Biokompleksitet

  1. 2009
  2. Udgivet

    Texture of the upper 1000 m in the GRIP and NorthGRIP ice cores

    Svensson, Anders, Durand, G., Mathiesen, Joachim, Persson, A. & Dahl-Jensen, Dorthe, 2009, Low Temperature Science Supplement Issue: Physics of Ice Core Records II. Hondoh, T. (red.). Institute of Low Temperature Science, Hokkaido University, Sapporo Japan, Bind 68. s. 107-113 7 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    The influence of vesicle size and composition on alpha-synuclein structure and stability

    Kjær, L., Giehm, L., Otzen, D. & Heimburg, Thomas Rainer, 2009, I: Biophysical Journal. 96, 7, s. 2857-2870 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    The temperature dependence of lipid membrane permeability, its quantized nature, and the influence of anesthetics

    Blicher, A., Wodzinska, K., Fidorra, M., Winterhalter, M. & Heimburg, Thomas Rainer, 2009, I: Biophysical Journal. 96, 11, s. 4581-4591 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    The thermodynamics of lipid ion channel formation in the absence and presence of anesthetics. BLM experiments and simulations

    Wodzinska, K., Blicher, A. & Heimburg, Thomas Rainer, 2009, I: Soft Matter. 5, 17, s. 3319-3330 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Themed issue: membrane biophysics

    Heimburg, Thomas Rainer, 2009, I: Soft Matter. 5, 17, s. 3145-3147 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Thermodynamics and roughening of solid-solid interfaces

    Angheluta, L., Jettestuen, E. & Mathiesen, Joachim, 2009, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 79, 3, Part 1, s. 031601

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Toolbox model of evolution of prokaryotic metabolic networks and their regulation

    Maslov, S., Krishna, S., Pang, T. Y. & Sneppen, Kim, 2009, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 24, s. 9743-9748 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Towards a thermodynamic theory of nerve pulse propagation

    Andersen, S. S., Jackson, Andrew D. & Heimburg, Thomas Rainer, 2009, I: Progress in Neurobiology. 88, 2, s. 104-113 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Variety in intracellular diffusion during the cell cycle

    Selhuber-Unkel, C., Yde, P., Berg-Sørensen, K. & Oddershede, L. B., 2009, I: Physical Biology. 6, 2, s. 025015

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Vesicles in electric fields: some novel aspects of membrane behavior

    Dimova, R., Bezlyepkina, N. & Domange Jordö, M. E., 2009, I: Soft Matter. 5, 17, s. 3201-3212 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Why do phage play dice?

    Avlund, M., Dodd, I. B., Semsey, S., Sneppen, Kim & Krishna, S., 2009, I: Journal of Virology. 83, 22, s. 11416-11420 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. 2008
  14. Udgivet

    Rationalizing translation attenuation in the network architecture of the unfolded protein response

    Trusina, Ala, Papa, F. R. & Tang, C., 23 dec. 2008, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 105, 51, s. 20280-20285

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    The Role of MOR and the CI operator sites on the genetic switch temperate bacteriophage TP901-1

    Pedersen, M. & Hammer, K., 9 dec. 2008, I: Journal of Molecular Biology. 384, 3, s. 577-589

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Translation attenuation mechanism in unfolded protein response

    Trusina, Ala, Papa, F. & Tang, C., 1 dec. 2008, Evolution from Cellular to Social Scales. Skjeltorp, A., Skjeltorp, A. & Belushkin, A. (red.). s. 83-90 8 s. (NATO Science for Peace and Security Series B: Physics and Biophysics).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Real-time redox measurements during endoplasmic reticulum stress reveal interlinked protein folding functions

    Merksamer, P., Trusina, Ala & Papa, F., 20 nov. 2008, I: Cell. 135, 5, s. 933-947

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Dynamical analysis on gene activity in the presence of repressors and an interfering promoter

    Nakanishi, H., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 1 nov. 2008, I: Biophysical Journal. 95, 9, s. 4228-4240

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Missing levels in acoustic resonators

    Noguetira, T. N., Sartorelli, J. C., Pato, M. P. & Ellegaard, Clive Sigurd, 1 nov. 2008, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 78, 5, part 2, 055201.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Amplitude equation and long-rang interactions in underwater sand ripples in one dimension

    Schnipper, T., Mertens, K., Ellegaard, Clive Sigurd & Bohr, T., 1 okt. 2008, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 78, 4, 047301.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    The generation of promoter-mediated transcriptional noise in bacteria

    Mitarai, Namiko, Dodd, I. B., Crooks, M. T. & Sneppen, Kim, 11 jul. 2008, I: PLoS Computational Biology. 4, 7, s. e 10000109

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Faf1 is expressed during neurodevelopment and is involved in Apaf1-dependent caspase-3 activation in proneural cells

    De Zio, D., Ferraro, E., D'Amelio, M., Simoni, V., Bordi, M., Soroldoni, D., Berghella, L., Meyer, B. I. & Cecconi, F., jun. 2008, I: Cellular and Molecular Life Sciences. 65, 11, s. 1780-1790 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    A quantitative analysis of contractility in active cytoskeletal protein networks

    Bendix, Poul Martin, Koenderink, G. K., Cuvelier, D., Dogic, Z., Koelemann, B. N., Brieher, W. M., Field, C. M., Mahadevan, L. & Weitz, D. A., 15 apr. 2008, I: Biophysical Journal. 94, 8, s. 3126-3136 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Ultrasensitive gene regulation by positive feedback loops in nucleosome modification

    Sneppen, Kim, Micheelsen, M. A. & Dodd, I. B., 15 apr. 2008, I: Molecular Systems Biology. 4, s. 182

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    One hub-one process: a tool based view on regulatory network topology

    Axelsen, J. B., Bernhardsson, S. & Sneppen, Kim, 4 mar. 2008, I: BMC Systems Biology. 2, s. 25

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Elasticity with arbitrarily shaped inhomogeneity

    Mathiesen, Joachim, Procaccia, I. & Regev, I., 26 feb. 2008, I: Physical Review E. 77, 2, 026606.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Anomalous fluctuations in sliding motion of cytoskeletal filaments driven by molecular motors: Model simulations

    Imafuku, Y., Mitarai, Namiko, Tawada, K. & Nakanishi, H., 7 feb. 2008, I: Journal of Physical Chemistry Part B: Condensed Matter, Materials, Surfaces, Interfaces & Biophysical. 112, 5, s. 1487-1493

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    The cost and capacity of signaling in the Escherichia coli proetin reaction network

    Axelsen, J. B., Krishna, S. & Sneppen, Kim, 24 jan. 2008, I: Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. s. P010018

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    A quantitative analysis of indicators of scientific performance

    Lehmann, S., Jackson, Andrew D. & Lautrup, B. E., 2008, I: Scientometrics. 76, 2, s. 369-390 22 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Brownian Warps for Non-Rigid Registration

    Nielsen, Mads, Johansen, P., Jackson, Andrew D., Lautrup, B. E. & Hauberg, S., 2008, I: Journal of Mathematical Imaging and Vision. 31, 2-3, s. 221-231 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Development of radiotracers for Vps10p domain (neurotensin-3) receptors

    Bender, D., Horvath, G., Jansen, P., Olsen, A. K. & Gjedde, Albert, 2008, I: NeuroImage. 41, Suppl. 2, s. T89-T89

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Dimensions, maximal growth sites, and optimization in the dielectric breakdown model

    Mathiesen, J., Jensen, Mogens Høgh & Bakke, J. O. H., 2008, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 77, 6, s. 066203

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Dynamical genetic regulation

    Jensen, Mogens Høgh, Krishna, S., Sneppen, Kim & Tiana, G., 2008, Springer. (Evolution from cellular to social scales, book series: Nato security through science series B: Physics and biophysics.Conference of the Nato-advanced study institute on evolution from cellular to social scales geilo, Norway april 10-20,2007, p.61-68.).

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportBogForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Efficient optical trapping and visualization of silver nano-particles

    Bosanac, L., Aabo, T., Bendix, Poul Martin & Oddershede, L. B., 2008, I: Nano Letters. 8, 5, s. 1486–1491 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Efficient optical trapping and visualization of silver nanoparticles

    Bosanac, L., Aabo, T., Bendix, Poul Martin & Oddershede, L. B., 2008, I: Nano Letters. 8, 5, s. 1486-1491 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Gene duplication models for directed networks with limits on growth

    Enemark, J. & Sneppen, Kim, 2008, I: Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. 2007, s. P11007

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Identification of Quaternary Structure and functional domains of the CI repressor from Bacteriophage TP901-1

    Pedersen, M., Lo Leggio, Leila, Grossmann, J. G., Larsen, Sine & Hammer, K., 2008, I: Journal of Molecular Biology. 373, s. 983-996

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Komolgorov scaling from random force fields

    Jensen, Mogens Høgh, Sneppen, Kim & Angheluta, L., 2008, I: EPL. 84, 1, s. 10011 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Lipid membrane domain formation and alamethicin aggregation studied by calorimetry, sound velocity measurements, and atomic force microscopy

    Oliynyk, V., Jäger, M., Heimburg, Thomas Rainer, Buckin, V. & Kaatze, U., 2008, I: Biophysical Chemistry. 134, 3, s. 168-177 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Mode locking of a driven Bose-Einstein condensate

    Nicolin, A., Carretero-González, R. & Jensen, Mogens Høgh, 2008, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 75, 3, s. 036208

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Non-harmonic potential of a single beam optical trap

    Richardson, A. C., S. Reihani, S. N. & Oddershede, L. B., 2008, I: Optics Express. 16, 20, s. 15709-15717 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Optical tweezers cause physiological damage to Escherichia coli and Listeria bacteria

    Rasmussen, M. B., Oddershede, L. B. & Siegumfeldt, H., 2008, I: Applied and Environmental Microbiology. 74, 8, s. 2441-2446

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Optical tweezers techniques

    Oddershede, L. B., 2008, Handbook of Molecular Biophysics: Methods and Applications. Bohr, H. G. (red.). 1. ed. udg. Berlin: Wiley-VCH, Bind Chapter 6. s. Chapter 6

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  44. Udgivet

    Oscillation patterns in negative feedback loops

    Pigolotti, S., Krishna, S. & Jensen, Mogens Høgh, 2008, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 104, 16, s. 6533-6537

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Oscillations and temporal signalling in cells

    Tiana, G., Krishna, S., Pigolotti, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2008, I: Physical Biology. 4, 2, s. R1-R17

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Quantitative force calibration in viscoelastic media and living cells: 32nd Congress of the Federation of European Biochemical Societies. July 07-12 Vienna, Austria

    Berg-Sørensen, K., Fischer, M., Richardson, A. C., Seyyed Reihani, S. N. & Oddershede, L. B., 2008, I: FEBS Journal. 274, Suppl. 1, s. 299-299

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Quantitative optical trapping of single gold nanorods

    Selhuber-Unkel, C., Zins, I., Schubert, O., Soennichsen, C. & Oddershede, L. B., 2008, I: Nano Letters. 8, 9, s. 2998-3003

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Resonant energy transfer in Bose-Einstien condensates

    Nicolin, A., Jensen, Mogens Høgh, Thomsen, Jan Westenkær & Carretero-Gonxález, R., 2008, I: Physica D : Non-linear Phenomena. 237, 19, s. 2476-2481

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Ribosome collisions and Translation efficiency: Optimization by codon usage and mRNA destabilization

    Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Pedersen, Steen, 2008, I: Journal of Molecular Biology. 382, 1, s. 236-245 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Signalling and Feedback in Biological Networks

    Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2008, Dynamics on and of Complex Networks: Applications to Biology, computer Sciences, and the Social Sciences ( Modeling and Simulation in Sciences, Engineering and Technolo). Ganguly, N., Deutsch, A. & Mukherjee, A. (red.). Birkhäuser Verlag, s. Part 1 ( Biological Sciences)

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  51. Udgivet

    Single-file dynamics with different diffusion constants

    Ambjornsson, T., Silbey, R. J., Lizana, G. L. & Lomholt, M. A., 2008, I: Journal of Chemical Physics. 129, 18, s. 185106

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  52. Udgivet

    Single-molecule observations of topotecan-mediated Top1B activity at a unique DNA sequence

    Koster, D. A., Czerwinski, F. & Halby, L., 2008, I: Nucleic Acids Research. 36, s. 2301-2310 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt