, L. B., 2007, I: Kvant. 2007, 1, s. 4-6 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelFormidling

  14. Udgivet

    Theoretical analysis of epigenetic cell memory by nucleosome modification

    Dodd, I. B., Micheelsen, M. A., Sneppen, Kim & Thon, Genevieve, 2007, I: Cell. 129, 4, s. 813-22 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Modelling transcriptional interference and DNA looping in gene regulation

    Dodd, I. B., Shearwin, K. & Sneppen, Kim, 2007, I: Journal of Molecular Biology. 369, 5, s. 1200-1213

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Melting of single lipid components in binary lipid mixtures: A comparison between FTIR spectroscopy, DSC and Monte Carlo simulations

    Fidorra, M., Heimburg, Thomas Rainer & Seeger, H. M., 2007, I: arXiv.org: Physics. arXiv:0712.0064, 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

  17. Udgivet

    Pores in artificial membranes composed of binary lipid mixtures

    Fidorra, M., Winterhalter, M., Bagatolli, L. A. & Heimburg, Thomas Rainer, 2007, I: Biophysical Journal. s. 610A-610A

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Calibration of trapping force and response function of optical tweezers in viscoelastic media

    Fischer, M. & Berg-Sørensen, K., 2007, I: Journal of Optics A: Pure and Applied Optics (Print Edition). 9, 8, Sp. Iss. SI, s. S239-S250

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Pulses and chaos: dynamical response in a simple genetic

    Fonslet, J., Rud-Petersen, K., Krishna, S. & Jensen, Mogens Høgh, 2007, I: International Journal of Modern Physics B. 21, 23-24, s. 4083-4090

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Correlation between mechanical strength of messenger RNA pseudoknots and ribosomal frameshifting.

    Hansen, T. M., Reihani, S. N. S., Oddershede, L. B. & Sørensen, Michael Askvad, 2007, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 104, 14, s. 5830-5 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Frustration driven stock market dynamics: Leverage effect and asymmetry

    Heden Ahlgren, P. T., Jensen, Mogens Høgh, Simonsen, I., Donangelo, R. & Sneppen, Kim, 2007, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 383, 1, s. 1-4 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Combinatorics of feedback in cellular uptake and metabolism of small molecules

    Krishna, S., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2007, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 52, s. 20815-20819

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    UV-induced mutagenesis in Escherichia coli SOS response: A quantitative model

    Krishna, S., Maslov, S. & Sneppen, Kim, 2007, I: PLoS Computational Biology. 3, 3, s. 451-462

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Spreading out of perturbations in reversible reaction networks

    Maslov, S., Sneppen, Kim & Ispolatov, I., 2007, I: New Journal of Physics. 9, 273

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Efficient degradation and expression prioritization with small RANs

    Mitarai, Namiko, Andersson, A. M. C., Krishna, S., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2007, I: Physical Biology. 4, 3, s. 164-171

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Velocity correlations in dense granular shear flows: Effects on energy dissipation and normal stress

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 2007, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 75, 3, s. 031305

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Mutational analysis of the activator of late transcription, alt, in the lactococcal bacteriophage TP901-1

    Pedersen, M. & Hammer, K., 27 okt. 2007, I: Archives of Virology. 152, 2, s. 305-320 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Network formation of DMPG dispersions studied by light scattering, SANS, SAXS and calorimetry

    Preu, J., Gutberiet, T. & Heimburg, Thomas Rainer, 2007, I: Chemistry and Physics of Lipids. Suppl. S, s. S40-S40

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Extending the lateral trapping force of optical tweezers - art. no. 664420

    Richardson, A. C., Seyyed Reihani, S. N. & Oddershede, L. B., 2007, PROCEEDINGS OF THE SOCIETY OF PHOTO-OPTICAL INSTRUMENTATION ENGINEERS: OPTICAL TRAPPING AND OPTICAL MICROMANIPULATION IV. SPIE - International Society for Optical Engineering, Bind 6644. s. 64420-64420

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Networks and our limited information horizon

    Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 2007, I: International Journal of Bifurcation and Chaos in Applied Sciences and Engineering. 17, 7, s. 2509-2515

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Signal integration in the galactose network of Escherichia coli

    Semsey, S., Krishna, S., Sneppen, Kim & Adhya, S., 2007, I: Molecular Microbiology. 65, 2, s. 465-476

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Fear and its implications for stock markets

    Simonsen, I., Ahlgren, P. H., Jensen, Mogens Høgh, Danangelo, R. & Sneppen, Kim, 2007, I: European Physical Journal B. Condensed Matter and Complex Systems. 57, 2, s. 153-158

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    A universal power law and proportionate change process characterize the evolution of metabolic networks

    Singh, S., Samal, A., Giri, V. & Krishna, S., 2007, I: European Physical Journal B. Condensed Matter and Complex Systems. 57, 1, s. 75-80

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Modeling the two-hybrid detector: Experimental bias on protien interaction networks

    Stibius, K. & Sneppen, Kim, 2007, I: Biophysical Journal. 93, 7, s. 2562-2566

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. 2006
  36. Udgivet

    Degree landscapes in scale-free networks

    Axelsen, J. B., Bernhardsson, S., Rosvall, M., Sneppen, Kim & Trusina, Ala, sep. 2006, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 74, 3

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Tweezercalib 2.1: faster version of MatLab package for precise calibration of optical tweezers

    Bendix, Poul Martin, Tolic-Nørrelykke, I. M., Flyvbjerg, H. K. & Berg-Sørensen, K., 15 okt. 2006, I: Computer Physics Communications. 174, 8, s. 572-573

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Tweezercalib 2.1: faster version of MatLab package for precise calibration of optical tweezers

    Bendix, Poul Martin, Tolic-Nørrelykke, I. M., Flyvbjerg, H. & Sørensen, K. B., 2006, I: Computer Physics Communications. 175, 18, s. 572-573 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    tweezercalib 2.0: faster version of Matlab package for precise calibration of optical tweezers

    Bendix, Poul Martin, Tolic-Nørrelykke, I. M., Flyvbjerg, H. & Berg-Sørensen, K., 2006, I: Computer Physics Communications. 174, 6, s. 518-520 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Longevity of orders in related to the longevity of their constituent genera rather then genus richness

    Bornholdt, S., Sneppen, Kim & Westphal, H., 2006, I: Theory in Biosciences. 128, 2, s. 75-83 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Broad distribution of stick-slip events in slowly sheared granular media: Table-top production of a Gutenberg-Richter-like distribution

    Bretz, M., Zaretzki, R., Field, S., Mitarai, Namiko & Nori, F., 2 jun. 2006, I: EPL. 74, 6, s. 1116-1122

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Quantitative approach to small-scale nonequilibrium systems

    Dreyer, J. K., Berg-Sørensen, K. & Oddershede, L., 2006, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 73, 5 Pt 1, s. 051110

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Diffusion, fragmentation and merging process in ice crystals, alpha helices and other systems

    Ferkinghoff-Borg, J., Jensen, Mogens Høgh, Olesen, Poul & Mathiesen, Joachim, 2006, I: NATO Science Series : Sub Series III, Computer and sytems sciences. s. 61-70

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Survey of scaling surfaces

    Hansen, A. & Mathiesen, Joachim, 5 okt. 2006, Modelling Critical and Catastrophic Phenomena in Geoscience: A Statistical Physics Approach. Springer, Bind 705. s. 93-110 18 s. (Lecture Notes in Physics, Bind 705).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Combining confocal microscopy with precise force-scope optical tweezers

    Hansen, T. M., Seyyed Reihani, S. N. & Oddershede, L. B., 2006, I: NATO Science Series : Sub-Series II, Mathematics, Physics and Chemistry. s. 163-173

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceartikelForskning

  46. Udgivet

    Analytical approach to continuous and intermittent bottleneck flows

    Helbing, D., Johansson, A., Mathiesen, Joachim, Jensen, Mogens Høgh & Hansen, A. C., 2006, I: Physical Review Letters. 97, 16, s. 168001 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Optimal investment horizons for stocks and markets

    Johansen, A., Simonsen, I. & Jensen, Mogens Høgh, 2006, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 1, s. 64-67

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Structure and function of negative feedback loops at the interface of genetic and metabolic networks

    Krishna, S., Andersson, A. M. C., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, 8, s. 2455-2462

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Response varibility in balanced cortical networks

    Lerchner..[et al.], A., Ursta, C. & Hertz, John, 2006, I: Neural Computation. 18, 3, s. 634-659

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Wet granular materials

    Mitarai, Namiko & Nori, F., 30 jun. 2006, I: Advances in Physics. 55, 1-2, s. 1-45 45 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  51. Udgivet

    Network models of phage-bacteria coevolution

    Rosvall, M., Dodd, I. B., Krishna, S. & Sneppen, Kim, 2006, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 74, 6, s. 066105

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  52. Udgivet

    Low degree metabolites explain essential reactions and enhance modularity in biological networks

    Samal...[et al.], A. & Krishna, S., 2006, I: BMC Bioinformatics. 7, 118

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  53. Udgivet

    A communication perspective on network topologies

    Sneppen, Kim & Rosvall, M., 2006, I: Progress of Theoretical Physics. Supplement. s. 103-118

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceartikelForskningfagfællebedømt