Namiko Mitarai
Lektor
Biokompleksitet
Blegdamsvej 17
2100 København Ø
- Udgivet
Modeling the spatial dynamics of culture spreading in the presence of cultural strongholds
Lizana, G. L., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 28 jun. 2011, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 83, 6, s. 066116 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Motility mediates satellite formation in confined biofilms
Cordero, Mireia, Mitarai, Namiko & Jauffred, Liselotte, 17 aug. 2023, I: ISME Journal. 17, s. 1819-1827 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Multistability with a Metastable Mixed State
Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 5 sep. 2012, I: Physical Review Letters. 109, 10, s. 100602 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Nonideal behavior of intramolecular structure factor of dilute polymers in a theta solvent
Shimomura, K., Nakanishi, H. & Mitarai, Namiko, 2009, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 80, 5, Part 1, s. 051804Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Occlusion of the ribosome binding site connects the translational initiation frequency, mRNA stability and premature transcription termination
Eriksen, M., Sneppen, Kim, Pedersen, Steen & Mitarai, Namiko, 14 mar. 2017, I: Frontiers in Microbiology. 8, 7 s., 362.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
On Phage Adsorption to Bacterial Chains
Eriksen, R. S., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 3 nov. 2020, I: Biophysical Journal. 119, 9, s. 1896-1904 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Phage and bacteria support mutual diversity in a narrowing staircase of coexistence
Härter, Jan Olaf Mirko, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 3 nov. 2014, I: I S M E Journal. 28, 11, s. 2317-2326Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Population Dynamics of Phage and Bacteria in Spatially Structured Habitats Using Phage lambda and Escherichia coli
Mitarai, Namiko, Brown, Stanley & Sneppen, Kim, 11 apr. 2016, I: Journal of Bacteriology. 198, 12, s. 1783-1793Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Protection of bacteriophage-sensitive Escherichia coli by lysogens
Brown, Stanley, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 2 apr. 2022, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 119, 4, e2106005119.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Protein Localization with Flexible DNA or RNA
Bernhardsson, P. J. S., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 10 feb. 2012, I: PLoS.ONE.. 7, 2, s. e29218Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Rapid Curtailing of the Stringent Response by Toxin-Antitoxin Encoded mRNases
Tian, C., Roghanian, Mohammad, Jørgensen, M. G., Sneppen, Kim, Sørensen, Michael Askvad, Gerdes, K. & Mitarai, Namiko, jul. 2016, I: Journal of Bacteriology. 198, 14, s. 1918-1926Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ribosome collisions and Translation efficiency: Optimization by codon usage and mRNA destabilization
Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Pedersen, Steen, 2008, I: Journal of Molecular Biology. 382, 1, s. 236-245 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Shear Thickening Oscillation in a Dilatant Fluid
Nakanishi, H. & Mitarai, Namiko, 25 feb. 2011, I: Journal of the Physical Society of Japan. 80, 3, s. 033801Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Simple Interaction Model for Particlly Wet Granular Materials
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 1 feb. 2010, I: A I P Conference Proceedings Series. 1227, s. 214-220Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Simple model for wet granular materials with liquid cluster
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 1 dec. 2009, I: EPL. 88, 6, s. 64001Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Spatiotemporal structure of traffic flow in a system with an open boundary
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 21 aug. 2000, I: Physical Review Letters. 85, 8, s. 1766-1769Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Speciation, diversification, and coexistence of sessile species that compete for space
Mitarai, Namiko, Heinsalu, E. & Sneppen, Kim, 12 maj 2014, I: PloS One. 9, 5, s. e96665Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Stability analysis of collisional granular flow on a slope
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 30 sep. 2003, I: International Journal of Modern Physics B. 17, 22-24 II, s. 4290-4294 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Stability analysis of optimal velocity model for traffic and granular flow under open boundary condition
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 1 aug. 1999, I: Journal of the Physical Society of Japan. 68, 8, s. 2475-2478Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sustainability of spatially distributed bacteria-phage systems
Eriksen, R. S., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, s. 1-12 3154.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sustainable diversity of phage-bacteria systems
Mitarai, Namiko, Marantos, Anastasios & Sneppen, Kim, 1 jun. 2023, I: Current Opinion in Systems Biology. 35, 6 s., 100468.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Switching between oscillations and homeostasis in competing negative and positive feedback motifs
Li, W., Krishna, S., Pigolotti, S., Mitarai, Namiko & Jensen, Mogens Høgh, 21 aug. 2012, I: Journal of Theoretical Biology. 307, s. 205-210Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Synchronized switching of multiple toxin-antitoxin modules by (p)ppGpp fluctuation
Tian, C., Semsey, S. & Mitarai, Namiko, 21 aug. 2017, I: Nucleic Acids Research. 45, 14, s. 8180-8189 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Gompertz Law emerges naturally from the inter-dependencies between sub-components in complex organisms
Yde, Pernille, Jensen, Majken Karoline, Mitarai, Namiko & Bhatt, Samir, 2024, I: Scientific Reports. 14, 1, 11 s., 1196.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The dynamics of phage predation on a microcolony
Eriksen, R. S., Larsen, Frej Andreas Nøhr, Svenningsen, Sine Lo, Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 2024, I: Biophysical Journal. 123, 2, s. 147-156 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The functional half-life of an mRNA depends on the ribosome spacing in an early coding region
Pedersen, M., Nissen, S., Mitarai, Namiko, Svenningsen, Sine Lo, Sneppen, Kim & Pedersen, Steen, 2011, I: Journal of Molecular Biology. 407, 1, s. 35-44 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The generation of promoter-mediated transcriptional noise in bacteria
Mitarai, Namiko, Dodd, I. B., Crooks, M. T. & Sneppen, Kim, 11 jul. 2008, I: PLoS Computational Biology. 4, 7, s. e 10000109Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Theory for the stability and regulation of epigenetic landscapes
Micheelsen, M. A., Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Dodd, I. B., 4 jun. 2010, I: Physical Biology. 7, 2, s. 026010 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Theory of invasion extinction dynamics in minimal food webs
Härter, Jan Olaf Mirko, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 12 feb. 2018, I: Physical Review E. 97, 2, 10 s., 022404.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Three is much more than two in coarsening dynamics of cyclic competitions
Mitarai, Namiko, Gunnarson, I., Pedersen, B. N., Rosiek, C. A. & Sneppen, Kim, apr. 2016, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 93, 042408.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Toxins, Targets, and Triggers: An Overview of Toxin-Antitoxin Biology
Harms, A., Brodersen, D. E., Mitarai, Namiko & Gerdes, K., 7 jun. 2018, I: Molecular Cell. 70, 5, s. 768-784 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Valine-Induced Isoleucine Starvation in Escherichia coli K-12 Studied by Spike-In Normalized RNA Sequencing
Gummesson, Bertil, Shah, S. A., Borum, A. S., Fessler, M., Mitarai, Namiko, Sørensen, Michael Askvad & Svenningsen, Sine Lo, 2020, I: Frontiers in Genetics. 11, 17 s., 144.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Velocity correlations in dense granular shear flows: Effects on energy dissipation and normal stress
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 2007, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 75, 3, s. 031305Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Wet granular materials
Mitarai, Namiko & Nori, F., 30 jun. 2006, I: Advances in Physics. 55, 1-2, s. 1-45 45 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
When to wake up? The optimal waking-up strategies for starvation-induced persistence
Himeoka, Y. & Mitarai, Namiko, 11 feb. 2021, I: PLoS Computational Biology. 17, 2, 21 s., 1008655.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 12071632
Flest downloads
-
1916
downloads
The functional half-life of an mRNA depends on the ribosome spacing in an early coding region
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1475
downloads
Conditional Cooperativity of Toxin - Antitoxin Regulation Can Mediate Bistability between Growth and Dormancy
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
842
downloads
Speciation, diversification, and coexistence of sessile species that compete for space
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet