Biokompleksitet

  1. 2009
  2. Udgivet

    Gliomas induce and exploit microglial MT1-MMP expression for tumor expansion

    Markovic, D. S., Vinnakota, K., Chirasani, S., Synowitz, M., Raguet, H., Stock, K., Sliwa, M., Lehmann, S., Kälin, R., van Rooijen, N., Holmbeck, Kenn, Heppner, F. L., Kiwit, J., Matyash, V., Lehnardt, S., Kaminska, B., Glass, R. & Kettenmann, H., 28 jul. 2009, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106, 30, s. 12530-5 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Variety in intracellular diffusion during the cell cycle

    Selhuber-Unkel, C., Yde, Pernille, Berg-Sorensen, K. & Oddershede, L. B., jun. 2009, I: Physical Biology. 6, 2, 9 s., 025015.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    A versatile approach to beta-amyloid fibril-binding compounds exploiting the Shirakawa/Hayashi protocol for trans-alkene synthesis

    Huynh, Tri Hien Viet, Mantel, M. L. H., Mikkelsen, K., Lindhardt, A. T., Nielsen, N. C., Otzen, D. & Skrydstrup, T., 19 feb. 2009, I: Organic Letters. 11, 4, s. 999-1002 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    A spatial model of tumor-host interaction: application of chemotherapy

    Hinow, P., Gerlee, P. D. M., McCawley, L. J. & Quaranta, V., 2009, I: Mathematical Biosciences and Engineering. 6, 3, s. 521-546 24 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Comment on "Citation Statistics" by joint committee on quantitative assessment of research

    Lehmann, S., Lautrup, B. E. & Jackson, Andrew D., 2009, I: Statistical Science. 24, 1, s. 17-20 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Confocal microscopy of thick specimens

    Reihani, S. N. S. & Oddershede, L. B., 2009, I: Journal of Biomedical Optics. 14, 3, s. 030513-030513-3 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Die physik von nerven

    Heimburg, Thomas Rainer, 2009, I: Physik Journal (Print). 8, s. 33-39 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Diffusion and Partitioning of Fluorescent Lipid Probes in Phospholipid Monolayers

    Gudmand, M., Fidorra, M., Bjørnholm, T. & Heimburg, Thomas Rainer, 2009, I: Biophysical Journal. 96, 11, s. 4598-4609 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Diffusion of finite-sized hard-core ineracting particles in a one-dimensional box: tagged particle dynamics

    Lizana, G. L. & Ambjörnsson, T., 2009, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 80, 5, s. 051103 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Direct visualization of the lateral structure of porcine brain cerebrosides/POPC mixtures in presence and absence of cholesterol

    Fidorra, M., Heimburg, Thomas Rainer & Bagatolli, L. A., 2009, I: Biophysical Journal. 97, 1, s. 142-154 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Dominant negative autoregulation limits steady-state repression levels in gene networks

    Semsey, S., Krishna, S., Erdossy, J., Horvath, P., Orosz, L., Sneppen, Kim & Adhya, S., 2009, I: Journal of Bacteriology. 191, 14, s. 4487-4491 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Drying patterns: sensitivity to residual stresses

    Cohen, Y., Procaccia, I. & Mathiesen, Joachim, 2009, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 79, 4, Part 2, s. 046109

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Dynamic features of gene expression control by small regulatory RNAs

    Mitarai, Namiko, Bemjamin, J., Krishna, S., Semsey, S., Csiszovszki, Z., Masse, E. & Sneppen, Kim, 2009, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 106, 26, s. 10655-10659 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Dynamics of growth: decisions in phages & gene segregation in bacteria

    Avlund, M., 2009, Niels Bohr Institute: Museum Tusculanum. 129 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  16. Udgivet

    Dynamics of the recovery from sRNA-mediated gene silencing

    Semsey, S., Bemjamin, J., Mitarai, Namiko, Krishna, S., Csiszovszki, Z., Sneppen, Kim & Masse, E., 2009, I: Cell Cycle. 8, 18, s. 2863-2864 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Dynamics of uptake and metabolism of small molecules in cellular response systems

    Werner, M., Semsey, S., Sneppen, Kim & Krishna, S., 2009, I: PLoS ONE. 4, 3, s. e4923

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Effect of antibiotics and antimicrobial peptides on single protein motility

    Ryder, T. W. & Oddershede, L. B., 2009, I: Current Pharmaceutical Biotechnology. 10, 5, s. 486-493 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Effect of energy metabolism and membrane structure on single ¿-receptor motility

    Ryder, T. W., 2009, København: Museum Tusculanum. 101 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  20. Udgivet

    Effect of energy metabolism on protein motility in the bacterial outer membrane

    Ryder, T. W., Xu, L., Berg-Sørensen, K., Brown, Stanley & Oddershede, L. B., 2009, I: Biophysical Journal. 97, 5, s. 1305-1312 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Evolution of cell motility in an individual-based model of tumour growth

    Gerlee, P. D. M. & Anderson, A. R. A., 2009, I: Journal of Theoretical Biology. 259, 1, s. 67-83 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Fragmentation of fullerences, chapter in Hanbook of Nanophysics

    Albert, V. V., Chancey, R. T., Oddershede, L. B., Harris, F. E. & Sabin, J. R., 2009, Handbook of Nanophysics. Taylor & Francis

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  23. Udgivet

    Frustrated bistability as a means to engineer oscillations in biological systems

    Krishna, S., Semsey, S. & Jensen, Mogens Høgh, 2009, I: Physical Biology. 6, 3, s. 036009

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Gene divergence and pathway duplication in the metabolic network of yeast and digital organisms

    Gerlee, P. D. M., Lundh, T., Zhang, B. & Anderson, A. R. A., 2009, I: Journal of the Royal Society Interface. 6, 41, s. 1233-1245 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Heat distribution function for motion in a general potential at low temperature

    Fogedby, H. C. & Imparato, A., 2009, I: Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical (Print Edition). 42, 47, s. 475004

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Ising model for neural data: Model quality and approximate methods for extracting functional connectivity

    Roudi, Y., Tyrcha, J. & Hertz, John, 2009, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 79, 5, s. 051915 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Loewner driving functions for off-critical percolation clusters

    Kondo, Y., Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 2009, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 80, 5, Part 1, s. 050102

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Measurement of the spin-forbidden decay rate (3s3d)1D2¿(3s3p)3 P2,1 in 24Mg

    Therkildsen, K. T., Jensen, B. B., Ryder, C. P., Malossi, N. & Thomsen, Jan Westenkær, 2009, I: Physical Review A (Atomic, Molecular and Optical Physics). 79, 3, s. 034501 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Melting of individual lipid components in binary lipid mixtures studied by FTIR spectroscopy. DSC and Monte Carlo simulations

    Fidorra, M., Heimburg, Thomas Rainer & Seeger, H. M., 2009, I: Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes. 1788, 3, s. 600-607 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Microenvironment driven invasion: a multiscale multimodel investigation

    Anderson, A. R. A., Rejniak, K. A., Gerlee, P. D. M. & Quaranta, V., 2009, I: Journal of Mathematical Biology. 58, 4-5, s. 579-624 45 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Minimum action method for the Kardar-Parisi-Zhang equation

    Fogedby, H. C. & Ren, W., 2009, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 80, 4, Part 1, s. 041116

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Modeling of the genetic switch of bacteriophage TP901-1: a heteromer of CI and MOR ensures robust bistability

    Hiizu, N., Pedersen, M., Alsing, A. & Sneppen, Kim, 2009, I: Journal of Molecular Biology. 394, s. 15-28 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Modeling proteasome dynamics in Parkinson's disease

    Sneppen, Kim, Lizana, G. L., Jensen, Mogens Høgh, Pigolotti, S. & Otzen, D., 2009, I: Physical Biology. 6, 3, s. 036005

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Modelling evolutionary cell behaviour using neural networks: application to tumour growth

    Gerlee, P. D. M. & Anderson, A. R. A., 2009, I: BioSystems. 95, 2, s. 166-174 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Nanotoxikologie-es gibt immer zwei Seiten "review about nanotoxicology as an emerging field of research, indcludes interviews with Willie Peijnenburg, Priska Hinz, and Jens Otte

    Czerwinski, F., 2009, I: Junge Wissenschaft. 83

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Nonideal behavior of intramolecular structure factor of dilute polymers in a theta solvent

    Shimomura, K., Nakanishi, H. & Mitarai, Namiko, 2009, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 80, 5, Part 1, s. 051804

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Optical tweezers techniques, chapter in Hanndbook of Molecular Biophysics: Methods and Applications

    Oddershede, L. B., 2009, Handbook of Molecular Biophysics. G. Bohr, H. (red.). Wiley-VCH, s. 195-214 19 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  38. Udgivet

    Oral manifestations among people living with HIV/AIDS in Tanzania

    Fabian, F. M., Kahabuka, F. K., Petersen, P. E., Shubi, F. M. & Jürgensen, N., 2009, I: International Dental Journal. 59, 4, s. 187-91 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Pathway identification by network pruning in the metabolic network of Escherichia coli

    Gerlee, P. D. M., Lizana, G. L. & Sneppen, Kim, 2009, I: Bioinformatics. 25, 24, s. 3282-3288 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Phase-state dependent current fluctuation in pure lipid membranes

    Wunderlich, B., Leirer, C. & Heimburg, Thomas Rainer, 2009, I: Biophysical Journal. 96, 11, s. 4592-4597 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Physical properties of biological membranes. Chapter for "Encyclopedia of Applied Biophysics"

    Heimburg, Thomas Rainer, 2009, Wiley. 593 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportBogForskning

  42. Udgivet

    Quantification of droplet deformation by electromagnetic trapping

    Møller, P. C. F. & Oddershede, L. B., 2009, I: EPL. 88, s. 48005 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Quantification of nano-scale intermembrane contact areas using fluorescence resonance energy transfer

    Bendix, Poul Martin, Pedersen, M. S. & Stamou, Dimitrios, 2009, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 106, 30, s. 12341-12346 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Quantifying and pinpointing sources of noise in optical tweezers experiments

    Czerwinski, F., Richardson, A. C., Selhuber-Unkel, C. & Oddershede, L. B., 2009, Proceedings of SPIE, vol.7400, San Diego: Optical Trapping and Optical Micromanipulation VI. SPIE - International Society for Optical Engineering, Bind 7400. s. 740004-740009 9 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Quantifying noise in optical tweezers by Allan Variance

    Czerwinski, F., Richardson, A. C. & Oddershede, L. B., 2009, I: Optics Express. 17, 15, s. 13255-13269 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Reinforced communication and social navigation generate groups in model networks

    Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 2009, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 79, 2, Part 2, s. 026111

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Relation of intracellular signal levels and promoter activities in the gal regulon of escherichia coli

    Krishna, S., Orosz, L., Sneppen, Kim, Adhya, S. & Semsey, S., 2009, I: Journal of Molecular Biology. 391, 4, s. 671-678

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Repressor lattice: feedback, commensurability, and dynamical frustration

    Jensen, Mogens Høgh, Krishna, S. & Pigolotti, S., 2009, I: Physical Review Letters. 103, 11, s. 118101

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Scaling properties of European research units

    Jamtveit, B., Jettestuen, E. & Mathiesen, Joachim, 2009, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 106, 32, s. 13160-13163 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Statistical physics of pairwise probability models

    Roudi, Y., Aurell, E. & Hertz, John, 2009, I: Frontiers in Computational Neuroscience. 3, 22, s. (art 22) 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  51. Udgivet

    Symbolic dynamics of biological feedback networks

    Pigolotti, S., Krishna, S. & Jensen, Mogens Høgh, 2009, I: Physical Review Letters. 102, 8, s. 088701

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt