Biokompleksitet

The COVID-19 pandemic: key considerations for the epidemic and its control

Ørskov, S., Nielsen, Bjarke Frost, Føns, S., Sneppen, Kim & Simonsen, L., jul. 2021, I: APMIS. 129, 7, s. 408-420 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

High Pressure Studies up to 50 GPa of CuO

Åsbrink, S., Gerward, L., Olsen, J. S. & Steenstrup, S., 1992, I: High Pressure Research. 10, s. 515-521

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Formation of martian araneiforms by gas-driven erosion of granular material

de Villiers, S., Nermoen, A., Jamtveit, B., Mathiesen, Joachim, Meakin, P. & Werner, S. C., 2 jul. 2012, I: Geophysical Research Letters. 39, s. L13204 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Influence of volumetric modulated arc therapy and FET-PET scanning on treatment outcomes for glioblastoma patients

af Rosenschold, P. M., Law, Ian, Engelholm, S. A., Muhic, A., Lundemann, M. J., Roed, H., Grunnet, K. & Poulsen, H. S., jan. 2019, I: Radiotherapy and Oncology. 130, s. 149-155

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Sall4 and Myocd Empower Direct Cardiac Reprogramming From Adult Cardiac Fibroblasts After Injury

Zhao, H., Zhang, Y., sgk681, sgk681, Sun, Q., Yang, C., Wang, H., Yang, J., Yang, Y., Yang, X., Liu, Y. & Zhao, Y., 26 feb. 2021, I: Frontiers in Cell and Developmental Biology. 9, 13 s., 608367.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Interferometric detection of single gold nanoparticles calibrated against TEM size distributions

Zhang, L., Christensen, S., Bendix, Poul Martin, Bhatia, V. K., Loft, Steffen & Stamou, Dimitrios, 2015, I: Small. 11, 29, s. 3550-3555 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Active inter-cellular forces in collective cell motility

Zhang, G., Mueller, R., Doostmohammadi, Amin & Yeomans, J. M., 26 aug. 2020, I: Journal of the Royal Society. Interface. 17, 169, 9 s., 20200312.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Maximum Likelihood Reconstruction for Ising Models with Asynchronous Updates

Zeng, H., Alava, M., Aurell, E., Hertz, John & Roudi, Y., 20 maj 2013, I: Physical Review Letters. 110, 21, 210601.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

L-1 regularization for reconstruction of a non-equilibrium Ising model

Zeng, H. L., Hertz, John & Roudi, Y., 2 okt. 2014, I: Physica Scripta. Topical Issues. 89, 10, 105002.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Non-linear Conductance, Rectification, and Mechanosensitive Channel Formation of Lipid Membranes

Zecchi, K. A. & Heimburg, Thomas Rainer, 26 jan. 2021, I: Frontiers in Cell and Developmental Biology. 8, 18 s., 592520.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Mechano-capacitive properties of polarized membranes and the application to conductance measurements of lipid membrane patches

Zecchi, K. A., Mosgaard, L. D. & Heimburg, Thomas Rainer, 1 jan. 2017, I: Journal of Physics: Conference Series. 780, 012001.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt

RBS analysis of diffusion and evaporation of implanted lead in aluminium

Yu, L. D., Steenstrup, S., Johansen, A., Johnson, Erik, Sarholt-Kristensen, L. & Bourdelle, K. K., 1992, I: Nuclear Instruments and Methods in Physics Research Section A: Accelerators, Spectrometers, Detectors and Associated Equipment. B64, s. 78-82

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Analyzing inflammatory response as excitable media

Yde, Pernille, Jensen, Mogens Høgh & Trusina, Ala, 18 nov. 2011, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 84, 5, Part 1, s. 051913

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Modeling the NF-kappa B mediated inflammatory response predicts cytokine waves in tissue

Yde, Pernille, Mengel, A. B., Jensen, Mogens Høgh, Krishna, S. & Trusina, Ala, 19 jul. 2011, I: BMC Systems Biology. 5, s. 115

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Chemicals orchestrate reprogramming with hierarchical activation of master transcription factors primed by endogenous Sox17 activation

Yang, Z., Xu, X., Gu, C., Li, J., Wu, Q., Ye, C., Nielsen, Alexander Valentin, Mao, L., Ye, J., Bai, K., Guo, F., Tang, C. & Zhao, Y., 30 okt. 2020, I: Communications Biology . 3, 1, 10 s., 629.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Chemical Pretreatment Activated a Plastic State Amenable to Direct Lineage Reprogramming

Yang, Z., Xioachan, X., Gu, C., Nielsen, Alexander Valentin, Chen, G., Guo, F., Tang, C. & Zhao, Y., 25 mar. 2022, I: Frontiers in Cell and Developmental Biology. 10, 16 s., 865038.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Universal Transitions between Growth and Dormancy via Intermediate Complex Formation

Yamagishi, J. F. & Kaneko, Kunihiko, 12 mar. 2024, I: Physical Review Letters. 132, 11, 7 s., 118401.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

Jag1-Notch cis-interaction determines cell fate segregation in pancreatic development

sgk681, sgk681, Seymour, Philip Allan, Sneppen, Kim, Trusina, Ala, Egeskov-Madsen, A. L. R., Jørgensen, Mette Christine, Jensen, Mogens Høgh & Serup, Palle, 2023, I: Nature Communications. 14, 17 s., 348.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Phase-state dependent current fluctuation in pure lipid membranes

Wunderlich, B., Leirer, C. & Heimburg, Thomas Rainer, 2009, I: Biophysical Journal. 96, 11, s. 4592-4597 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Cancer cells' ability to mechanically adjust to extracellular matrix stiffness correlates with their invasive potential

Wullkopf, L., West, A. K. V., Leijnse, Natascha, Cox, T. R., Madsen, C. D., Oddershede, L. B. & Erler, Janine, 2018, I: Molecular Biology of the Cell. 29, 20, s. 2378-2385 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The thermodynamics of lipid ion channel formation in the absence and presence of anesthetics. BLM experiments and simulations

Wodzinska, K., Blicher, A. & Heimburg, Thomas Rainer, 2009, I: Soft Matter. 5, 17, s. 3319-3330 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Interweaving categories: Styles, paradigms, and models

Winther, Rasmus, 1 dec. 2012, I: Studies in History and Philosophy of Science - Part A. 43, 4, s. 628-639

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Observation of Motion-Dependent Nonlinear Dispersion with Narrow-Linewidth Atoms in an Optical Cavity

Westergaard, P. G., Christensen, B. T. R., Tieri, D., Matin, R., Cooper, J., Holland, M., Ye, J. & Thomsen, Jan Westenkær, 4 mar. 2015, I: Physical Review Letters. 114, 9, 093002.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Division Induced Dynamics in Non-Invasive and Invasive Breast Cancer

West, A. V., Wullkopf, L., Christensen, A., Leijnse, Natascha, Tarp, J. M., Mathiesen, Joachim, Erler, Janine & Oddershede, L. B., 3 feb. 2017, I: Biophysical Journal. 112, 3, Supp. 1, s. 123A-123A

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Dynamics of cancerous tissue correlates with invasiveness

West, A. V., Wullkopf, L., Christensen, A., Leijnse, Natascha, Tarp, J. M., Mathiesen, Joachim, Erler, Janine & Oddershede, L. B., 6 mar. 2017, I: Scientific Reports. 7, 43800.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Dynamics of uptake and metabolism of small molecules in cellular response systems

Werner, M., Semsey, S., Sneppen, Kim & Krishna, S., 2009, I: PLoS ONE. 4, 3, s. e4923

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Reply to "Comment on 'Penetration of Action Potentials During Collision in the Median and Lateral Giant Axons of Invertebrates'"

Wang, T., Gonzalez-Perez, Alfredo, Budvytyte, R., Jackson, Andrew D. & Heimburg, Thomas Rainer, 24 apr. 2017, I: Physical Review X. 7, 2, 028002.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The free energy of biomembrane and nerve excitation and the role of anesthetics

Wang, T., Muzic, T., Jackson, Andrew D. & Heimburg, Thomas Rainer, 16 okt. 2018, I: Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes. 1860, 10, s. 2145-2153 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The Role of Passive Cloud Volumes in the Transition From Shallow to Deep Atmospheric Convection

Vraciu, C. V., Kruse, Irene Livia & Härter, Jan Olaf Mirko, 16 dec. 2023, I: Geophysical Research Letters. 50, 23, 9 s., e2023GL105996.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

Roadmap for optical tweezers

Volpe, G., Maragò, O. M., Rubinsztein-Dunlop, H., Pesce, G., Stilgoe, A. B., Volpe, G., Tkachenko, G., Truong, V. G., Chormaic, S. N., Kalantarifard, F., Elahi, P., Käll, M., Callegari, A., Marqués, M. I., Neves, A. A. R., Moreira, W. L., Fontes, A., Cesar, C. L., Saija, R., Saidi, A. & 63 flere, Beck, P., Eismann, J. S., Banzer, P., Fernandes, T. F. D., Pedaci, F., Bowen, W. P., Vaippully, R., Lokesh, M., Roy, B., Thalhammer-Thurner, G., Ritsch-Marte, M., García, L. P., Arzola, A. V., Castillo, I. P., Argun, A., Muenker, T. M., Vos, B. E., Betz, T., Cristiani, I., Minzioni, P., Reece, P. J., Wang, F., McGloin, D., Ndukaife, J. C., Quidant, R., Roberts, R. P., Laplane, C., Volz, T., Gordon, R., Hanstorp, D., Marmolejo, J. T., Bruce, G. D., Dholakia, K., Li, T., Brzobohatý, O., Simpson, S. H., Zemánek, P., Ritort, F., Roichman, Y., Bobkova, V., Wittkowski, R., Denz, C., Pavan Kumar, G. V., Foti, A., Donato, M. G., Gucciardi, P. G., Gardini, L., Bianchi, G., Kashchuk, A. V., Capitanio, M., Paterson, L., Jones, P. H., Berg-Sørensen, K., Farhangibarooji, Younes, Oddershede, L. B., Pouladian, P., Preece, D., Adiels, C. B., De Luca, A. C., Magazzù, A., Ciriza, D. B., Iatì, M. A. & Swartzlander, G. A., apr. 2023, I: Journal of Physics-Photonics. 5, 2, 136 s., 022501.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Variations in interpulse interval of double action potentials during propagation in single neurons

Villagran-Vargas, E., Rodriguez-Sosa, L., Hustert, R., Blicher, A., Laub, K. R. & Heimburg, Thomas Rainer, 2013, I: Synapse. 67, 2, s. 68-78 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Dynamic Modeling of Indole Glucosinolate Hydrolysis and Its Impact on Auxin Signaling

Vik, D., Mitarai, Namiko, Wulff, N., Halkier, Barbara Ann & Burow, Meike, 2018, I: Frontiers in Plant Science. 9, 16 s., 550.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Mechanics of cell integration in vivo

Ventura, Guilherme Bastos, Amiri, A., Thiagarajan, Raghavan, Tolonen, Mari, Doostmohammadi, Amin & Sedzinski, Jakub, 18 nov. 2021, I: bioRxiv. 33 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Multiciliated cells use filopodia to probe tissue mechanics during epithelial integration in vivo

Ventura, G., Amiri, A., Thiagarajan, Raghavan, Tolonen, Mari, Doostmohammadi, Amin & Sedzinski, Jakub, 2022, I: Nature Communications. 13, 1, 15 s., 6423.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Distinct impacts of polar and nematic self-propulsion on active unjamming

Venkatesh, V., Mondal, C. & Doostmohammadi, Amin, 2022, I: Journal of Chemical Physics. 157, 16, 11 s., 164901.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Time-dependent Taylor-Aris dispersion of an initial point concentration

Vedel, S., Hovad, E. & Bruus, H., 2014, I: Journal of Fluid Mechanics. 752, s. 107-122 16 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Asymmetric Damage Segregation Constitutes an Emergent Population-Level Stress Response

Vedel, S., Nunns, H., Košmrlj, A., Semsey, S. & Trusina, Ala, 13 jul. 2016, I: Cell Systems. 3, 2, s. 187-198

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Periodic solutions and refractory periods in the soliton theory for nerves and the locust femoral nerve

Vargas, V., Ludu, A., Hustert, R., Gumrich, P., Jackson, Andrew D. & Heimburg, Thomas Rainer, 1 jan. 2011, I: Biophysical Chemistry. 153, 2-3, s. 159-167 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Instabilities in Sand Ripples

Van Hecke, M., Ellegaard, Clive Sigurd & Bohr, T., 2001, I: Nature. 410, s. 324

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning

Bekymrede forskere: Politisk styring af offentlige forskningsmidler må ikke underminere grundforskningen

Vallgårda, Karen Asta Arnfred, Bjørk, R., Dalsgaard, P., Dimke, H., Jauffred, Liselotte, Kropp, K., Laustsen, A. H., Pedersen, B. P. & Sørensen, Thomas Just, 30 sep. 2020, I: Science Report.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Bidrag til avis - Avisartikel › Formidling

Unge forskere: Vi vil advare mod direkte politisk styring af forskningsfinansiering

Vallgårda, Karen Asta Arnfred, Bjørk, R., Dalsgaard, P., Dimke, H., Jauffred, Liselotte, Laustsen, A. H., Pedersen, B. P. & Sørensen, Thomas Just, 1 okt. 2020, I: Altinget.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Bidrag til avis - Avisartikel › Formidling

Unge forskere: Flere øremærkede forskningsmidler truer fri forskning

Vallgårda, Karen Asta Arnfred, Andersen, P. E., Bjørk, R., Dalsgaard, P., Damgaard, R. B., Dimke, H., Hansen, N. C., Jauffred, Liselotte, Jønsson, Knud Andreas, Kropp, K., Laustsen, A. H., Møller, Niels Martin, Nielsen, Mathias Wullum, Sørensen, Thomas Just & Nielsen, T. K., 11 feb. 2021, I: Altinget. 1 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Bidrag til avis - Avisartikel › Formidling

Unge forskere: Ph.d.-studerende skal ikke udnyttes som billig arbejdskraft

Vallgårda, Karen Asta Arnfred, Sørensen, Thomas Just, Jauffred, Liselotte, Danbolt, Mathias, Bjørk, R., Dalsgaard, P., Dimke, H., Niss, K. & Pedersen, B. P., 30 jan. 2020, I: Altinget. 1 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Bidrag til avis - Avisartikel › Formidling

Unge forskere: Fondsmidler trækker forskningen skæv

Vallgårda, Karen Asta Arnfred, Jauffred, Liselotte, Sørensen, Thomas Just, Rasmussen, B., Damgaard, R. B., Dalsgaard, P., Dimke, H., Jønsson, Knud Andreas, Kropp, K., Laustsen, A. H., Møller, Niels Martin & Ellersgaard, C. H., 23 mar. 2021, I: Altinget. 1 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Bidrag til avis - Avisartikel › Formidling

Inden næste epidemi

Vallgårda, Karen Asta Arnfred, Jauffred, Liselotte, Sørensen, Thomas Just, Engberg-Pedersen, Anders, Bjørk, R., Dimke, H., Dalsgaard, P., Kropp, K., Niss, K. & Pedersen, B. P., 1 maj 2020, I: Weekendavisen. 1 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Bidrag til avis - Avisartikel › Formidling

Unge forskere: Fri forskning er vigtigt – også i krisetider

Vallgårda, Karen Asta Arnfred, Jauffred, Liselotte, Sørensen, Thomas Just, Møller, Niels Martin, Niss, K., Bjørk, R., Dalsgaard, P., Dimke, H. & Pedersen, B. P., 12 maj 2020, I: Altinget. 1 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Bidrag til avis - Avisartikel › Formidling

Nej, Ane Halsboe-Jørgensen, forskningsmidler skal ikke bruges på erhvervsstøtte

Vallgårda, Karen Asta Arnfred, Bjørk, R., Dalsgaard, P., Dimke, H., Jauffred, Liselotte, Kropp, K., Laustsen, A. H., Pedersen, B. P. & Sørensen, Thomas Just, 12 sep. 2020, I: Information. 1 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Bidrag til avis - Avisartikel › Formidling

Vedtag en hjælpepakke til yngre forskere

Vallgårda, Karen Asta Arnfred, Dalsgaard, P., Dimke, H., Jauffred, Liselotte, Kropp, K., Laustsen, A. H., Pedersen, B. P., Suhr, C. & Sørensen, Thomas Just, 15 sep. 2020, I: Politiken. 1 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Bidrag til avis - Avisartikel › Formidling

Unge forskere: Der er behov for en bedre model til at støtte coronaforsinket forskning

Vallgårda, Karen Asta Arnfred, Andersen, P. E., Jauffred, Liselotte, Sørensen, Thomas Just, Møller, Niels Martin, Jønsson, Knud Andreas, Kristensen, Line Burholt, Bjørk, R., Dalsgaard, P., Dimke, H., Kropp, K., Laustsen, A. H., Nielsen, Mathias Wullum & Rasmussen, Laura Vang, 16 mar. 2021, I: Altinget.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Bidrag til avis - Avisartikel › Formidling

Formulation of probabilistic models of protein structure in atomic detail using the reference ratio method

Valentin, J., Andreetta, C., Boomsma, Wouter, Bottaro, S., Ferkinghoff-Borg, J., Frellsen, J., Mardia, K. V., Tian, P. & Hamelryck, Thomas Wim, 2014, I: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. 82, 2, s. 288-299 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Active topological defect absorption by a curvature singularity

Vafa, F., Nelson, D. R. & Doostmohammadi, Amin, 20 jul. 2023, I: Journal of Physics Condensed Matter. 35, 42, 17 s., 425101.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

OBSERVATION OF THE PROTON-PAIRING VIBRATION IN CA-48

VIDEBAEK, F., HANSEN, O., LEVINE, M., Ellegaard, Clive Sigurd, HOATH, S. & NELSON, J., 17 mar. 1986, I: Nuclear Physics A: Nuclear and Hadronic Physics. 451, 1, s. 131-140

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Lineage tracing identifies heterogeneous hepatoblast contribution to cell lineages and postembryonic organ growth dynamics

Unterweger, Iris Anne, Klepstad, J., Hannezo, E., Lundegaard, Pia Rengtved, Trusina, Ala & Ober, Elke, 2023, I: PLOS Biology. 21, 10, 30 s., e3002315.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Characterization of phase transitions in a model ecosystem of sessile species

Uekermann, F., Mathiesen, Joachim & Mitarai, Namiko, 13 mar. 2017, I: Physical Review E. 95, 3, 032409.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Exploring the contribution of exposure heterogeneity to the cessation of the 2014 Ebola epidemic

Uekermann, F., Simonsen, L. & Sneppen, Kim, 1 feb. 2019, I: PLoS ONE. 14, 2, 11 s., e0210638.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

A cross-immunization model for the extinction of old influenza strains

Uekermann, F. & Sneppen, Kim, 2016, I: Scientific Reports. 6, 8 s., 25907.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Spreading of multiple epidemics with cross immunization

Uekermann, F. & Sneppen, Kim, 13 sep. 2012, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 86, 3, Part 2, s. 036108 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

NETWORK INFERENCE WITH HIDDEN UNITS

Tyrcha, J. & Hertz, John, 1 feb. 2014, I: Mathematical Biosciences and Engineering. 11, 1, s. 149-165

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The effect of nonstationarity on models inferred from neural data

Tyrcha, J., Roudi, Y. & Hertz, John, 1 mar. 2013, I: Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. 2013, P03005.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Human T cell responses to Japanese encephalitis virus in health and disease

Turtle, L., Bali, T., Buxton, G., Chib, S., Chan, S., Soni, M., Hussain, M., Isenman, H., Fadnis, P., Venkataswamy, M. M., Satishkumar, V., Lewthwaite, P., Kurioka, A., Krishna, S., Shankar, M. V., Ahmed, R., Begum, A., Ravi, V., Desai, A., Yoksan, S. & 7 flere, Fernandez, S., Willberg, C. B., Kløverpris, Henrik Nyhus, Conlon, C., Klenerman, P., Satchidanandam, V. & Solomon, T., 2016, I: Journal of Experimental Medicine.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Polar jets of swimming bacteria condensed by a patterned liquid crystal

Turiv, T., Koizumi, R., Thijssen, K., Genkin, M. M., Yu, H., Peng, C., Wei, Q., Yeomans, J. M., Aranson, I. S., Doostmohammadi, Amin & Lavrentovich, O. D., 2 mar. 2020, I: Nature Physics. 16, 4, s. 481-487 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Functional alignment of regulatory networks: a study of temperate phages

Trusina, Ala, Sneppen, Kim, Dodd, I. B., Shearwin, K. E. & Egan, J. B., 2006, I: PLoS Computational Biology. 1, 7, s. 599-603

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Stress induced telomere shortening: longer life with less mutations?

Trusina, Ala, 1 mar. 2014, I: B M C Systems Biology. 8, 27.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Rationalizing translation attenuation in the network architecture of the unfolded protein response

Trusina, Ala, Papa, F. R. & Tang, C., 23 dec. 2008, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 105, 51, s. 20280-20285

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The unfolded protein response and translation attenuation: a modelling approach.

Trusina, Ala & Tang, C., okt. 2010, I: Diabetes, Obesity and Metabolism Online. 12, s. 27-31

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Hierarchy measures in complex networks

Trusina, Ala, Maslov, S., Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 30 apr. 2004, I: Physical Review Letters. 92, 17, 178702.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Copulas for hydroclimatic analysis: A practice-oriented overview

Tootoonchi, F., Sadegh, M., Härter, Jan Olaf Mirko, Raty, O., Grabs, T. & Teutschbein, C., mar. 2022, I: Wiley Interdisciplinary Reviews: Water. 9, 2, 28 s., 1579.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Uni- and multivariate bias adjustment methods in Nordic catchments: Complexity and performance in a changing climate br

Tootoonchi, F., Härter, Jan Olaf Mirko, Todorovic, A., Raty, O., Grabs, T. & Teutschbein, C., 20 dec. 2022, I: Science of the Total Environment. 853, 18 s., 158615.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Modelling value bubbles in an attention based economy

Toftdahl Olesen, C. & Sneppen, Kim, 2 mar. 2020, I: European Physical Journal B. 93, 3, 5 s., 36.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Unraveling the Mesoscopic Character of Quantum Dots in Nanophotonics

Tighineanu, P., Sørensen, Anders Søndberg, Stobbe, S. & Lodahl, Peter, 19 jun. 2015, I: Physical Review Letters. 114, 24, 247401.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The dynamics of genetic control in the cell: the good and bad of being late

Tiana, G. & Jensen, Mogens Høgh, 28 sep. 2013, I: Philosophical Transactions. Series A : Mathematical, physical, and engineering science. 371, 1999; SI, 20120469.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Oscillations and temporal signalling in cells

Tiana, G., Krishna, S., Pigolotti, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2008, I: Physical Biology. 4, 2, s. R1-R17

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Structure of a functional amyloid protein subunit computed using sequence variation

Tian, P., Boomsma, Wouter, Wang, Y., Otzen, D., Jensen, Mogens Høgh & Lindorff-Larsen, Kresten, 2015, I: Journal of the American Chemical Society. 137, 1, s. 22–25 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A Monte Carlo study of the early steps of functional amyloid formation

Tian, P., Lindorff-Larsen, Kresten, Boomsma, Wouter, Jensen, Mogens Høgh & Otzen, D. E., 2016, I: P L o S One. 11, 1, 18 s., e0146096.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Robust estimation of diffusion-optimized ensembles for enhanced sampling

Tian, P., Jónsson, S. Æ., Ferkinghoff-Borg, J., Krivov, S. V. .., Lindorff-Larsen, Kresten, Irbäck, A. & Boomsma, Wouter, 2014, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 10, 2, s. 543–553 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

What does evolution tell us about the structure of a functional amyloid protein?

Tian, P., Boomsma, Wouter, Wang, Y., Otzen, D. E., Jensen, Mogens Høgh & Lindorff-Larsen, Kresten, 2015, I: Biophysical Journal. 108, 2, Supplement 1, s. 227a 1 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt

Rapid Curtailing of the Stringent Response by Toxin-Antitoxin Encoded mRNases

Tian, C., Roghanian, Mohammad, Jørgensen, M. G., Sneppen, Kim, Sørensen, Michael Askvad, Gerdes, K. & Mitarai, Namiko, jul. 2016, I: Journal of Bacteriology. 198, 14, s. 1918-1926

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Synchronized switching of multiple toxin-antitoxin modules by (p)ppGpp fluctuation

Tian, C., Semsey, S. & Mitarai, Namiko, 21 aug. 2017, I: Nucleic Acids Research. 45, 14, s. 8180-8189 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Bifurcation of transition paths induced by coupled bistable systems

Tian, C. & Mitarai, Namiko, 7 jun. 2016, I: The Journal of Chemical Physics. 144, 21, 215102.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Model Study of the Pressure Build-Up during Subcutaneous Injection

Thomsen, M., Hernandez Garcia, A., Mathiesen, Joachim, Poulsen, Mette Homann, Sørensen, D., Tarnow, L. & Feidenhans'l, Robert Krarup, 14 aug. 2014, I: PLoS ONE. 9, 8, e104054.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Is a constant low-entropy process at the root of glycolytic oscillations?

Thoke, H. S., Olsen, L. F., Duelund, L., Stock, R. P., Heimburg, Thomas Rainer & Bagatolli, L. A., sep. 2018, I: Journal of Biological Physics. 44, 3, s. 419-431

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Activity-induced instabilities of brain organoids

Thijssen, K., Kusters, G. L. A. & Doostmohammadi, Amin, 7 dec. 2021, I: The European Physical Journal E: Soft Matter and Biological Physics. 44, 12, 8 s., 147.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Necking and failure of a particulate gel strand: signatures of yielding on different length scales

Thijssen, Kristian, Liverpool, T. B., Royall, P. C. & Jack, R. L., 2023, I: Soft Matter. 19, 38, s. 7412-7428 17 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Active nematics with anisotropic friction: the decisive role of the flow aligning parameter

Thijssen, K., Metselaar, L., Yeomans, J. M. & Doostmohammadi, Amin, 28 feb. 2020, I: Soft Matter. 16, 8, s. 2065-2074 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Binding self-propelled topological defects in active turbulence

Thijssen, K. & Doostmohammadi, Amin, 13 okt. 2020, I: Physical Review Research. 2, 4, 6 s., 042008.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Measurement of the spin-forbidden decay rate (3s3d)¹D2¿(3s3p)³ P_2,1 in ²⁴Mg

Therkildsen, K. T., Jensen, B. B., Ryder, C. P., Malossi, N. & Thomsen, Jan Westenkær, 2009, I: Physical Review A (Atomic, Molecular and Optical Physics). 79, 3, s. 034501 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Quantitative analysis of single particle trajectories: mean maximal excursion method

Tejedor...[et al.], V., Benichou, O., Voituriez, R. & Oddershede, L. B., 7 apr. 2010, I: Biophysical Journal. 98, 7, s. 1364-1372 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Rotation-limited growth of three-dimensional body-centered-cubic crystals

Tarp, J. M. & Mathiesen, Joachim, 2015, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 92, 1, 012409.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Intermittent dislocation density fluctuations in crystal plasticity from a phase-field crystal model

Tarp, J. M., Angheluta, L., Mathiesen, Joachim & Goldenfeld, N., 31 dec. 2014, I: Physical Review Letters. 113, 26, 265503.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Fast intra-fractional image-guidance with 6D positioning correction reduces delivery uncertainty for stereotactic radiosurgery and radiotherapy

Tarnavski, N., Engelholm, S. A. & Munck af Rosenschöld, P. M., 2 aug. 2016, I: Journal of Radiosurgery and SBRT. 4, 1, s. 15-20

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The Statistical Trends of Protein Evolution: A Lesson from AlphaFold Database

Tang, Q., Ren, W., Wang, J. & Kaneko, Kunihiko, 7 okt. 2022, I: Molecular Biology and Evolution. 39, 10, 13 s., msac197.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A scaling law of multilevel evolution: how the balance between within- and among-collective evolution is determined

Takeuchi, N., Mitarai, Namiko & Kaneko, Kunihiko, 4 feb. 2022, I: Genetics. 220, 2, 9 s., 182.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Ecology and evolution in the RNA world dynamics and stability of prebiotic replicator systems

Szilágyi, A., Zachar, I., Scheuring, I., Könnyű, B. & Czárán, T., 2017, I: Life. 7, 4, 48.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

Dynamics and stability in prebiotic information integration: an RNA World model from first principles

Szilagyi, A., Konnyu, B. & Czaran, T., 9 jan. 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, 11 s., 51.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Commitment to lysogeny is preceded by a prolonged period of sensitivity to the late lytic regulator Q in bacteriophage Λ

Svenningsen, Sine Lo & Semsey, S., 2014, I: Journal of Bacteriology. 196, 20, s. 3582-3588 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Existence of log-phase Escherichia coli persisters and lasting memory of a starvation pulse

Svenningsen, Mikkel Skjoldan, Svenningsen, Sine Lo, Sørensen, Michael Askvad & Mitarai, Namiko, 2022, I: Life Science Alliance. 5, 2, 9 s., e202101076.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Birth and Resuscitation of (p)ppGpp Induced Antibiotic Tolerant Persister Cells

Svenningsen, Mikkel Skjoldan, Veress, A., Harms, A., Mitarai, Namiko & Semsey, S., 15 apr. 2019, I: Scientific Reports. 9, 13 s., 6056.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Gene Expression Changes with Minor Effects on the Population Average Have Major Effects on the Occurrence of Cells with Extreme Protein Concentrations

Svenningsen, Mikkel Skjoldan, Semsey, S. & Mitarai, Namiko, 2019, I: mSphere. 4, 1, s. 1-6 e00575-18.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Quadrupolar active stress induces exotic patterns of defect motion in compressible active nematics

Sultan, S. A., Nejad, M. R. & Doostmohammadi, Amin, 7 maj 2022, I: Soft Matter. 18, s. 4118-4126 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Chemophoresis engine: A general mechanism of ATPase-driven cargo transport

Sugawara, T., Morozov, A. V. (red.) & Kaneko, Kunihiko, 25 jul. 2022, I: PLOS Computational Biology. 18 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

SuperSegger: Robust image segmentation, analysis and lineage tracking of bacterial cells

Stylianidou, S., Brennan, C., Nissen, Silas Boye, Kuwada, N. J. & Wiggins, P. A., 11 nov. 2016, I: Molecular Microbiology. 102, 4, s. 690-700 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A kinetic mechanism for cell sorting based on local variations in cell motility

Strandkvist, C., Juul, J., Baum, B., Kabla, A. J. & Duke, T., 6 dec. 2014, I: Interface Focus. 4, 6, 20140013.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Asymmetric Segregation of Damaged Cellular Components in Spatially Structured Multicellular Organisms

Strandkvist, C., Juul, J. S. & Bendtsen, K. M., 13 feb. 2014, I: PLoS ONE. 9, 2, e87917.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

How Physical Proximity Shapes Complex Social Networks

Stopczynski, A., Pentland, A. '. & Lehmann, S., 7 dec. 2018, I: Scientific Reports. 8, 17722.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Temporal fidelity in dynamic social networks

Stopczynski, A., Sapiezynski, P., Pentland, A. '. & Jørgensen, Sune Lehmann, 7 okt. 2015, I: European Physical Journal B. Condensed Matter and Complex Systems. 88, 10

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Modeling the two-hybrid detector: Experimental bias on protien interaction networks

Stibius, K. & Sneppen, Kim, 2007, I: Biophysical Journal. 93, 7, s. 2562-2566

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Short-range growth inhibitory signals from the epithelium can drive non-stereotypic branching in the pancreas

Dahl-Jensen, Svend Bertel, Figueiredo-Larsen, E. M., Botton, A. & Sneppen, Kim, 23 feb. 2016, I: Physical Biology. 13, 1, 016007.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Reconstructing SPECT images using the Maximum Entropy Principle and including the Effect of Collimation

Steenstrup, S., 1991, I: Physica Medica. 3-4/VI, s. 273-277

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The Maximum-Entropy Method without the Positivity Constraint - Applications to the Determination of the Distance-Distribution Function in Small-Angle Scattering

Steenstrup, S. & Hansen, S., 1994, I: Journal of Applied Crystallography. 27, s. 574-580

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Cooke–Triplet tweezers: more compact, robust, and efficient optical tweezers

Stangner, T., Dahlberg, T., Svenmarker, P., Zakrisson, J., Wiklund, K., Oddershede, L. B. & Andersson, M., 26 mar. 2018, I: Optics Letters. 43, 9, s. 1990-1993

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Static and Dynamic Disorder Observed in the Phase Transition Behavior of Individual Small Unilamellar Vesicles

Stamou, Dimitrios, Bendix, Poul Martin, Wibroe, P. P. & Hatzakis, Nikos, 2011, I: Biophysical Journal. 100, 3 suppl 1, s. 35a 1 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt

Membrane Curvature Regulates the Localization of G Protein Coupled Receptors and Ras Isoforms

Stamou, Dimitrios, Rosholm, K. R., Damalas, A., Hatzakis, Nikos, Wirth, V. F., Martinez, Karen Laurence, Leijnse, Natascha, Oddershede, L. B., Bendix, Poul Martin & Pedersen, S. L., 27 jan. 2015, I: Biophysical Journal. 108, 2, s. 95a-96a

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Genome-Wide Screening of Genes Regulated by DNA Methylation in Colon Cancer Development

Spisak, S., Kalmar, A., Galamb, O., Wichmann, B., Sipos, F., Péterfia, B., Csabai, I., Kovalszky, I., Semsey, S., Tulssay, Z. & Molnár, B., 1 okt. 2012, I: P L o S One. 7, 10, s. e46215

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Stabilization of epigenetic states of CpG islands by local cooperation

Sormani, G., Härter, Jan Olaf Mirko, Lövkvist, Cecilia & Sneppen, Kim, 2016, I: Molecular BioSystems. 12, 7, s. 2142-2146

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Counting function for a sphere of anisotropic quartz

Sondergaard, N., Guhr, T., Oxborrow, M., Schaadt, K. & Ellegaard, Clive Sigurd, 1 sep. 2004, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 70, 3, 036206.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Spatiotemporal NF-kappa B dynamics encodes the position, amplitude, and duration of local immune inputs

Son, M., Frank, T., Holst-Hansen, T., Wang, A. G., Junkin, M., Kashaf, S. S., Trusina, Ala & Tay, S., 2 sep. 2022, I: Science Advances. 8, 35, 14 s., 6240.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Quantitative determination of optical trapping strength and viscoelastic moduli inside living cells

Soler, J. M., Richardson, A. C., Seyyed Reihani, S. N., Oddershede, L. B. & Berg-Sørensen, K., 1 aug. 2013, I: Physical Biology. 10, 4, 046006.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Structure and communication in complex networks

Sneppen, Kim, 2006, I: NATO Science Series : Sub Series III, Computer and sytems sciences. s. 1-28

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt

A minimal model for multiple epidemics and immunity spreading

Sneppen, Kim, Trusina, Ala, Jensen, Mogens Høgh & Bornholdt, S., 18 okt. 2010, I: PLoS ONE. 5, 10, s. e13326

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Economy of operon formation: cotranscription minimizes shortfall in protein complexes

Sneppen, Kim, Pedersen, Steen, Krishna, S., Dodd, I. B. & Semsey, S., 21 sep. 2010, I: Microbe. 1, 4, s. e00177-10

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Simplified models of biological networks

Sneppen, Kim, Krishna, S. & Semsey, S., 4 jan. 2010, I: Annual Review of Biophysics and Biomolecular Structure. 9, 39, s. 43-59 16 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A communication perspective on network topologies

Sneppen, Kim & Rosvall, M., 2006, I: Progress of Theoretical Physics. Supplement. s. 103-118

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt

Theoretical analysis of Polycomb-Trithorax systems predicts that poised chromatin is bistable and not bivalent

Sneppen, Kim & Ringrose, L., 13 maj 2019, I: Nature Communications. 10, 18 s., 2133.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Globalization in a nutshell

Sneppen, Kim & Bornholdt, S., 29 okt. 2018, I: Physical Review E. 98, 4, 6 s., 022314.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Overdispersion in COVID-19 increases the effectiveness of limiting nonrepetitive contacts for transmission control

Sneppen, Kim, Nielsen, Bjarke Frost, Taylor, R. J. & Simonsen, L., 6 apr. 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 14, 6 s., 2016623118.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Nucleosome dynamics and maintenance of epigenetic states of CpG islands

Sneppen, Kim & Dodd, I. B., 28 jun. 2016, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 93, 6, 062417.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Cooperative stabilization of the SIR complex provides robust epigenetic memory in a model of SIR silencing in Saccharomyces cerevisiae

Sneppen, Kim & Dodd, I. B., 1 apr. 2015, I: Epigenetics. 10, 4, s. 293-302

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Models of life: epigenetics, diversity and cycles

Sneppen, Kim, 1 apr. 2017, I: Reports on Progress in Physics. 80, 4, 042601.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Ultrasensitive gene regulation by positive feedback loops in nucleosome modification

Sneppen, Kim, Micheelsen, M. A. & Dodd, I. B., 15 apr. 2008, I: Molecular Systems Biology. 4, s. 182

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Mismatch repair at stop codons is directed independent of GATC methylation on the Escherichia coli chromosome

Sneppen, Kim & Semsey, S., 5 dec. 2014, I: Scientific Reports. 4, 7436.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Restriction modification systems as engines of diversity

Sneppen, Kim, Semsey, S., Seshasayee, A. S. N. & Krishna, S., 2 jun. 2015, I: Frontiers in Microbiology. 6, 528.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A simple histone code opens many paths to epigenetics

Sneppen, Kim & Dodd, I. B., 2012, I: P L o S Computational Biology. 8, 8, 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Multistability with a Metastable Mixed State

Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 5 sep. 2012, I: Physical Review Letters. 109, 10, s. 100602 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Modeling proteasome dynamics in Parkinson's disease

Sneppen, Kim, Lizana, G. L., Jensen, Mogens Høgh, Pigolotti, S. & Otzen, D., 2009, I: Physical Biology. 6, 3, s. 036005

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Hide-and-seek on complex networks

Sneppen, Kim, Trusina, Ala & Rosvall, M., mar. 2005, I: EPL. 69, 5, s. 853-859

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Measuring information networks

Sneppen, Kim, Trusina, Ala & Rosvall, M., jun. 2005, I: Pramana – Journal of Physics. 64, 6, s. 1121-1125

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Epigenetic switching with asymmetric bridging interactions

Skjegstad, L. E. J., Nickels, Jan Fabio, Sneppen, Kim & Kirkegaard, Julius Bier, 20 jun. 2023, I: Biophysical Journal. 122, 12, s. 2421-2429 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Comparative network analysis of preterm vs. full-term infant-mother interactions

Sipos, L., Mengel, A. B., Kalmar, M., Toth, I., Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh & Semsey, S., 2013, I: P L o S One. 8, 6, 10 s., e67183.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A universal power law and proportionate change process characterize the evolution of metabolic networks

Singh, S., Samal, A., Giri, V. & Krishna, S., 2007, I: European Physical Journal B. Condensed Matter and Complex Systems. 57, 1, s. 75-80

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Fractionated photothermal therapy in a murine tumor model: comparison with single dose

Simón, M., Nørregaard, K., Jørgensen, Jesper Tranekjær, Oddershede, L. B. & Kjær, Andreas, jul. 2019, I: International Journal of Nanomedicine. 14, s. 5369—5379

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Fear and its implications for stock markets

Simonsen, I., Ahlgren, P. H., Jensen, Mogens Høgh, Danangelo, R. & Sneppen, Kim, 2007, I: European Physical Journal B. Condensed Matter and Complex Systems. 57, 2, s. 153-158

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Nonideal behavior of intramolecular structure factor of dilute polymers in a theta solvent

Shimomura, K., Nakanishi, H. & Mitarai, Namiko, 2009, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 80, 5, Part 1, s. 051804

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Effect of salts, solvents and buffer on miRNA detection using DNA silver nanocluster (DNA/AgNCs) probes

Shah, P., Cho, S. K., Thulstrup, Peter Waaben, Bhang, Y., Ahn, J. C., Choi, S. W., Rørvig-Lund, A. & Yang, S. W., 2014, I: Nanotechnology. 25, 4, 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

4D Neutron Imaging of Solute Transport and Fluid Flow in Sandstone Before and After Mineral Precipitation

Shafabakhsh, P., Cordonnier, B., Pluymakers, A., Le Borgne, T., Mathiesen, Joachim, Linga, G., Hu, Y., Kaestner, A. & Renard, F., 13 mar. 2024, I: Water Resources Research. 60, 3, 19 s., e2023WR036293.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Significant improvement of optical traps by tuning standard water immersion objectives

Seyyed Reihani, S. N., Richardson, A. C. & Oddershede, L. B., 1 okt. 2011, I: Journal of Optics. 13, 10, s. 105301

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Dynamics of the recovery from sRNA-mediated gene silencing

Semsey, S., Bemjamin, J., Mitarai, Namiko, Krishna, S., Csiszovszki, Z., Sneppen, Kim & Masse, E., 2009, I: Cell Cycle. 8, 18, s. 2863-2864 1 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Mutations in Transcriptional Regulators Allow Selective Engineering of Signal Integration Logic

Semsey, S., 25 maj 2014, I: mBio (Print). 5, 3, e01171.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The effect of LacI autoregulation on the performance of the lactose utilization system in Escherichia coli

Semsey, S., Jauffred, Liselotte, Csiszovszki, Z., Erdossy, J., Steger, V., Hansen, S. & Krishna, S., 1 jul. 2013, I: Nucleic Acids Research. 41, 13, s. 6381-6390

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Signal integration in the galactose network of Escherichia coli

Semsey, S., Krishna, S., Sneppen, Kim & Adhya, S., 2007, I: Molecular Microbiology. 65, 2, s. 465-476

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A Mixed Incoherent Feed-Forward Loop Allows Conditional Regulation of Response Dynamics

Semsey, S., 12 mar. 2014, I: P L o S One. 9, 3, e91243.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Dominant negative autoregulation limits steady-state repression levels in gene networks

Semsey, S., Krishna, S., Erdossy, J., Horvath, P., Orosz, L., Sneppen, Kim & Adhya, S., 2009, I: Journal of Bacteriology. 191, 14, s. 4487-4491 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Tracking cell-nanoparticle interactions

Selhuber-Unkel, C. J. M., 1 dec. 2009, I: Journal of Biomedical Nanotechnology. 5, 6, Sp.Iss. Sl., s. 634-640 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Quantitative optical trapping of single gold nanorods

Selhuber-Unkel, C., Zins, I., Schubert, O., Soennichsen, C. & Oddershede, L. B., 2008, I: Nano Letters. 8, 9, s. 2998-3003

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Variety in intracellular diffusion during the cell cycle

Selhuber-Unkel, C., Yde, P., Berg-Sørensen, K. & Oddershede, L. B., 2009, I: Physical Biology. 6, 2, s. 025015

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Variety in intracellular diffusion during the cell cycle

Selhuber-Unkel, C., Yde, Pernille, Berg-Sorensen, K. & Oddershede, L. B., jun. 2009, I: Physical Biology. 6, 2, 9 s., 025015.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The chaperone effect in scientific publishing

Sekara, V., Deville, P., Ahnert, S. E., Barabasi, A., Sinatra, R. & Lehmann, S., 11 dec. 2018, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 115, 50, s. 12603-12607

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Fundamental structures of dynamic social networks

Sekara, V., stopczynski, A. & Lehmann, S., 6 sep. 2016, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 113, 36, s. 9977-9982 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt

The Strength of Friendship Ties in Proximity Sensor Data

Sekara, V. & Jørgensen, S. L., 7 jul. 2014, I: P L o S One. 9, 7

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Domain size and fluctuations at domain interfaces in lipid mixtures

Seeger, H., Fidorra, M. & Heimburg, Thomas Rainer, 2005, I: Biocolloids. 219, s. 85-96

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Extracting, quantifying, and comparing dynamical and biomechanical properties of living matter through single particle tracking

Scott, S., Weiss, M., Selhuber-Unkel, C., Farhangibarooji, Younes, Sabri, A., Erler, Janine, Metzler, R. & Oddershede, L. B., 22 dec. 2022, I: Physical Chemistry Chemical Physics. 2023, 25, s. 1513-1537 26 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

Conformation Regulation of the X Chromosome Inactivation Center: a model

Scialdone, A., Cataudella, I., Barbieri, M. & Nicodemi, M., 1 okt. 2011, I: P L o S Computational Biology. 7, 10, s. e1002229

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Structural Rearrangements of Pigeon Cryptochrome 4 Undergoing a Complete Redox Cycle

Schuhmann, Fabian Johannes, Ramsay, J. L., Kattnig, D. R. & Solov’yov, I. A., 3 apr. 2024, I: The Journal of Physical Chemistry B. 128, 16, s. 3844-3855 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Amplitude equation and long-rang interactions in underwater sand ripples in one dimension

Schnipper, T., Mertens, K., Ellegaard, Clive Sigurd & Bohr, T., 1 okt. 2008, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 78, 4, 047301.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Tuning of Recombinant Protein Expression in Escherichia coli by Manipulating Transcription, Translation Initiation Rates, and Incorporation of Noncanonical Amino Acids

Schlesinger, O., Chemla, Y., Heltberg, Mathias Spliid, Ozer, E., Marshal, R., Noireaux, V., Jensen, Mogens Høgh & Alfonta, L., 23 feb. 2017, I: A C S Synthetic Biology. 6, 6, s. 1076-1085

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Sand ripples under water with complex wave motion

Scheibye-Knudsen, K., Ellegaard, Clive Sigurd, Bundgaard, F. & Sams, T., 1 jul. 2005, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 72, 1, 016209.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Ultrasound resonances in a rectangular plate described by random matrices

Schaadt, K., Simon, G. & Ellegaard, Clive Sigurd, 13 jun. 2001, I: Physica Scripta. T90, s. 231-237

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Experiments on elastomechanical wave functions in chaotic plates and their statistical features

Schaadt, K., Guhr, T., Ellegaard, Clive Sigurd & Oxborrow, M., 1 sep. 2003, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 68, 3, 036205.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Chaotic sound waves in a regular billiard

Schaadt, K., Tufaile, A. & Ellegaard, Clive Sigurd, 1 feb. 2003, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 67, 2, Part 2, 026213.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Prediction of cross-fitness for adaptive evolution to different environmental conditions: Consequence of phenotypic dimensional reduction

Sato, T. U., Furusawa, C. & Kaneko, Kunihiko, 11 dec. 2023, I: Physical Review Research. 5, 4, 14 s., 043222.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Are Local Anesthetics and General Anesthetics Different?

Sasse-Middelhoff, H., Zecchi, K. & Heimburg, Thomas Rainer, 28 jan. 2014, I: Biophysical Society. Annual Meeting. Abstracts. 106, 2, s. 705A-705A

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Sputtering of Copper Crystals by Soluble and Nonsoluble Ions

Sarholt-Kristensen, L., Johansen, A., Johnson, Erik, Steenstrup, S., Chechenin, N. & Chernysh, V. S., 1991, I: Nuclear Instruments and Methods in Physics Research Section A: Accelerators, Spectrometers, Detectors and Associated Equipment. B59/60, s. 85-88

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Tracking Human Mobility Using WiFi Signals

Sapiezynski, P., Stopczynski, A., Gatej, R. & Jørgensen, Sune Lehmann, 1 jul. 2015, I: PloS one. 10, 7, 013024.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Activity Induced Nematic Order in Isotropic Liquid Crystals

Santhosh, S., Nejad, M. R., Doostmohammadi, Amin, Yeomans, J. M. & Thampi, S. P., 12 feb. 2020, I: Journal of Statistical Physics. 180, 1-6, s. 699-709 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The Value of Example Solutions in Pharmacy Education: The role of seniority and gender.

Sandelin, Albin Gustav, Hansen, H. R., Baldursdóttir, S. G., Kristensen, Anders Skov, Bak, Lasse Kristoffer, Christiansen, Frederik Voetmann & Selhuber-Unkel, C. J. M., 2011, I: Pharmacy Education. 11, 1, s. 32-37 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The fitness cost and benefit of phase-separated protein deposits

Sanchez de Groot, N., Torrent Burgas, M., Ravarani, C. N. J., Trusina, Ala, Ventura, S. & Babu, M. M., apr. 2019, I: Molecular Systems Biology. 15, 4, e8075.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Morphological Instabilities in a growing Yeast Colony: Experiment and Theory

Sams, T., Jensen, Mogens Høgh, Sneppen, Kim, Christensen, B., Ellegaard, Clive Sigurd & Thrane, U., 14 jul. 1997, I: Physical Review Letters. 79, 2, s. 313-316

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning

Low degree metabolites explain essential reactions and enhance modularity in biological networks

Samal...[et al.], A. & Krishna, S., 2006, I: BMC Bioinformatics. 7, 118

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Optical manipulation of individual strongly absorbing platinum nanoparticles

Samadi, A., Bendix, Poul Martin & Oddershede, L. B., 14 dec. 2017, I: Nanoscale. 9, 46, s. 18449-18455

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Platinum nanoparticles: a non-toxic, effective and thermally stable alternative plasmonic material for cancer therapy and bioengineering

Samadi, A., Klingberg, H., Jauffred, Liselotte, Kjær, Andreas, Bendix, Poul Martin & Oddershede, L. B., 21 maj 2018, I: Nanoscale. 10, 19, s. 9097-9107 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Optical control of strongly absorbing nanoparticles and their potential for photothermal treatment

Samadi, A., Jauffred, Liselotte, Klingberg, H., Bendix, Poul Martin & Oddershede, L. B., 1 mar. 2019, I: Proceedings of SPIE. 10935, 109351A.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt

Backscattering-based detection scheme for dark-field optical tweezers

Samadi, A., Mousavi, S. M., Hajizadeh, F. & Reihani, S. N. S., 1 jun. 2019, I: Journal of the Optical Society of America B: Optical Physics. 36, 6, s. 1587-1593

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Effect of coupling asymmetry on mean-field solutions of the direct and inverse Sherrington-Kirkpatrick model

Sakellariou, J., Roudi, Y., Mezard, M. & Hertz, John, 2012, I: Philosophical Magazine. 92, 1-3, s. 272-279 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Evolutionary shaping of low-dimensional path facilitates robust and plastic switching between phenotypes

Sakata, A. & Kaneko, Kunihiko, 26 dec. 2023, I: Physical Review Research. 5, 4, 19 s., 043296.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Nematic order condensation and topological defects in inertial active nematics

Saghatchi, R., Yildiz, M. & Doostmohammadi, Amin, 25 jul. 2022, I: Physical Review E. 106, 1, 9 s., 014705.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

QUASI-FREE ((D)OVER-RIGHT-ARROW, HE-2) DATA

SAMS, T., Ellegaard, Clive Sigurd, GAARDE, C., LARSEN, J., BOYARD, J., HENNINO, T., JOURDAIN, J., RAMSTEIN, B., ROYSTEPHAN, M., RADVANYI, P., BROCKSTEDT, A., OSTERLUND, M., ZUPRANSKI, P., GOODMAN, C., ICHIMURA, M. & DMITRIEV, V., 1 apr. 1995, I: Physical Review C (Nuclear Physics). 51, 4, s. 1945-1960

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Spontaneous flows and dynamics of full-integer topological defects in polar active matter

Rønning, J., Renaud, J., Doostmohammadi, Amin & Angheluta, L., 21 jul. 2023, I: Soft Matter. 15 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Quantification and comparison of visibility and image artifacts of a new liquid fiducial marker in a lung phantom for image-guided radiation therapy

Rydhog, J. S., Jolck, R. I., Andresen, T. L. & Munck af Rosenschöld, P. M., jun. 2015, I: Medical Physics. 42, 6, s. 2818-2826

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Effect of energy metabolism on protein motility in the bacterial outer membrane

Ryder, T. W., Xu, L., Berg-Sørensen, K., Brown, Stanley & Oddershede, L. B., 2009, I: Biophysical Journal. 97, 5, s. 1305-1312 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Effect of antibiotics and antimicrobial peptides on single protein motility

Ryder, T. W. & Oddershede, L. B., 2009, I: Current Pharmaceutical Biotechnology. 10, 5, s. 486-493 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Close, but not too close: a mesoscopic description of (a)symmetry and membrane shaping mechanisms

Thusgaard Ruhoff, Victoria, Bendix, Poul Martin & Pezeshkian, Weria, 16 jan. 2023, I: Emerging topics in life sciences. 7, 1, s. 81-93 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Strength in numbers: effect of protein crowding on the shape of cell membranes

Thusgaard Ruhoff, Victoria, Moreno Pescador, Guillermo Sergio, Pezeshkian, Weria & Bendix, Poul Martin, 31 okt. 2022, I: Biochemical Society Transactions. 50, 5, s. 1257-1267 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Biological Applications of Thermoplasmonics

Thusgaard Ruhoff, Victoria, Arastoo, Mohammadreza, Moreno Pescador, Guillermo Sergio & Bendix, Poul Martin, 6 jan. 2024, I: Nano Letters. 24, 3, s. 777-789 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Mean Field Theory for Nonequilibrium Network Reconstruction

Roudi, Y. & Hertz, John, 28 jan. 2011, I: Physical Review Letters. 106, 4, s. 048701 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Ising model for neural data: Model quality and approximate methods for extracting functional connectivity

Roudi, Y., Tyrcha, J. & Hertz, John, 2009, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 79, 5, s. 051915 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Statistical physics of pairwise probability models

Roudi, Y., Aurell, E. & Hertz, John, 2009, I: Frontiers in Computational Neuroscience. 3, 22, s. (art 22) 15 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Dynamical TAP equations for non-equilibrium Ising spin glasses

Roudi, Y. & Hertz, John, 31 mar. 2011, I: Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. 2011, 3, s. P03031 18 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Multi-neuronal activity and functional connectivity in cell assemblies

Roudi, Y., Dunn, B. & Hertz, John, 8 nov. 2014, I: Current Opinion in Neurobiology. 32, s. 38-44

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Identification of the central intermediate in the extra-embryonic to embryonic endoderm transition through single-cell transcriptomics

Rothová, M. M., Nielsen, Alexander Valentin, Proks, Martin, Wong, Yan Fung, Riveiro, A. R., Linneberg-Agerholm, Madeleine, David, E., Amit, I., Trusina, Ala & Brickman, Joshua Mark, 2022, I: Nature Cell Biology. 24, 6, s. 833-844 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Network models of phage-bacteria coevolution

Rosvall, M., Dodd, I. B., Krishna, S. & Sneppen, Kim, 2006, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 74, 6, s. 066105

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Networks and our limited information horizon

Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 2007, I: International Journal of Bifurcation and Chaos in Applied Sciences and Engineering. 17, 7, s. 2509-2515

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Reinforced communication and social navigation generate groups in model networks

Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 2009, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 79, 2, Part 2, s. 026111

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Networks and Cities: An Information Perspective

Rosvall, M., Trusina, Ala, Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 2005, I: Physical Review Letters. 94, 2, 028701.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Long-range ordered vorticity patterns in living tissue induced by cell division

Rossen, Ninna Struck, Tarp, J. M., Mathiesen, Joachim, Jensen, Mogens Høgh & Oddershede, L. B., 8 dec. 2014, I: Nature Communications. 5, 5720.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt