Biokompleksitet

  1. 2012
  2. Udgivet

    Compaction of porous rock by dissolution on discrete stylolites: A one-dimensional model

    Angheluta, L., Mathiesen, Joachim & Aharonov, E., 10 aug. 2012, I: Journal of Geophysical Research: Biogeosciences. 117, s. B08203 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    IRE1 alpha Induces Thioredoxin-Interacting Protein to Activate the NLRP3 Inflammasome and Promote Programmed Cell Death under Irremediable ER Stress

    Lerner, A. G., Upton, J., Praveen, P. V. K., Ghosh, R., Nakagawa, Y., Igbaria, A., Shen, S., Nguyen, V., Bradley, B. J., Heiman, M. & Trusina, Ala, 8 aug. 2012, I: Cell Metabolism. 16, 2, s. 250-264 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Spatial Structure and Lamarckian Adaptation Explain Extreme Genetic Diversity at CRISPR Locus

    Härter, Jan Olaf Mirko & Sneppen, Kim, 1 aug. 2012, I: mBio. 3, 4, s. e00126

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Coexistence of phage and bacteria on the boundary of self-organized refuges

    Heilmann, Silja, Sneppen, Kim & Krishna, S., 31 jul. 2012, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 109, 31, s. 12828-33 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Coexistence of phage and bacteria on the boundary of self-organized refuges

    Heilmann, Silja, Sneppen, Kim & Krishna, S., 31 jul. 2012, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 109, 31, s. 12828-12833

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Emergence of diversity in a model ecosystem

    Mitarai, Namiko, Mathiesen, Joachim & Sneppen, Kim, 30 jul. 2012, I: Physical Review E. Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics. 86, 1, s. 011929 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Formation of martian araneiforms by gas-driven erosion of granular material

    de Villiers, S., Nermoen, A., Jamtveit, B., Mathiesen, Joachim, Meakin, P. & Werner, S. C., 2 jul. 2012, I: Geophysical Research Letters. 39, s. L13204 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Clonal selection prevents tragedy of the commons when neighbors compete in a rock-paper-scissors game

    Juul, J. S., Sneppen, Kim & Mathiesen, Joachim, 26 jun. 2012, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 85, 6, s. 061924 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Inducing phase-locking and chaos in cellular oscillators by modulating the driving stimuli

    Jensen, Mogens Høgh & Krishna, S., 4 jun. 2012, I: FEBS Letters. 586, 11, s. 1664-1668

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Fluctuation-dissipation relations under Levy noises

    Dybiec, B. M., Parrondo, J. M. R. & Gudowska-Nowak, E., 1 jun. 2012, I: EPL. 98, 5, s. 50006

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Information spreading and development of cultural centers

    Dybiec, B. M., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 18 maj 2012, I: Physical Review E. Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics. 85, 5, s. 056116 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Fragile DNA Repair Mechanism Reduces Ageing in Multicellular Model

    Bendtsen, K. M., Juul, J. S. & Trusina, Ala, 2 maj 2012, I: P L o S One. 7, 5, s. e36018

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Population dynamics in compressible flows

    Benzi, R., Jensen, Mogens Høgh, Nelson, D. R., Perlekar, P., Pigolotti, S. & Toschi, F., 17 apr. 2012, I: European Physical Journal. Special Topics. 204, 1, s. 57-74

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Conditional Cooperativity in Toxin-Antitoxin Regulation Prevents Random Toxin Activation and Promotes Fast Translational Recovery

    Cataudella, I., Trusina, Ala, Sneppen, Kim, Gerdes, K. & Mitarai, Namiko, 11 apr. 2012, I: Nucleic Acids Research. 40, 14, s. 6424-6434

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Heat flow in chains driven by thermal noise

    Fogedby, H. C. & Imparato, A., 5 apr. 2012, I: Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. 2012, s. P04005

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Diffusion inside living human cells

    Leijnse, N., Jeon, J. -., Loft, Steffen, Metzler, R. & Oddershede, L. B., 1 apr. 2012, I: European Physical Journal. Special Topics. 204, 1, s. 75-84 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Population Genetics in Compressible Flows

    Pigolotti, S., Benzi, R., Jensen, Mogens Høgh & Nelson, D. R., 23 mar. 2012, I: Physical Review Letters. 108, 12, s. 128102 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Correction to; Why Do Phage Play Dice? (vol 83, pg 11416, 2009)

    Avlund, M., Dodd, I. B., Semsey, S., Sneppen, Kim & Krishna, S., 1 mar. 2012, I: Journal of Virology. 86, 5, s. 22898-2898 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Equilibrium Strategy and Population-Size Effects in Lowest Unique Bid Auctions

    Pigolotti, S., Bernhardsson, P. J. S., Juul, J. S., Galster, G. & Vivo, P., 22 feb. 2012, I: Physical Review Letters. 108, 8, s. 088701 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Protein Localization with Flexible DNA or RNA

    Bernhardsson, P. J. S., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 10 feb. 2012, I: PLoS.ONE.. 7, 2, s. e29218

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Segregation in water-based stable single-bubble sonoluminescence

    Levinsen, Mogens, 13 jan. 2012, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 85, 1, Part 2, s. 016309 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Fluid dynamics of dilatant fluid

    Nakanishi, H., Nagahiro, S. & Mitarai, Namiko, 12 jan. 2012, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 85, 1, s. 011401 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Nested feedback loops in gene regulation

    Mengel, A. B., Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh & Trusina, Ala, 1 jan. 2012, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 391, 1-2, s. 100-106

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    A comparison of the Hodgkin-Huxley model and the soliton theory for the action potential in nerves

    Appali, R., van Rienen, U. & Heimburg, Thomas Rainer, 2012, I: Advances in Planar Lipid Bilayers and Liposomes. 16, s. 275-299

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    A simple histone code opens many paths to epigenetics

    Sneppen, Kim & Dodd, I. B., 2012, I: P L o S Computational Biology. 8, 8, 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Biological systems on a small scale

    Pedersen, L., 2012, Center for Ice & Climate: Faculty of Science, University of Copenhagen. 184 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  28. Udgivet

    Coexistence, cooperation and communication: modeling the complex lives of bacteria

    Heilmann, Silja, 2012, Københavns Universitet, Niels Bohr Institute udg. København, Danmark. 222 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  29. Udgivet

    Comparing ion conductance recordings of synthetic lipid bilayers with cell membranes containing TRP channels

    Laub, K. R., Witschas, K., Blicher, A., Madsen, S. B., Lückhoff, A. & Heimburg, Thomas Rainer, 2012, I: BBA General Subjects. 1818, 5, s. 1123-1134

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Danske Universiteter 2020: Hvidbog til Forskningspolitisk årsmøde 2012, Det Kongelige Danske Videnskabernes Selskab

    Bache, C., Christiansen, F. B., Løkke, Anne, Smith, N. & Sneppen, Kim, 2012, Det Kongelige Danske Videnskabernes Selskab. 50 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportRapportRådgivning

  31. Udgivet

    Effect of coupling asymmetry on mean-field solutions of the direct and inverse Sherrington-Kirkpatrick model

    Sakellariou, J., Roudi, Y., Mezard, M. & Hertz, John, 2012, I: Philosophical Magazine. 92, 1-3, s. 272-279 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Granular flow: dry and wet

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 2012, I: European Physical Journal. Special Topics. 204, 1, s. 5-17 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Large-Scale Orientation Dependent Heating from a Single Irradiated Gold Nanorod

    Ma, H., Bendix, Poul Martin & Oddershede, L. B., 2012, I: Nano Letters. 12, 8, s. 3954-3960 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Low frequency sound propagation in lipid memembranes

    Mosgaard, L. D., Heimburg, Thomas Rainer & Jackson, Andrew D., 2012, Advances in Planar Lipid Bilayers and Liposomes. Elsevier, Bind 16. s. 51-74 24 s. (Advances in Planar Lipid Bilayers and Liposomes).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Multiple Roles of Heparin in the Aggregation of p25 alpha

    Nielsen, S. B., Yde, Pernille, Giehm, L., Sundbye, S., Christiansen, G., Mathiesen, Joachim, Jensen, Mogens Høgh, Jensen, P. H. & Otzen, D. E., 2012, I: Journal of Molecular Biology. 421, 4-5, Part 2, s. 601-615

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Organic-inorganic nanocomposite gels as an in situ gelation biomaterial for injectable accommodative intraocular lens

    Annaka, M., Mortensen, Kell, Matsuura, T., Ito, M., Nochioka, K. & Ogata, N., 2012, I: Soft Matter. 8, 27, s. 7185-7196 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Physics of non-equilibrium membranes

    Feld, K. E., 2012, Biophysics-Membranes: Faculty of Science, University of Copenhagen. 134 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  38. Udgivet

    Soliton collision in biomembranes and nerves - A stability study.

    Appali, R., Lautrup, B. E., Heimburg, Thomas Rainer & van Rienen, U., 2012, I: Journal of Mathematics in Industry. 16, s. 205-212

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    mRNA pseudoknot structures can act as ribosomal roadblocks

    Hansen, J. T., Oddershede, L. B. & Sørensen, Michael Askvad, 2012, I: Nucleic Acids Research. 40, 1, s. 303-313 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. 2011
  41. Udgivet

    Barriers and Silencers: A Theoretical Toolkit for Control and Containment of Nucleosome-Based Epigenetic States

    Dodd, I. B. & Sneppen, Kim, 9 dec. 2011, I: Journal of Molecular Biology. 414, 4, s. 624-637

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    AC Losses in Bi(2)Sr(2)Ca(2)Cu(3)O(10+x) Tapes and a 3.15-m-Long Single-Phase Cable

    Juul, J. S., Molgaard, E. T., Jensen, Jens, Andersen, N. H., Abrahamsen, A. B. & Traeholt...[et al.], C., 1 dec. 2011, I: IEEE Transactions on Applied Superconductivity. 21, 6, s. 3599-3603

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Effect of Surface Morphology on the Dissipation During Shear and Slip Along a Rock-Rock Interface that Contains a Visco-elastic Core

    Angheluta, L., Candela, T., Renard, F. & Mathiesen, Joachim, 1 dec. 2011, I: Pure and Applied Geophysics. 168, 12, s. 2335-2344

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Expanding the Optical Trapping Range of Lipid Vesicles to the Nanoscale

    Bendix, Poul Martin & Oddershede, L. B., 1 dec. 2011, I: Nano Letters. 11, 12, s. 5431-5437

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Analyzing inflammatory response as excitable media

    Yde, Pernille, Jensen, Mogens Høgh & Trusina, Ala, 18 nov. 2011, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 84, 5, Part 1, s. 051913

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    On the contribution of statistical bias correction to the uncertainty in the projected hydrological cycle

    Chen, C., Härter, Jan Olaf Mirko, Hagemann, S. & Piani, C., 26 okt. 2011, I: Geophysical Research Letters. 38, s. L20403

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Ecosystems with Mutually Exclusive Interactions Self-Organize to a State of High Diversity

    Mathiesen, Joachim, Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Trusina, Ala, 25 okt. 2011, I: Physical Review Letters. 107, 18, s. 188101

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Vesicle Fusion Observed by Content Transfer across a Tethered Lipid Bilayer

    Rawle, B., Lengerich, B., Cheung, M., Bendix, Poul Martin & Boxer, S., 19 okt. 2011, I: Biophysical Journal. 101, 8, s. L37-L39 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Dickkopf1 - a new player in modelling the wnt pathway

    Pedersen, L., Krishna, S. & Jensen, Mogens Høgh, 12 okt. 2011, I: P L o S Computational Biology. 6, 10, s. e25550

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Conformation Regulation of the X Chromosome Inactivation Center: a model

    Scialdone, A., Cataudella, I., Barbieri, M. & Nicodemi, M., 1 okt. 2011, I: P L o S Computational Biology. 7, 10, s. e1002229

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  51. Udgivet

    Significant improvement of optical traps by tuning standard water immersion objectives

    Seyyed Reihani, S. N., Richardson, A. C. & Oddershede, L. B., 1 okt. 2011, I: Journal of Optics. 13, 10, s. 105301

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  52. Udgivet

    Locally self-organized quasicritical percolation in a multiple-disease model

    Juul, J. S. & Sneppen, Kim, 30 sep. 2011, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 84, 3, s. 0036119 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt